RasMol ленточная диаграмма визуализация PDB тримера TRAF2: 1DOA | |
Автор (ы) | Roger A. Sayle |
---|---|
Разработчик (и) | Герберт Дж. Бернштейн |
Первоначальный выпуск | 1992; 28 лет назад (1992 г.) |
Стабильный выпуск | 2.7.5.1 / 17 июля 2009 г.; 11 лет назад (17.07.2009) |
Репозиторий | |
Написано в | C |
Операционной системе | Unix, Windows |
Платформа | IA-32, x86-64 |
Доступно в | Английский |
Тип | Молекулярная графика |
Лицензия | GPL |
Веб-сайт | www.rasmol.org |
RasMol - компьютерная программа написано для молекулярной графики визуализации, предназначенной и используемой в основном для изображения и исследования структур биологических макромолекул, таких как те, которые находятся в банке данных по белкам. Первоначально он был разработан Роджером Сейлом в начале 1990-х.
Исторически это был важный инструмент для молекулярных биологов, поскольку чрезвычайно оптимизированная программа позволяла запускать программное обеспечение на (тогда) умеренно мощных персональных компьютерах. До RasMol программное обеспечение для визуализации работало на графических рабочих станциях, которые из-за своей стоимости были менее доступны для ученых. РасМол по-прежнему играет важную роль в исследованиях в области структурной биологии и играет важную роль в образовании.
RasMol имеет сложную лицензионную историю версий. Начиная с серии версии 2.7, исходный код RasMol имеет двойную лицензию по Стандартной общественной лицензии GNU (GPL) или пользовательской лицензии RASLIC. Начиная с версии 2.7.5, GPL является единственной лицензией, действующей для двоичных дистрибутивов.
RasMol включает язык сценариев для выполнения многих функций, таких как выбор определенных белковых цепочек, изменение цвета и т. Д. Jmol и Программное обеспечение Sirius включило этот язык в свои команды. Файлы
банка данных белков (PDB) могут быть загружены для визуализации из членов Всемирного банка данных белков (wwPDB). Они были загружены исследователями, которые охарактеризовали структуру молекул обычно с помощью рентгеновской кристаллографии, ЯМР белков спектроскопии или криоэлектронной микроскопии..
Rasmol может связываться с другими программами через Tcl /Tk на платформах Unix и через динамический обмен данными (DDE) в Microsoft Windows.
с помощью программы выравнивания множественных последовательностей ответственный Класс Java можно свободно использовать в других приложениях.
На Викискладе есть материалы, связанные с RasMol. |