Имена | |
---|---|
Название ИЮПАК 3'-дезокси-N, N-диметил-3 '- [(O-метил- L -тирозил) амино] аденозин | |
Идентификаторы | |
Номер CAS |
|
3D-модель (JSmol ) | |
ChEBI | |
ChEMBL |
|
ChemSpider | |
DrugBank | |
KEGG | |
MeSH | Пуромицин |
PubChem CID | |
UNII | |
Панель управления CompTox (EPA ) | |
InChI
| |
УЛЫБКИ
| |
Свойства | |
Химическая формула | C22H29N7O5 |
Молярная масса | 471,50956 |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). | |
N (что такое ?) | |
Ссылки в ink | |
Пуромицин является антибиотиком ингибитор синтеза белка, который вызывает преждевременное обрыв цепи во время трансляции.
Пуромицин представляет собой аминонуклеозидный антибиотик, полученный из бактерия Streptomyces alboniger, которая вызывает преждевременное завершение цепи во время трансляции, происходящей в рибосома. Часть молекулы напоминает 3'-конец аминоацилированной тРНК. Он входит в сайт A и передается в растущую цепь, вызывая образование пуромицилированной растущей цепи и преждевременное высвобождение цепи. Точный механизм действия в настоящее время неизвестен, но положение 3 'содержит связь амид вместо нормальной связи сложного эфира тРНК. Это делает молекулу более устойчивой к гидролизу и останавливает рибосому.
Пуромицин селективен либо для прокариот, либо для эукариот.
Также следует отметить, что пуромицин имеет решающее значение в отображении мРНК. В этой реакции молекула пуромицина химически присоединяется к концу матрицы мРНК, которая затем транслируется в белок. Затем пуромицин может образовывать ковалентную связь с растущей цепью пептида, позволяя мРНК физически связываться с продуктом ее трансляции.
Антитела, которые распознают пуромицилированные растущие цепи, также можно использовать для очистки вновь синтезированных полипептидов и для визуализации распределения активно транслируемых рибосом с помощью иммунофлуоресценции.
Пуромицин является обратимым ингибитор дипептидилпептидазы II (серинпептидаза ) и цитозольаланиламинопептидазы (металлопептидаза ). Механизм ингибирования не совсем понятен, однако пуромицин можно использовать для различения аминопептидазы M (активной) и цитозольной аланиламинопептидазы (ингибируемой пуромицином).
Пуромицин используется в клеточной биологии в качестве селективного агента в системах культивирования клеток. Он токсичен для прокариотических и эукариотических клеток. Устойчивость к пуромицину обеспечивается геном pac, кодирующим пуромицин N-ацетилтрансферазу (PAC), который был обнаружен в штамме-продуценте Streptomyces. Пуромицин растворим в воде (50 мг / мл) в виде бесцветного раствора при концентрации 10 мг / мл. Пуромицин в виде раствора стабилен в течение одного года при хранении при -20 ° C. Рекомендуемая доза в качестве селекционного агента в клеточных культурах находится в диапазоне 1-10 мкг / мл, хотя она может быть токсичной для эукариотических клеток при таких низких концентрациях, как 1 мкг / мл. Пуромицин действует быстро и может убить до 99% неустойчивых клеток в течение 2 дней.
Пуромицин малоактивен в отношении E. coli. Трансформанты, устойчивые к пуромицину, отбирают в агаровой среде LB с добавлением 125 мкг / мл пуромицина. Но использование пуромицина для отбора E. coli требует точной регулировки pH, а также зависит от того, какой штамм выбран. Для беспроблемного выбора и получения оптимальных результатов возможно использование специально модифицированного пуромицина. Планшеты, содержащие пуромицин, стабильны в течение 1 месяца при хранении при 4 ° C.
Устойчивость к пуромицину у дрожжей также может быть обусловлена экспрессией пуромицин-N-ацетил-трансферазы (pac) ген. Летальные концентрации пуромицина для штаммов Saccharomyces cerevisiae намного выше, чем для линий клеток млекопитающих. Делеция гена, кодирующего мультилекарственный эффлюксный насос Pdr5, сенсибилизирует клетки к пуромицину.
Долгосрочная синаптическая пластичность, например, необходимая для память процессов, требует морфологических изменений на уровне белка. Поскольку пуромицин подавляет синтез белка в эукариотических клетках, исследователи смогли показать, что инъекции этого препарата приводят как к кратковременной, так и к долговременной потере памяти у мышей.