Фаговое типирование

Культура бактерий, инфицированная бактериофагами, «дыры» - это области, где бактерии были убиты вирусом. Культура имеет диаметр 10 см.

Типирование фага - это метод, используемый для обнаружения отдельных штаммов бактерий . Он используется для отслеживания источника вспышек инфекций. вирусы, поражающие бактерии, называются бактериофагами (сокращенно «фагами»), и некоторые из них могут инфицировать только один штамм бактерий. Эти фаги используются для идентификации различных штаммов бактерий в пределах одного вида.

Культуру штамма выращивают на агаре и сушат. На основании чашки Петри рисуется сетка для выделения различных областей. Инокуляция каждого квадрата сетки осуществляется разными фагами. Фаговым каплям дают высохнуть и инкубируют: чувствительные фаговые области покажут круговое просветление, где бактерии были лизированы, и это используется для дифференциации. Обнаружен на месте слияния бактерий

Ссылки

1. ^Баггесен Д.Л., Соренсен Г., Нильсен Е.М., Вегенер Х.С. Фаготипирование Salmonella Typhimurium - по-прежнему ли это полезный инструмент для надзора и расследования вспышек?. Евронаблюдение. 2010; 15 (4): 19471. PMID 20122382.
2. ^Turbadkar SD, Ghadge DP, Patil S, Chowdhary AS, Bharadwaj R (апрель 2007 г.). «Циркулирующий фаг типа Vibrio cholerae в Мумбаи». Индийский журнал медицинской микробиологии. 25 (2): 177–8. doi : 10.4103 / 0255-0857.32738. PMID 17582202.

1. ^Аламиан, Дадар С., Солимани М., Бехрозихах С., Этемади. 2019. Случай подтверждения личности Brucella abortus S99 методами фагового типирования и ПЦР.
2. ^Коули Л.А., Лоу А.С., Пикард Д., Бойнетт С.Дж., Даллман Т.Дж., Дэй М, Перри Н., Галли Д.Л., Паркхилл Дж., Дженкинс С. и др. 2018. Секвенирование вставкой транспозона выясняет участие нового гена в чувствительности и устойчивости к фагам T4 и T7 в Escherichia coli.
3. ^Kaimal S, D’souza M, Sistla S, Parija SC. 2012. Фаготипирование при пустулезном дерматите и атрофическом дерматите: играет ли роль носитель стафилококков?
4. ^Лан Р., Стивенсон Дж., Донохо К., Уорд Л., Ривз ПР. 2007. Молекулярные маркеры, способные заменить фаговое типирование для Salmonella enterica serovar typhimurium. J Microbiol Methods.
5. ^Лиенеманн Т., Кюйхкинен А., Халкилахти Дж., Хаукка К., Сиитонен А. 2015. Характеристика изолятов Salmonella Typhimurium от внутренних инфекций в Финляндии с помощью фагового типирования, тестирования чувствительности к противомикробным препаратам, PFGE и MLVA. BMC Microbiol.
6. ^Прендергаст Д.М., О'Грэйди Д., Фаннинг С., Кормикан М., Делаппе Н., Иган Дж., Маннион С., Фаннинг Дж., Гутьеррес М. 2011. Применение анализа тандемных повторов (MLVA), фаготипирования и тестирование на чувствительность к противомикробным препаратам к подтипу Salmonella enterica серовара Typhimurium, выделенному на свинофермах, скотобойнях и предприятиях по производству мяса в Ирландии. Food Microbiol.
7. ^Schürch AC, van Soolingen D. 2012. ДНК-фингерпринтинг Mycobacterium tuberculosis: от фагового типирования до полногеномного секвенирования. Заразить Genet Evol.
8. ^Шимчак П., Фогенсен Ф.К., Янзен Т. 2019. Новые изоляты бактериофагов Streptococcus thermophilus из группы 5093, идентифицированные с помощью улучшенного метода мультиплексного ПЦР-типирования. Int Dairy J.
9. ^Wiśniewska K, Szewczyk A, Piechowicz L, Bronk M, Samet A, wieć K. 2012. Использование спа и фагового типирования для характеристики клинических изолятов метициллин-устойчивого Staphylococcus aureus в Университетском клиническом центре в Гданьске, Польша. Folia Microbiol (Прага).
10. ^Сюй Д., Чжан Дж., Лю Дж., Сюй Дж., Чжоу Х., Чжан Л., Чжу Дж., Кан Б. 2014. Белок внешней мембраны OmpW является рецептором для типирования фага VP5 в биотипе холерного вибриона O1 Эль Тор. J Virol.
11. ^Зибелл К., Чуй Л., Кинг Р., Джонсон С., Бурлин П., Джонсон Р.П. 2017. Подтипирование канадских изолятов Salmonella Enteritidis с использованием тандемного повторного анализа множественных локусов переменных чисел (MLVA) отдельно и в сочетании с гель-электрофорезом в импульсном поле (PFGE) и фаготипированием. J Microbiol Methods.