Оксогуанингликозилаза

редактировать
OGG1
Белок OGG1 PDB 1ebm.png
Доступные конструкции
PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы OGG1, HMMH, HMUTM, OGH1, 8-оксогуанин ДНК-гликозилаза
Внешние идентификаторы OMIM : 601982 MGI : 1097693 HomoloGene : 1909 GeneCards : OGG1
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Entrez

4968

18294

Ансамбль

ENSG00000114026

ENSMUSG00000030271

UniProt

O15527

O08760

RefSeq (мРНК)

NM_010957

RefSeq (белок)

NP_035087

Расположение (UCSC) Chr 3: 9.75 - 9.79 Мб Chr 6: 113.33 - 113.34 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши
8-оксогуанин-ДНК-гликозилаза, N-концевой домен
PDB 2noh EBI.jpg структура каталитически неактивной q315a человеческой 8-оксогуанингликозилазы в комплексе с 8-оксогуаниновой ДНК
Идентификаторы
Условное обозначение OGG_N
Pfam PF07934
Клан пфам CL0407
ИнтерПро IPR012904
SCOP2 1ebm / SCOPe / SUPFAM

8-оксогуанин гликозилазный также известный как OGG1 является ДНК - гликозилаза фермента, который, в организме человека, кодируются OGG1 геном. Он участвует в эксцизионной пластике основания. Он находится в бактериальных, архей и эукариот видов.

СОДЕРЖАНИЕ

  • 1 Функция
  • 2 Дефицит OGG1 и увеличение 8-oxo-dG у мышей
  • 3 Эпигенетический контроль
  • 4 При раке
  • 5 Активность OGG1 или OGG в крови и рак
  • 6 взаимодействий
  • 7 Патология
  • 8 ссылки
  • 9 Дальнейшее чтение
  • 10 Внешние ссылки

Функция

OGG1 является основным ферментом, ответственным за удаление 8-оксогуанина (8-oxoG), побочного продукта мутагенного основания, который возникает в результате воздействия активных форм кислорода (АФК). OGG1 представляет собой бифункциональную гликозилазу, поскольку она способна как расщеплять гликозидную связь мутагенного поражения, так и вызывать разрыв цепи в основной цепи ДНК. Альтернативный сплайсинг С-концевой области этого гена классифицирует варианты сплайсинга на две основные группы, тип 1 и тип 2, в зависимости от последнего экзона последовательности. Альтернативные варианты сплайсинга типа 1 заканчиваются экзоном 7, а типы 2 заканчиваются экзоном 8. Один набор сплайсированных форм обозначен от 1a, 1b, 2a до 2e. Все варианты имеют общую N-концевую область. Было описано много альтернативных вариантов сплайсинга для этого гена, но полноразмерный характер каждого варианта не определен. У эукариот N-конец этого гена содержит сигнал нацеливания на митохондрии, необходимый для локализации митохондрий. Однако OGG1-1a также имеет сигнал ядерной локализации на своем C-конце, который подавляет нацеливание на митохондрии и заставляет OGG1-1a локализоваться в ядре. Основная форма OGG1, которая локализуется в митохондриях, - это OGG1-2a. Сохраняется N-концевого домена вносит свой вклад остатки в 8-оксогуанин связывающего кармана. Этот домен организован в единую копию TBP- подобной складки.

Несмотря на предполагаемую важность этого фермента, были созданы мыши, лишенные Ogg1, и было обнаружено, что они имеют нормальную продолжительность жизни, а мыши с нокаутом Ogg1 имеют более высокую вероятность развития рака, тогда как нарушение гена Mth1 одновременно подавляет развитие рака легких у мышей Ogg1 - / -. Было показано, что мыши, лишенные Ogg1, склонны к увеличению массы тела и ожирению, а также к инсулинорезистентности, вызванной диетой с высоким содержанием жиров. Существуют некоторые разногласия относительно того, действительно ли делеция Ogg1 приводит к увеличению уровней 8-oxo-dG: анализ HPLC-EC предполагает, что уровни 8-oxo-dG в ядерной ДНК до 6 раз выше, а в митохондриальной ДНК - в 20 раз. тогда как анализ Fapy-гликозилазы показывает отсутствие изменений.

Повышенный оксидантный стресс временно инактивирует OGG1, который задействует факторы транскрипции, такие как NFkB, и тем самым активирует экспрессию воспалительных генов.

Дефицит OGG1 и увеличение 8-oxo-dG у мышей

Эпителий толстой кишки мыши, не подвергающейся онкогенезу толстой кишки (A), и мыши, подвергающейся онкогенезу толстой кишки (B). Ядра клеток окрашены в темно-синий цвет для гематоксилина (для нуклеиновой кислоты) и иммуноокрашены в коричневый для 8-оксо-dG. Уровень 8-oxo-dG оценивали в ядрах клеток крипт толстой кишки по шкале от 0 до 4. У мышей, не подвергшихся онкогенезу, крипта 8-oxo-dG находилась на уровнях от 0 до 2 (панель A показывает уровень 1), в то время как мыши, прогрессирующие до опухолей толстой кишки, имели 8-oxo-dG в криптах толстой кишки на уровнях 3-4 (панель B показывает уровень 4). Онкогенез был индуцирован добавлением дезоксихолата к рациону мышей для получения уровня дезоксихолата в толстой кишке мышей, аналогичного уровню в толстой кишке людей, соблюдающих диету с высоким содержанием жиров. Изображения были сделаны с оригинальных микрофотографий.

У мышей без функционального гена OGG1 уровень 8-oxo-dG в печени примерно в 5 раз выше, чем у мышей с OGG1 дикого типа. Мыши с дефектом OGG1 также имеют повышенный риск рака. Кунисада и др. облучали мышей без функционального гена OGG1 (мыши с нокаутом OGG1) и мышей дикого типа три раза в неделю в течение сорока недель УФ-В светом в относительно низкой дозе (недостаточно, чтобы вызвать покраснение кожи). Оба типа мышей имели высокие уровни 8-оксо-dG в их эпидермальных клетках через три часа после облучения. Однако через 24 часа большая часть 8-оксо-dG отсутствовала в эпидермальных клетках мышей дикого типа, но 8-оксо-dG оставалось повышенным в эпидермальных клетках мышей с нокаутом OGG1. У облученных мышей с нокаутом OGG1 уровень опухолей кожи был более чем в два раза выше, чем у облученных мышей дикого типа, а уровень злокачественных новообразований в опухолях был выше у мышей с нокаутом OGG1 (73%), чем у мышей в дикой природе. тип мыши (50%).

Согласно обзору Valavanidis et al., Повышенные уровни 8-оксо-dG в ткани могут служить биомаркером окислительного стресса. Они также отметили, что повышенные уровни 8-оксо-dG часто обнаруживаются во время канцерогенеза.

На фигуре, показывающей примеры эпителия толстой кишки мышей, было обнаружено, что эпителий толстой кишки мыши, находящейся на нормальной диете, имеет низкий уровень 8-оксо-dG в криптах толстой кишки (панель A). Однако было обнаружено, что у мыши, которая, вероятно, подвергается онкогенезу толстой кишки (из-за добавления в ее рацион дезоксихолата ), высокий уровень 8-оксо-dG в эпителии толстой кишки (панель B). Дезоксихолат увеличивает внутриклеточную продукцию реактивного кислорода, что приводит к усилению окислительного стресса,gt; и это может привести к онкогенезу и канцерогенезу.

Эпигенетический контроль

В исследовании рака молочной железы было обнаружено, что уровень метилирования промотора OGG1 антикоррелирует с уровнем экспрессии матричной РНК OGG1. Это означает, что гиперметилирование было связано с низкой экспрессией OGG1, а гипометилирование коррелировало со сверхэкспрессией OGG1. Таким образом, экспрессия OGG1 находится под эпигенетическим контролем. Каждый рак груди с уровнями метилирования промотора OGG1 более чем на два стандартных отклонения выше или ниже нормы был связан с уменьшением выживаемости пациентов.

При раке

OGG1 является основным ферментом, ответственным за удаление 8-оксо-2'-дезоксигуанозина (8-оксо-dG). Даже когда экспрессия OGG1 нормальная, присутствие 8-oxo-dG является мутагенным, поскольку OGG1 не эффективен на 100%. Ясуи и др. исследовали судьбу 8-оксо-dG, когда это окисленное производное дезоксигуанозина было вставлено в конкретный ген в 800 клетках в культуре. После репликации клеток 8-oxo-dG был восстановлен до G в 86% клонов, что, вероятно, отражает точную эксцизионную репарацию основания OGG1 или синтез трансфузии без мутации. Трансверсии из G: C в T: A произошли в 5,9% клонов, делеции одного основания - в 2,1% и трансверсии из G: C в C: G - в 1,2%. Вместе эти мутации были наиболее распространенными, составляя 9,2% из 14% мутаций, генерируемых в месте вставки 8-oxo-dG. Среди других мутаций в 800 проанализированных клонах также были 3 более крупные делеции размером 6, 33 и 135 пар оснований. Таким образом, 8-oxo-dG может напрямую вызывать мутации, некоторые из которых могут способствовать канцерогенезу.

Если экспрессия OGG1 в клетках снижена, можно ожидать усиление мутагенеза и, следовательно, усиление канцерогенеза. В таблице ниже перечислены виды рака с пониженной экспрессией OGG1.

Таблица 1. Экспрессия OGG1 при спорадических раковых заболеваниях
Рак Выражение Форма OGG1 8-оксо-dG Метод оценки Ref.
Рак головы и шеи Недостаточное выражение ОГГ1-2а - информационная РНК
Аденокарцинома кардии желудка Недостаточное выражение цитоплазматический повысился иммуногистохимия
Астроцитома Недостаточное выражение общая ячейка OGG1 - информационная РНК
Рак пищевода 48% недоэкспрессия ядерный повысился иммуногистохимия
- 40% недоэкспрессия цитоплазма повысился иммуногистохимия

Активность OGG1 или OGG в крови и рак

Уровни метилирования OGG1 в клетках крови были измерены в проспективном исследовании 582 ветеранов США, средний возраст 72 года, и наблюдались в течение 13 лет. Высокое метилирование OGG1 в определенной области промотора было связано с повышенным риском любого рака и, в частности, с риском рака простаты.

Ферментативная активность по удалению 8-оксогуанина из ДНК ( активность OGG) была снижена в мононуклеарных клетках периферической крови (PBMC) и в парной ткани легкого у пациентов с немелкоклеточным раком легкого. Активность OGG также была снижена в PBMC пациентов с плоскоклеточным раком головы и шеи (HNSCC).

Взаимодействия

Было показано, что оксогуанингликозилаза взаимодействует с XRCC1 и PKC альфа.

Патология

  • OGG1 может быть связан с риском рака у носителей мутаций BRCA1 и BRCA2.

использованная литература

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR012904
Последняя правка сделана 2023-03-21 05:33:17
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте