Войти
 Кислотная форма аниона RuBP | |
 | |
| Имена | |
|---|---|
| Название ИЮПАК 1,5-Ди- O -phosphono- D -ribulose | |
| Другие имена Рибулоза 1,5-дифосфат | |
| Идентификаторы | |
| Количество CAS | |
| 3D модель ( JSmol ) | |
| ЧЭБИ | |
| ChemSpider | |
| КЕГГ | |
| PubChem CID | |
| UNII | |
| Панель управления CompTox ( EPA) | |
ИнЧИ
| |
Улыбки
| |
| Характеристики | |
| Химическая формула | C 5 H 12 O 11 P 2 |
| Молярная масса | 310,088 г моль -1 |
| Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). | |
 N проверить ( что есть ?)  Y N | |
| Ссылки на инфобоксы | |
Рибулозо-1,5-бисфосфат ( RuBP) - это органическое вещество, которое участвует в фотосинтезе, особенно в качестве основного CO 2акцептор в растениях. Это представляет собой бесцветную анион, двойной эфир фосфорной кислоты из ketopentose ( кетон отработанный сахара с пятью углеродными атомами) называется рибулозо. Соли RuBP можно выделить, но его важнейшая биологическая функция осуществляется в растворе. RuBP встречается не только в растениях, но и во всех сферах жизни, включая археи, бактерии и эукарии.
RuBP был первоначально открыт Эндрю Бенсоном в 1951 году, когда он работал в лаборатории Мелвина Кэлвина в Калифорнийском университете в Беркли. Кальвин, который находился вдали от лаборатории во время открытия и не был указан в качестве соавтора, спорно удалил полное название молекулы из названия первоначальной статьи, определив его исключительно как «рибулоза». В то время эта молекула была известна как дифосфат рибулозы (RDP или RuDP), но префикс ди- был изменен на бис-, чтобы подчеркнуть несмежность двух фосфатных групп.
Фермент рибулозо-1,5-бисфосфаткарбоксилаза-оксигеназа ( рубиско ) катализирует реакцию между RuBP и диоксидом углерода. Продукт представляет собой крайне нестабильный шестиуглеродный промежуточный продукт, известный как 3-кето-2-карбоксиарабинитол 1,5-бисфосфат или 2'-карбокси-3-кето-D-арабинитол 1,5-бисфосфат (CKABP). Это промежуточное соединение β-кетокислоты с шестью атомами углерода гидратируется в другое промежуточное соединение с шестью атомами углерода в форме гем-диола. Затем это промежуточное соединение расщепляется на две молекулы 3-фосфоглицерата (3-PGA), который используется в ряде метаболических путей и превращается в глюкозу.
В цикле Кальвина-Бенсона, RuBP является продуктом фосфорилирования из рибулозо-5-фосфата (производимого глицеральдегид 3-фосфата ) путем АТФ.
Цикл Кальвина-Бенсона, показывающий роль рибулозо-1,5-бисфосфата. RuBP действует как ингибитор фермента рубиско, который регулирует чистую активность фиксации углерода. Когда RuBP связывается с активным центром rubisco, способность активироваться посредством карбамилирования с помощью CO 2и Mg 2+ блокируется. Функциональность рубиско-активазы включает удаление RuBP и других молекул с ингибирующими связями для повторного включения карбамилирования в активном центре.
Rubisco также катализирует RuBP кислородом ( O 2) во взаимодействии, называемом фотодыханием, процесс, который более распространен при высоких температурах. Во время фотодыхания RuBP соединяется с O 2превращаться в 3-PGA и фосфогликолевую кислоту. Как и цикл Кальвина-Бенсона, фотодыхательный путь был отмечен своей ферментативной неэффективностью, хотя такая характеристика ферментативной кинетики rubisco была оспорена. Из-за усиленного карбоксилирования RuBP и снижения оксигенации rubisco в результате повышенной концентрации CO 2в оболочке пучка скорость фотодыхания снижена в C 4растения. Точно так же фотодыхание ограничено при фотосинтезе САМ из-за кинетических задержек активации ферментов, опять же из-за соотношения углекислого газа и кислорода.
RuBP можно измерить изотопно путем преобразования14 CO 2и RuBP в глицеральдегид-3-фосфат. Затем G3P можно измерить с помощью ферментно-оптического анализа. Учитывая обилие RuBP в биологических образцах, дополнительная трудность заключается в различении определенных резервуаров субстрата, таких как RuBP, внутренний по отношению к хлоропласту, по сравнению с внешним. Один из подходов к решению этой проблемы заключается в вычитании или измерении общего RuBP в системе, удалении резервуара (например, центрифугированием), повторном измерении общего RuBP и использовании разницы для определения концентрации в данном хранилище.
