Рибофлавин киназа

редактировать
рибофлавинкиназа
Рибофлавкиназа.png Кристаллическая структура рибофлавинкиназы из Thermoplasma acidophilum.
Идентификаторы
Номер ЕС 2.7.1.26
Количество CAS 9032-82-0
Базы данных
IntEnz Просмотр IntEnz
BRENDA BRENDA запись
ExPASy Просмотр NiceZyme
КЕГГ Запись в KEGG
MetaCyc метаболический путь
ПРИАМ профиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология Amigo / QuickGO
Рибофлавин киназа
PDB 1s4m EBI.jpg кристаллическая структура связывания флавина с модельной синтетазой из термотога маритины
Идентификаторы
Символ Флавокиназа
Pfam PF01687
ИнтерПро IPR015865
SCOP2 1мрз / СФЕРА / СУПФАМ
Рибофлавин киназа
Идентификаторы
Символ Рибофлавин_киназа
Pfam PF01687
ИнтерПро IPR015865

В энзимологии, А рибофлавин киназа ( ЕС 2.7.1.26 ) представляет собой фермент, который катализирует в химическую реакцию

АТФ + рибофлавин АДФ + ФМН {\ displaystyle \ rightleftharpoons}

Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются АТФ и рибофлавин, а двумя его продуктами являются АДФ и ФМН.

Рибофлавин превращается в каталитически активные кофакторы (FAD и FMN) под действием рибофлавинкиназы ( EC 2.7.1.26 ), которая превращает его в FMN, и FAD-синтетазы ( EC 2.7.7.2 ), которая аденилирует FMN в FAD. У эукариот обычно есть два отдельных фермента, в то время как у большинства прокариот есть один бифункциональный белок, который может выполнять оба катализатора, хотя в обоих случаях случаются исключения. В то время как эукариотическая монофункциональная рибофлавинкиназа ортологична бифункциональному прокариотическому ферменту, монофункциональная FAD-синтетаза отличается от своего прокариотического аналога и, вместо этого, относится к семейству PAPS-редуктаз. Бактериальная FAD-синтетаза, которая является частью бифункционального фермента, имеет отдаленное сходство с нуклеотидилтрансферазами и, следовательно, может участвовать в реакции аденилилирования FAD-синтетаз.

Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз, а именно к тем, которые переносят фосфорсодержащие группы ( фосфотрансферазы ) со спиртовой группой в качестве акцептора. Систематическое название данного фермента класс АТФ: рибофлавин - 5'-фосфотрансфераза. Этот фермент еще называют флавокиназой. Этот фермент участвует в метаболизме рибофлавина.

Однако рибофлавинкиназы архей ( EC 2.7.1.161 ), как правило, используют CTP, а не ATP в качестве донорного нуклеотида, катализируя реакцию

CTP + рибофлавин CDP + FMN {\ displaystyle \ rightleftharpoons}

Рибофлавинкиназа также может быть выделена из других типов бактерий, все со схожей функцией, но с другим количеством аминокислот.

Состав

График гидропатии для рибофлавин киназы. График гидропатии для рибофлавин киназы.

Полное расположение ферментов можно наблюдать с помощью рентгеновской кристаллографии и ЯМР. Фермент рибофлавинкиназа, выделенный из Thermoplasma acidophilum, содержит 220 аминокислот. Структура этого фермента была определена рентгеновской кристаллографией с разрешением 2,20 Å. Его вторичная структура содержит 69 остатков (30%) в форме альфа-спирали и 60 остатков (26%) в форме бета-листа. Фермент содержит сайт связывания магния в аминокислотах 131 и 133 и сайт связывания мононуклеотида флавина в аминокислотах 188 и 195.

По состоянию на конец 2007 г. было решено 14 структур для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1N05, 1N06, 1N07, 1N08, 1NB0, 1NB9, 1P4M, 1Q9S, 2P3M, 2VBS, 2VBT, 3CTA, 2VBU и 2VBV.

Ссылки

дальнейшее чтение

  • Issoria lathonia.jpg Биологический портал
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR015865
Последняя правка сделана 2023-04-17 10:41:05
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте