Пуромицин

редактировать
Пуромицин
Пуромицин skeletal.svg
Puromycin 3D spacefill.png
Имена
Название ИЮПАК 3'-дезокси-N, N-диметил-3 '- [(O-метил- L -тирозил) амино] аденозин
Идентификаторы
Номер CAS
3D-модель (JSmol )
ChEBI
ChEMBL
  • ChEMBL469912
ChemSpider
DrugBank
KEGG
MeSH Пуромицин
PubChem CID
UNII
Панель управления CompTox (EPA )
InChI
УЛЫБКИ
Свойства
Химическая формула C22H29N7O5
Молярная масса 471,50956
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
☒ N (что такое ?)
Ссылки в ink

Пуромицин является антибиотиком ингибитор синтеза белка, который вызывает преждевременное обрыв цепи во время трансляции.

Содержание

  • 1 Ингибитор трансляции
  • 2 Ингибитор пептидазы
  • 3 Культура клеток
  • 4 Выбор Escherichia coli
  • 5 Отбор дрожжей
  • 6 Потеря памяти у мышей
  • 7 Ссылки

Ингибирование трансляции

Пуромицин представляет собой аминонуклеозидный антибиотик, полученный из бактерия Streptomyces alboniger, которая вызывает преждевременное завершение цепи во время трансляции, происходящей в рибосома. Часть молекулы напоминает 3'-конец аминоацилированной тРНК. Он входит в сайт A и передается в растущую цепь, вызывая образование пуромицилированной растущей цепи и преждевременное высвобождение цепи. Точный механизм действия в настоящее время неизвестен, но положение 3 'содержит связь амид вместо нормальной связи сложного эфира тРНК. Это делает молекулу более устойчивой к гидролизу и останавливает рибосому.

Пуромицин селективен либо для прокариот, либо для эукариот.

Также следует отметить, что пуромицин имеет решающее значение в отображении мРНК. В этой реакции молекула пуромицина химически присоединяется к концу матрицы мРНК, которая затем транслируется в белок. Затем пуромицин может образовывать ковалентную связь с растущей цепью пептида, позволяя мРНК физически связываться с продуктом ее трансляции.

Антитела, которые распознают пуромицилированные растущие цепи, также можно использовать для очистки вновь синтезированных полипептидов и для визуализации распределения активно транслируемых рибосом с помощью иммунофлуоресценции.

ингибитора пептидазы

Пуромицин является обратимым ингибитор дипептидилпептидазы II (серинпептидаза ) и цитозольаланиламинопептидазы (металлопептидаза ). Механизм ингибирования не совсем понятен, однако пуромицин можно использовать для различения аминопептидазы M (активной) и цитозольной аланиламинопептидазы (ингибируемой пуромицином).

Культура клеток

Пуромицин используется в клеточной биологии в качестве селективного агента в системах культивирования клеток. Он токсичен для прокариотических и эукариотических клеток. Устойчивость к пуромицину обеспечивается геном pac, кодирующим пуромицин N-ацетилтрансферазу (PAC), который был обнаружен в штамме-продуценте Streptomyces. Пуромицин растворим в воде (50 мг / мл) в виде бесцветного раствора при концентрации 10 мг / мл. Пуромицин в виде раствора стабилен в течение одного года при хранении при -20 ° C. Рекомендуемая доза в качестве селекционного агента в клеточных культурах находится в диапазоне 1-10 мкг / мл, хотя она может быть токсичной для эукариотических клеток при таких низких концентрациях, как 1 мкг / мл. Пуромицин действует быстро и может убить до 99% неустойчивых клеток в течение 2 дней.

Селекция Escherichia coli

Пуромицин малоактивен в отношении E. coli. Трансформанты, устойчивые к пуромицину, отбирают в агаровой среде LB с добавлением 125 мкг / мл пуромицина. Но использование пуромицина для отбора E. coli требует точной регулировки pH, а также зависит от того, какой штамм выбран. Для беспроблемного выбора и получения оптимальных результатов возможно использование специально модифицированного пуромицина. Планшеты, содержащие пуромицин, стабильны в течение 1 месяца при хранении при 4 ° C.

Селекция дрожжей

Устойчивость к пуромицину у дрожжей также может быть обусловлена ​​экспрессией пуромицин-N-ацетил-трансферазы (pac) ген. Летальные концентрации пуромицина для штаммов Saccharomyces cerevisiae намного выше, чем для линий клеток млекопитающих. Делеция гена, кодирующего мультилекарственный эффлюксный насос Pdr5, сенсибилизирует клетки к пуромицину.

Потеря памяти у мышей

Долгосрочная синаптическая пластичность, например, необходимая для память процессов, требует морфологических изменений на уровне белка. Поскольку пуромицин подавляет синтез белка в эукариотических клетках, исследователи смогли показать, что инъекции этого препарата приводят как к кратковременной, так и к долговременной потере памяти у мышей.

Ссылки

Последняя правка сделана 2021-06-02 11:05:08
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте