метилмалонил-КоА эпимераза | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ленточная диаграмма метилмалонил-КоА-эпимеразы из Propionibacterium shermanii. Из PDB : 1JC5. | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
ЕС нет. | 5.1.99.1 | ||||||||
Базы данных | |||||||||
IntEnz | Просмотр IntEnz | ||||||||
BRENDA | BRENDA запись | ||||||||
ExPASy | Просмотр NiceZyme | ||||||||
КЕГГ | Запись в KEGG | ||||||||
MetaCyc | метаболический путь | ||||||||
ПРИАМ | профиль | ||||||||
Структуры PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Генная онтология | Amigo / QuickGO | ||||||||
|
метилмалонил-КоА эпимераза | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Гомодимер метилмалонил-КоА эпимеразы (митохондриальный), человек | |||||||
Идентификаторы | |||||||
Условное обозначение | MCEE | ||||||
Ген NCBI | 84693 | ||||||
HGNC | 16732 | ||||||
OMIM | 608419 | ||||||
RefSeq | NM_028626 | ||||||
UniProt | Q96PE7 | ||||||
Прочие данные | |||||||
Номер ЕС | 5.1.99.1 | ||||||
Locus | Chr. 2 п. 13,3 | ||||||
|
Метилмалонил-КоА-эпимераза ( EC 5.1.99.1, метилмалонил-КоА рацемаза, метилмалонил-кофермент А рацемаза, DL-метилмалонил-КоА рацемаза, 2-метил-3-оксопропаноил-КоА 2-эпимераза [неверно]) - фермент, участвующий в катаболизме жирных кислот. который кодируется у человека геном «MCEE» , расположенным на хромосоме 2. Его обычно неправильно называют «метилмалонил-КоА рацемаза». Это не рацемаза, потому что у части CoA есть 5 других стереоцентров.
«MCEE» ген расположен в 2p13 области и содержит 4 экзонов и кодирует для белка, который составляет приблизительно 18 кДа в размере и расположенный в митохондриях. Существует несколько природных вариантов аминокислотных последовательностей. Структура белка MCEE была определена с помощью рентгеновской кристаллографии с разрешением 1,8 ангстрем.
Ген MCEE кодирует фермент, который взаимно превращает D- и L-метилмалонил-КоА во время деградации аминокислот с разветвленной цепью, жирных кислот с нечетной длиной цепи и других метаболитов. С точки зрения биохимии, он катализирует реакцию, которая превращает ( S) - метилмалонил-КоА в ( R) форму. Этот фермент катализирует следующую химическую реакцию
Метилмалонил-КоА-эпимераза играет важную роль в катаболизме жирных кислот с углеродными цепями нечетной длины. В катаболизма даже цепи насыщенных жирных кислот, что β-окисления проводящих путей разрушает жирных молекул ацил-CoA в повторяющихся последовательностей четырех реакций с образованием одного ацетил - КоА в повторяющейся последовательности. Это означает, что для каждого цикла β-окисления жирный ацил-Co-A укорачивается на два атома углерода. Если бы жирная кислота начиналась с четного числа атомов углерода, этот процесс мог бы расщепить всю насыщенную жирную кислоту на единицы ацетил-КоА. Однако, если жирная кислота начинается с нечетного числа атомов углерода, β-окисление разрушит жирный ацил-КоА до тех пор, пока не образуется трехуглеродный пропионил-КоА. Чтобы превратить его в метаболически полезный сукцинил-КоА, необходимы три реакции. Пропионил-КоА сначала карбоксилируется до ( S) -метилмалонил-КоА ферментом пропионил-КоА-карбоксилазой. Метилмалонил-КоА-эпимераза затем катализирует перегруппировку ( S) -метилмалонил-КоА в ( R) форму в реакции, в которой используется кофактор витамина B12 и резонансно-стабилизированный карбанионный интермедиат. ( R) -метилмалонил-КоА затем превращается в сукцинил-КоА в реакции, катализируемой мутазой метилмалонил-КоА.
Действуя как общее основание, фермент отщепляет протон от β-углерода ( R) -метилмалонил-КоА. Это приводит к образованию промежуточного карбаниона, в котором -углерод стабилизируется резонансом. Затем фермент действует как обычная кислота, протонируя β-углерод, что приводит к образованию ( S) -метилмалонил-КоА.
Мутации в гене MCEE вызывают дефицит метималонил-КоА-эпимеразы (MCEED), редкую аутосомно-рецессивную врожденную ошибку метаболизма аминокислот с участием аминокислот с разветвленной цепью, валина, лейцина и изолейцина. Пациенты с MCEED могут иметь опасный для жизни неонатальный метаболический ацидоз, гипераммонемию, трудности с кормлением и кому.