Протеинтирозинфосфатаза

редактировать
Протеин-тирозинфосфатаза
1xm2.jpg Протеин-тирозинфосфатаза 1, тример, Человеческий
Идентификаторы
Номер EC 3.1.3.48
Номер CAS 79747-53-8
Базы данных
IntEnz Представление IntEnz
BRENDA Запись BRENDA
ExPASy Представление NiceZyme
KEGG Запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum

Белковые тирозинфосфатазы представляют собой группу ферментов которые удаляют фосфатные группы из фосфорилированных тирозиновых остатков на белках. Фосфорилирование белкового тирозина (pTyr) - это обычная посттрансляционная модификация, которая может создавать новые мотивы узнавания для взаимодействия белков и клеточной локализации, влиять на стабильность белка и регулировать активность ферментов. Как следствие, поддержание подходящего уровня фосфорилирования тирозина белка важно для многих клеточных функций. Тирозин-специфичные протеинфосфатазы (ПТФаза; EC 3.1.3.48 ) катализируют удаление фосфатной группы, присоединенной к остатку тирозина, с использованием промежуточного фермента цистеинилфосфат. Эти ферменты являются ключевыми регуляторными компонентами в путях передачи сигнала (таких как путь киназы MAP ) и контроле клеточного цикла и важны для контроля рост клеток, пролиферация, дифференцировка, трансформация и синаптическая пластичность.

Содержание
  • 1 Функции
  • 2 Классификация
    • 2.1 По механизму
      • 2.1.1 Класс I
      • 2.1.2 Класс II
      • 2.1.3 Класс III
      • 2.1.4 Класс IV
    • 2.2 По местоположению
    • 2.3 Общие элементы
  • 3 Образец экспрессии
  • 4 Ссылки
  • 5 Источники
  • 6 Внешние ссылки
Функции

Вместе с тирозинкиназами, PTP регулируют состояние фосфорилирования многих важных сигнальных молекул, таких как семейство MAP-киназы. ПТР все чаще рассматриваются как неотъемлемые компоненты каскадов передачи сигнала, несмотря на меньшее количество исследований и понимания по сравнению с тирозинкиназами.

. ПТР участвуют в регуляции многих клеточных процессов, включая, но не ограничиваясь ими, :

Классификация

По механизму

Активность PTP может быть обнаружена в четырех семействах белков.

Ссылки на все 107 членов семейства протеинтирозинфосфатаз можно найти в шаблоне внизу этой статьи.

Класс I

PTP класса I - это самая большая группа PTP, состоящая из 99 членов, которые можно подразделить на

Фосфатазы с двойной специфичностью (dTyr и dSer / dThr) белок-тирозин фосфатазы с двойной специфичностью. Фосфатазы с двойной специфичностью Ser / Thr и Tyr представляют собой группу ферментов с активностью как Ser / Thr (EC 3.1.3.16 ), так и тирозин-специфической протеинфосфатазы (EC 3.1.3.48 ), способных удалить серин / треонин или тирозин-связанную фосфатную группу из широкого диапазона фосфопротеинов, включая ряд ферментов, которые были фосфорилированы под действием киназа. Протеинфосфатазы с двойной специфичностью (DSP) регулируют передачу митогенного сигнала и контролируют клеточный цикл.

синдром ЛЕОПАРДА, синдром Нунана и метахондроматоз связаны с PTPN11.

Повышенный уровень активированного PTPN5 отрицательно влияет на синаптическая стабильность и играет роль в болезни Альцгеймера, синдроме ломкой Х-хромосомы шизофрении и болезни Паркинсона. Снижение уровней PTPN5 было связано с болезнью Хантингтона, церебральной ишемией злоупотреблением алкоголем и стрессовыми расстройствами. Вместе эти находки показывают, что только при оптимальных уровнях PTPN5 синаптическая функция не нарушается.

Класс II

НММ (низкомолекулярные) фосфатазы, или кислые фосфатазы, действуют на тирозинфосфорилированные белки, арилфосфаты с низким молекулярным весом, природные и синтетические ацил фосфаты.

PTP класса II содержат только один член, низкомолекулярную фосфотирозинфосфатазу (LMPTP ).

Класс III

Cdc25 фосфатазы (dTyr и / или dThr)

PTP класса III состоит из трех членов: CDC25 A, B и C

Класс IV

Они являются членами HAD складки и суперсемейства и включают фосфатазы, специфичные для pTyr и pSer / Thr, а также низкомолекулярные фосфатазы и другие ферменты. Подсемейство EYA (глаза отсутствуют), как полагают, является pTyr-специфичным и включает четыре члена у человека: EYA1, EYA2, EYA3 и EYA4. Этот класс имеет каталитический механизм, отличный от других трех классов.

По местоположению

В зависимости от их клеточной локализации, PTPases также классифицируются как:

Общие элементы

Все ПТФазы, кроме тех, что относятся к семейству eya, несут высококонсервативный мотив активного сайта C (X) 5R (сигнатурный мотив PTP), использует общий каталитический механизм и обладает аналогичной структурой ядра, состоящей из центрального параллельного бета-листа с фланкирующие альфа-спирали, содержащие бета-петлю-альфа-петлю, которая охватывает сигнатурный мотив PTP. Функциональное разнообразие между PTPases обеспечивается регуляторными доменами и субъединицами.

Низкомолекулярная фосфотирозинпротеинфосфатаза
PDB 1phr EBI.jpg Структура низкомолекулярной фосфотирозинпротеинфосфатазы.
Идентификаторы
СимволLMWPc
Pfam PF01451
InterPro IPR017867
SMART SM00226
SCOPe 1phr / SUPFAM
CDD cd00115
Протеин-тирозинфосфатаза
PDB 1ypt EBI.jpg Структура протеинтирозинфосфатазы Yersinia.
Идентификаторы
СимволY_фосфатаза
Pfam PF00102
Pfam clanCL0031
InterPro IPR000242
SMART SM00194
PROSITE PS50055
SCOPe 1ypt / SUPFAM
CDD cd00047
Фосфатаза с двойной специфичностью, каталитический домен
PDB 1vhr EBI.jpg Структура протеинфосфатазы с двойной специфичностью VHR.
Идентификаторы
СимволDSPc
Pfam PF00782
Pfam кланCL0031
InterPro IPR000340
PROSITE PDOC00323
SCOPe 1vhr / SUPFAM
CDD cd14498
Протеин-тирозинфосфатаза, SIW14-подобная
PDB 1xri EBI.jpg Структура предполагаемой фосфопротеинфосфатазы из Arabidopsis thaliana.
Идентификаторы
СимволY_phosphatase2
Pfam PF03162
Pfam кланCL0031
InterPro IPR004861
CDD cd14528
протеин-тирозинфосфатазоподобный, PTPLA
Идентификаторы
СимволPTPLA
Pfam PF04387
InterPro IPR007482
Паттерн экспрессии

Отдельные PTP могут экспрессироваться всеми типами клеток, или их экспрессия может быть строго тканью -специфичный. Большинство клеток экспрессируют от 30% до 60% всех PTP, однако гематопоэтические и нейрональные клетки экспрессируют большее количество PTP по сравнению с другими типами клеток. Т-клетки и В-клетки гемопоэтического происхождения экспрессируют от 60 до 70 различных PTP. Экспрессия нескольких PTPS ограничивается гемопоэтическими клетками, например, LYP, SHP1, CD45 и HePTP. Экспрессия PTPN5 ограничена мозгом. Дифференциальная экспрессия PTPN5 обнаружена во многих областях мозга, без экспрессии в мозжечке.

Ссылки
Источники
  • Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR000106
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-02 08:35:11
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте