Войти
| Пилин (бактериальная нить) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Пилин-белок из Neisseria gonorrhoeae, паразитарный бактерия, которой необходимы функциональные пили для патогенеза. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Пили | ||||||||
| Pfam | PF00114 | ||||||||
| InterPro | IPR001082 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00342 | ||||||||
| SCOPe | 1paj / SUPFAM | ||||||||
| суперсемейство OPM | 68 | ||||||||
| белок OPM | 2hil | ||||||||
| |||||||||
Пилин относится к классу волокнистых белков, которые обнаруживаются в структурах пилуса у бактерий.. Бактериальные пили используются для обмена генетическим материалом во время бактериальной конъюгации, в то время как более короткие придатки, также состоящие из пилина, называемые фимбриями, используются в качестве механизм клеточной адгезии. Хотя не все бактерии имеют пили или фимбрии, бактериальные патогены часто используют свои фимбрии для прикрепления к клеткам-хозяевам. У грамотрицательных бактерий, у которых пили более распространены, отдельные молекулы пилина связаны нековалентными белок-белковыми взаимодействиями, а грамположительными бактерии часто имеют полимеризованный пилин.
Некоторые белки пилина представляют собой α + β белки, характеризующиеся очень длинным N-концом альфа-спираль. Сборка этих пилей зависит от взаимодействий между N-концевыми спиралями отдельных мономеров. Структура пилуса изолирует спирали в центре волокна, выстилающие центральную пору, в то время как антипараллельные бета-листы занимают внешнюю часть волокна. Точный механизм сборки этих пилей из мономеров неизвестен, хотя белки шапероны были идентифицированы для некоторых типов пилина. и выделены специфические аминокислоты, необходимые для правильного образования ворсинок.
Пили в грамположительных бактериях содержат спонтанно образующиеся изопептидные связи. Эти связи обеспечивают повышенную механическую и протеолитическую стабильность белка пилина. Недавно белок пилин из Streptococcus pyogenes был разделен на два фрагмента для разработки нового молекулярного инструмента, называемого изопептаг. изопептаг представляет собой короткий пептид, который может быть присоединен к представляющему интерес белку и может связываться со своим партнером по связыванию посредством спонтанно образованной изопептидной связи. Эта новая пептидная метка может позволить ученым нацеливать и выделять интересующие их белки с помощью постоянной ковалентной связи.
Генетическая трансформация - это процесс, с помощью которого бактериальная клетка-реципиент захватывает ДНК из соседней клетки и интегрирует эту ДНК в геном реципиента посредством гомологичной рекомбинации. В Neisseria meningitidis трансформация ДНК требует наличия коротких последовательностей захвата ДНК (DUS), которые представляют собой 9-10меры, находящиеся в кодирующих областях донорской ДНК. Специфическое распознавание DUS опосредуется пилином IV типа, ComP. Пили менингококка IV типа связывают ДНК через минорный пилин ComP через электроположительную полосу, которая, как предполагается, будет экспонироваться на поверхности филамента. ComP отображает изысканные настройки привязки для выборочных DUS. Распределение DUS в геноме N. meningitidis благоприятствует определенным генам, что предполагает наличие предвзятости для генов, участвующих в поддержании и репарации генома.
| Saf-Nte_pilin | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Salmonella enterica Пилин SafA в комплексе с пептидом SafA Nte из 19 остатков (мутант f17a) | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Saf-Nte_pilin | ||||||||
| Pfam | PF09460 | ||||||||
| InterPro | IPR018569 | ||||||||
| |||||||||
N-концевое удлинение сафпилина белковый домен помогает формированию пилей с помощью сложного механизма, называемого шаперон / путь наставника. Этот белковый домен очень важен для таких бактерий, так как без образования пилей они не могут заразить хозяина. Saf представляет собой бактериальный оперон.
Этот белковый домен выполняет важную функцию в формировании пилей. Эти факторы вирулентности имеют решающее значение для адгезии клеток к хозяину и формирования биопленки при успешном заражении.
Этот домен белка состоит из соседних цепей Саф-Нте и Саф-пилин пилообразующего комплекса. Они представляют собой шаперонные / usher (CU) пили и имеют N-концевое удлинение (Nte) примерно из 10-20 аминокислот. Salmonella Saf pili, которые собираются шаперонами FGl. Структура хорошо сохранена, поскольку они содержат набор чередующихся гидрофобных остатков, которые составляют существенную часть взаимодействия субъединица-субъединица.
Механизм реакции сборки называется обменом донорной цепи DSE, который Сборка пилуса у грамотрицательных бактерий включает обмен донорной цепи механизм между C- и N-концами этого домена. С-концевая субъединица образует неполную Ig-складку, которая затем дополняется 10-18 остатками N-концом другого.
N-концевые последовательности содержат мотив чередующихся гидрофобных остатков, которые занимают от P2 до P5 связывание карманов в бороздке первой субъединицы пилуса.
