Метилмалонил-КоА эпимераза

редактировать
метилмалонил-КоА эпимераза
Метилмалонил-КоА эпимераза 1JC5.png Ленточная диаграмма метилмалонил-КоА-эпимеразы из Propionibacterium shermanii. Из PDB : 1JC5.
Идентификаторы
ЕС нет. 5.1.99.1
Базы данных
IntEnz Просмотр IntEnz
BRENDA BRENDA запись
ExPASy Просмотр NiceZyme
КЕГГ Запись в KEGG
MetaCyc метаболический путь
ПРИАМ профиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология Amigo / QuickGO
Поиск
ЧВК статьи
PubMed статьи
NCBI белки
метилмалонил-КоА эпимераза
6qh4.jpg Гомодимер метилмалонил-КоА эпимеразы (митохондриальный), человек
Идентификаторы
Условное обозначение MCEE
Ген NCBI 84693
HGNC 16732
OMIM 608419
RefSeq NM_028626
UniProt Q96PE7
Прочие данные
Номер ЕС 5.1.99.1
Locus Chr. 2 п. 13,3
Ищи
Структуры Швейцарская модель
Домены ИнтерПро

Метилмалонил-КоА-эпимераза ( EC 5.1.99.1, метилмалонил-КоА рацемаза, метилмалонил-кофермент А рацемаза, DL-метилмалонил-КоА рацемаза, 2-метил-3-оксопропаноил-КоА 2-эпимераза [неверно]) - фермент, участвующий в катаболизме жирных кислот. который кодируется у человека геном «MCEE» , расположенным на хромосоме 2. Его обычно неправильно называют «метилмалонил-КоА рацемаза». Это не рацемаза, потому что у части CoA есть 5 других стереоцентров.

СОДЕРЖАНИЕ
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Клиническое значение
  • 4 ссылки
  • 5 Внешние ссылки
Состав

«MCEE» ген расположен в 2p13 области и содержит 4 экзонов и кодирует для белка, который составляет приблизительно 18 кДа в размере и расположенный в митохондриях. Существует несколько природных вариантов аминокислотных последовательностей. Структура белка MCEE была определена с помощью рентгеновской кристаллографии с разрешением 1,8 ангстрем.

Функция

Ген MCEE кодирует фермент, который взаимно превращает D- и L-метилмалонил-КоА во время деградации аминокислот с разветвленной цепью, жирных кислот с нечетной длиной цепи и других метаболитов. С точки зрения биохимии, он катализирует реакцию, которая превращает ( S) - метилмалонил-КоА в ( R) форму. Этот фермент катализирует следующую химическую реакцию

( S) -метилмалонил-КоА ( R) -метилмалонил-КоА {\ displaystyle \ rightleftharpoons}

Метилмалонил-КоА-эпимераза играет важную роль в катаболизме жирных кислот с углеродными цепями нечетной длины. В катаболизма даже цепи насыщенных жирных кислот, что β-окисления проводящих путей разрушает жирных молекул ацил-CoA в повторяющихся последовательностей четырех реакций с образованием одного ацетил - КоА в повторяющейся последовательности. Это означает, что для каждого цикла β-окисления жирный ацил-Co-A укорачивается на два атома углерода. Если бы жирная кислота начиналась с четного числа атомов углерода, этот процесс мог бы расщепить всю насыщенную жирную кислоту на единицы ацетил-КоА. Однако, если жирная кислота начинается с нечетного числа атомов углерода, β-окисление разрушит жирный ацил-КоА до тех пор, пока не образуется трехуглеродный пропионил-КоА. Чтобы превратить его в метаболически полезный сукцинил-КоА, необходимы три реакции. Пропионил-КоА сначала карбоксилируется до ( S) -метилмалонил-КоА ферментом пропионил-КоА-карбоксилазой. Метилмалонил-КоА-эпимераза затем катализирует перегруппировку ( S) -метилмалонил-КоА в ( R) форму в реакции, в которой используется кофактор витамина B12 и резонансно-стабилизированный карбанионный интермедиат. ( R) -метилмалонил-КоА затем превращается в сукцинил-КоА в реакции, катализируемой мутазой метилмалонил-КоА.

Действуя как общее основание, фермент отщепляет протон от β-углерода ( R) -метилмалонил-КоА. Это приводит к образованию промежуточного карбаниона, в котором -углерод стабилизируется резонансом. Затем фермент действует как обычная кислота, протонируя β-углерод, что приводит к образованию ( S) -метилмалонил-КоА.

Клиническое значение

Мутации в гене MCEE вызывают дефицит метималонил-КоА-эпимеразы (MCEED), редкую аутосомно-рецессивную врожденную ошибку метаболизма аминокислот с участием аминокислот с разветвленной цепью, валина, лейцина и изолейцина. Пациенты с MCEED могут иметь опасный для жизни неонатальный метаболический ацидоз, гипераммонемию, трудности с кормлением и кому.

использованная литература
внешние ссылки
  • Биологический портал
Последняя правка сделана 2024-01-02 08:44:00
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте