домен NACHT | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | |||||||||
Символ | NACHT | ||||||||
Pfam | PF05729 | ||||||||
InterPro | IPR007111 | ||||||||
PROSITE | PS50837 | ||||||||
|
домен NACHT представляет собой эволюционно консервативный домен белка. Этот домен NTPase обнаружен в белках апоптоза , а также в тех, которые участвуют в транскрипции MHC . Его название отражает некоторые из белков, которые его содержат: NAIP (белок-ингибитор апоптоза семейства NLP ), CIITA (то есть класс C2TA или MHC II активатор транскрипции), HET-E (белок локуса несовместимости из Podospora anserina) и TEP1 (то есть TP1 или белок, связанный с теломеразой).
Домен NACHT содержит от 300 до 400 аминокислот. Это предсказанный домен нуклеозид-трифосфатазы (NTPase), который обнаружен в белках животных, грибов и бактерий. Он находится в ассоциации с другими доменами, такими как домен CARD (InterPro : IPR001315 ), домен пирина (InterPro : IPR004020 ), домен повторения HEAT (InterPro : IPR004155 ), WD40 repeat (InterPro : IPR001680 ), богатый лейцином повтор (LRR) или BIR повтор (InterPro : IPR001370 ).
Домен NACHT состоит из семи отдельных консервативных мотивов, включая АТФ / ГТФазу P-петлю, сайт связывания Mg (мотивы Уокера A и B соответственно) и еще пять специфических мотивов.Уникальные особенности домена NACHT включают преобладание "крошечных" остатков (глицин, аланин или серин) непосредственно на С-конце Mg-координирующего аспартата в мотиве Уокера B вместо второго кислого остаток преобладает в других NTPазах. Второй кислотный остаток обычно обнаруживается в NACHT-содержащих белках двумя положениями ниже по течению. Кроме того, дистальный мотив VII содержит консервативный набор полярных, ароматических и гидрофобных остатков, который не наблюдается ни в одном другом семействе NTPase.
Белки человека, содержащие этот домен, включают: