RIPK1

редактировать
RIPK1
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы RIPK1, RIP, RIP1, RIP-1, серин / треонинкиназа 1, взаимодействующая с рецептором, IMD57, AIEFL
Внешние идентификаторыOMIM: 603453 MGI: 108212 HomoloGene: 2820 GeneCards: RIPK1
Местоположение гена (человек)
Хромосома 6 (человека)
Chr. хромосома 6 (человек)
Хромосома 6 (человека) Местоположение генома для RIPK1 Местоположение генома для RIPK1
полоса 6p25.2начало3,063,991 bp
конец3,115,187 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE RIPK1 209941 в fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

8737

19766

Ensembl

ENSG00000137275

ENSMUSG00000021408

UniProt

Q13546

Q60855

RefSeq (мРНК)

NM_009068. NM_001359997

RefSeq (протеин)

NP_033094. NP_001346926

Местоположение (UCSC)Chr 6: 3.06 - 3,12 Мб Chr 13: 34 - 34,04 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Взаимодействующая с рецептором серин / треонин-протеинкиназа 1 (RIPK1) действует в различных клеточных путях, связанных с выживанием как клеток и смерть. Что касается гибели клеток, RIPK1 играет роль в апоптозе и некроптозе. Некоторые из путей выживания клеток, в которых участвует RIPK1, включают NF-κB, Akt и JNK.

RIPK1 - это фермент, который у человека кодируется RIPK1 ген, расположенный на хромосоме 6. Этот белок принадлежит к семейству киназ с рецепторно взаимодействующим белком (RIP), которое состоит из 7 членов, причем RIPK1 является первым членом этого семейства.

Содержание

  • 1 Структура
  • 2 Функция
    • 2.1 Роль в выживании клетки
      • 2.1.1 Передача сигналов, опосредованная рецепторами
      • 2.1.2 Активация, опосредованная генотоксическим стрессом
      • 2.1.3 Прочее
    • 2.2 Роль в клетке смерть
      • 2.2.1 Некроптоз
      • 2.2.2 Апоптоз
  • 3 Нейродегенеративные заболевания
    • 3.1 Болезнь Альцгеймера
    • 3.2 Боковой амиотрофический склероз
  • 4 Ауто-воспалительное заболевание
  • 5 Взаимодействия
  • 6 Ссылки
  • 7 Дополнительная литература
  • 8 Внешние ссылки

Структура

Белок RIPK1 состоит из 671 аминокислоты и имеет молекулярную массу около 76 кДа. Он содержит серин / треонинкиназный домен (KD) на N-конце из 300 аминокислотных остатков, домен смерти (DD) на C-конце из 112 аминокислотных остатков и центральную область между KD и DD, называемую промежуточным доменом (ID).

  • киназный домен играет разные роли в выживании клеток и важен для индукции некроптоза. RIP взаимодействует с TRAF2 через киназный домен. KD также может взаимодействовать с некростатином-1, который является аллостерическим ингибитором активности киназы RIPK1. Сверхэкспрессия RIP, лишенного киназной активности, может активировать NF-kB.
  • домен смерти гомологичен DD других рецепторов, таких как Fas, TRAILR2 (DR5), TNFR1 и TRAILR1 (DR4), поэтому он может связываться с этими рецепторами, а также с TRADD и FADD в сигнальном комплексе TNFR1. Сверхэкспрессия RIP может вызывать апоптоз и может активировать NF-kB, но сверхэкспрессия домена гибели RIP может блокировать активацию NF-kB с помощью TNF-R1.
  • Промежуточный домен важен для активации NF-kB и (RHIM) -зависимой передачи сигналов. Через промежуточный домен RIP может взаимодействовать с TRAF2, NEMO, RIPK3, ZBP1, OPTN и другими небольшими молекулами и белками, в зависимости от клеточного контекста.

.

Структурные домены RIPK1

Функция

Хотя RIPK1 в первую очередь изучался в контексте передачи сигналов TNFR, RIPK1 также активируется в ответ на различные стимулы.

Киназный домен, хотя и важен для некроптотических (запрограммированных некротических) функций, по-видимому, не имеет значения для функций, способствующих выживанию. Киназная активность RIPK1 также необходима для RIPK1-зависимого апоптоза в условиях истощения IAP1 / 2, ингибирования / истощения TAK1, истощения RIPK3 или истощения MLKL. Кроме того, протеолитический процессинг RIPk1 через как каспазу -зависимый, так и -независимый механизмы, запускает летальность, которая зависит от образования одного или нескольких конкретных C-концевых продукт (продукты) расщепления RIPk1 при стрессе.

Роль в выживаемости клеток

Было показано, что выживаемость клеток может регулироваться различными путями, опосредованными RIPK1, что в конечном итоге приводит к экспрессии NF-kB, a белковый комплекс, который, как известно, регулирует транскрипцию ДНК и, таким образом, связан с процессами выживания.

Рецептор-опосредованная передача сигналов

Схематический обзор путей к выживанию клеток, опосредованных RIPK1

Самый известный путь NF Активация -kB опосредуется рецептором смерти TNFR1, который начинается, как и в пути некроптоза, со сборки TRADD, RIPK1, TRAF2 и clAP1 в липидных рафтах плазматической мембраны (образуется комплекс I). В передаче сигналов выживания RIPK1 затем полиубиквитинируется, позволяя NEMO (фактор некроза - каппа-B эссенциальный модулятор) связываться с киназой IkB или комплексом IKK. Чтобы активировать IKK, адаптерные белки TAB2 и TAB3 привлекают TAK1 или MEKK3, которые фосфорилируют комплекс. Это приводит к фосфорилированию ингибиторов NF-kB активированным комплексом IKK, что, в свою очередь, запускает их полиубиквитинирование и заднюю деградацию в протеасоме 26S.

В результате, NF-kB теперь может мигрировать в ядро, где он будет контролировать транскрипцию ДНК, связываясь с промоторами конкретных генов. Считается, что некоторые из этих генов обладают антиапоптотическими свойствами, а также способствуют протеасомной деградации RIPK1, что приводит к саморегулирующему циклу.

Находясь в комплексе I, было также доказано, что RIPK1 играет роль в активации киназ MAP (митоген-активированный протеин ), таких как JNK, ERK и p38. В частности, JNK может быть обнаружен как в путях гибели клеток, так и в путях выживания, причем его роль в процессе гибели клеток подавляется активированным NF-kB.

Передача сигналов выживания клеток также может быть опосредована TLR-3 (толл-подобных рецепторов ) и TLR-4. Здесь RIPK1 рекрутируется на рецепторы, где он фосфорилируется и полиубиквитинируется. Это приводит к рекрутированию белков, активирующих комплекс IKK (TAK1, TAB1 и TAB2), так что в конечном итоге NF-kB теперь тоже может мигрировать в ядро. RIPK2 участвует в этой TLR-опосредованной передаче сигналов, что позволяет предположить, что может существовать регуляция выживания или гибели клеток (два возможных исхода) посредством взаимного взаимодействия между двумя членами семейства RIPK.

Опосредованный генотоксическим стрессом активация

При повреждении ДНК RIPK1 опосредует другой путь активации NF-kB, где происходят два одновременных и исключительных процесса. Создается проапоптотический комплекс, в то время как RIPK1 также опосредует взаимодействие между субъединицами PIDD, NEMO и IKK, что в конечном итоге приводит к активации комплекса IKK после взаимодействия с киназой ATM (двухцепочечный ДНК разрывает стимулированный белок). Считается, что взаимодействие между RIPK1 и PIDD через их домены смерти способствует выживанию клеток для нейтрализации этого проапоптотического комплекса.

Другие

Было замечено, что RIPK1 может также взаимодействовать с IGF-1R (рецептор инсулиноподобного фактора роста 1) для активации JNK (N-концевые киназы c-Jun), это может быть связано с передачей сигналов рецептора эпидермального фактора роста и в значительной степени экспрессируется в клетках глиобластомы, что позволяет предположить, что RIPK1 действительно участвует в выживании клеток и процессы пролиферации.

Роль в гибели клеток

Схематический обзор путей апоптоза и некроза и их конвергенции

Некроптоз

Некроптоз - это запрограммированная форма некроза, которая начинается с сборка лиганда TNF (фактора некроза опухоли) с его мембранным рецептором, TNFR (рецептор фактора некроза опухоли). После активации внутриклеточный домен TNFR начинает рекрутирование адаптера TNFR-1-ассоциированного белка домена смерти TRADD, который рекрутирует RIPK1 и две убиквитинлигазы: TRAF2 и clAP1. Этот комплекс называется комплексом TNFR-1 I.

Комплекс-I затем модифицируется IAP (ингибитором белков апоптоза) и LUBAC (комплексом сборки линейного убиквитинирования), которые образуют линейные убиквитиновые связи. Убиквитинирование комплекса-I приводит к активации NF-κB, что, в свою очередь, активирует экспрессию FLICE-подобного ингибиторного белка FLIP. Затем FLIP связывается с каспазой-8, образуя гетеродимер каспазы-8 FLIP в цитозоле, который нарушает активность каспазы-8 и предотвращает опосредованный каспазой-8 апоптоз. 39>

Сборка комплекса II-b затем начинается в цитозоле. Этот новый комплекс содержит гетеродимер FLIP каспазы-8, а также RIPK1 и RIPK3. Ингибирование каспазы в этом комплексе позволяет RIPK1 и RIPK3 аутотрансфосфорилировать друг друга, образуя другой комплекс, называемый некросомой. Некросома начинает рекрутировать MLKL (белок, подобный смешанному киназному домену), который фосфорилируется с помощью RIPK3 и немедленно перемещается в липидные рафты внутри плазматической мембраны. Это приводит к образованию пор в мембране, позволяя притоку натрия увеличиваться - и, следовательно, осмотическому давлению -, что в конечном итоге вызывает разрыв клеточной мембраны.

Апоптоз

Внешний путь апоптоза начинается с образования комплекса-I TNFR-1, который содержит TRADD, RIPK1 и две убиквитинлигазы: TRAF2 и clAP1.

<166.>В отличие от пути некроптоза, этот путь не включает ингибирование каспазы-8. Таким образом, в отсутствие функции NF-κB, FLIP не продуцируется, и поэтому активная каспаза-8 собирается с FADD, RIPK1 и RIPK3 в цитозоле, образуя так называемый комплекс IIa.

Каспаза-8 активирует Bid, белок, который связывается с митохондриальной мембраной, обеспечивая высвобождение межмембранных митохондриальных молекул, таких как цитохром c. Затем цитохром c собирается с Apaf 1 и молекулами АТФ, образуя комплекс, называемый апоптосомой. Активация каспазы 3 и 9 апоптосомой запускает протеолитический каскад, который в конечном итоге приводит к деградации органелл и белков и фрагментации ДНК, вызывая апоптотическую гибель клеток.

Нейродегенеративные заболевания

Болезнь Альцгеймера

Пациенты с болезнью Альцгеймера, нейродегенеративным заболеванием, характеризующимся когнитивным ухудшением и поведенческими заболевание, возникает хроническое воспаление головного мозга, которое приводит к атрофии нескольких областей мозга. [1]

Признаком этого воспаления является повышенное количество микроглии, типа глиальных клеток, расположенных в головном и спинном мозге. Известно, что RIPK1 появляется в больших количествах в головном мозге больных БА. Этот фермент регулирует не только некроптоз, но и воспаление клеток, и, как результат, он участвует в регуляции функций микроглии, особенно тех, которые связаны с появлением и развитием нейродегенеративных заболеваний, таких как AD.

Боковой амиотроф. Склероз

Боковой амиотрофический склероз (БАС) характеризуется дегенерацией мотонейронов, которая приводит к прогрессирующей потере подвижности. Следовательно, пациенты не могут выполнять какую-либо физическую активность из-за атрофии мышц.

Ген оптинейрина (OPTN) и его мутация, как известно, вовлечены в БАС. Когда организм теряет OPTN, начинается дисмиелинизация аксонов и ее дегенерация. Дегенерация аксонов вызывается несколькими компонентами центральной нервной системы (ЦНС), включая RIPK1 и другой фермент из семейства киназ, взаимодействующих с рецепторами, RIPK3, а также другие белки, такие как MLKL.

После того, как RIPK1, RIPK3 и MLKL внесли свой вклад в дисмиелинизацию и последующую дегенерацию аксонов, нервный импульс не может передаваться от одного нейрона к другому из-за отсутствия миелина, что приводит к к связанным с этим проблемам с подвижностью, поскольку нервный импульс не достигает своего конечного пункта назначения.

.

Аутовоспалительное заболевание

Аутовоспалительное заболевание, характеризующееся повторяющимися лихорадками и лимфаденопатией, связано с мутациями в этом гене.

Взаимодействия

Было показано, что RIPK1 взаимодействует с:

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

  • Обзор всего структурная информация, доступная в PDB для UniProt : Q13546 (взаимодействующая с рецептором серин / треонин-протеинкиназа 1) в PDBe-KB.
Последняя правка сделана 2021-06-03 04:38:10
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте