Войти
| Учредил | 1993 г. |
|---|---|
| Область исследований | |
| Директор | Джеффри Милбрандт |
| Место расположения | Сент-Луис, штат Миссури |
| Принадлежности | Медицинский факультет Вашингтонского университета |
| Веб-сайт | genome.wustl.edu |
Расположение Института генома Макдоннелла McDonnell Genome Institute ( Институт генома Элизабет Х. и Джеймса С. Макдоннелла III ) при Вашингтонском университете в Сент-Луисе, штат Миссури, является одним из трех крупномасштабных центров секвенирования в Соединенных Штатах, финансируемых NIH. Аффилированные с Вашингтонского университета медицины и онкологического центра Alvin J. Siteman, то McDonnell Геном Институт создания, тестирования и внедрения новых подходов к изучению геномики с целью понимания человеческого здоровья и болезни, а также эволюции и биологии других организмов.
Основанный в 1993 году Институт генома Макдоннелла, ранее называвшийся Центром секвенирования генома и Институтом генома, начинал как ключевой игрок в проекте « Геном человека», внося в конечном итоге более 25 процентов готовой последовательности. После завершения рабочего проекта генома человека в 2000 г. и окончательной последовательности генома человека в 2003 г. McDonnell Genome Institute направил свои навыки секвенирования и анализа на определение геномов многих других организмов, чтобы предоставить первые эталонные последовательности для этих видов.. В 2014 году общественные деятели и давние филантропы Элизабет Х. и Джеймс С. Макдоннелл III пообещали выделить 25 миллионов долларов Институту генома, который был переименован в Институт генома Элизабет Х. и Джеймса С. Макдоннелл III в Вашингтонском университете.
В McDonnell Genome Institute работает более 300 преподавателей и сотрудников различных специальностей. Основной персонал включает:
Джеффри Милбрандт, доктор медицины, доктор философии: Доктор Милбрандт - исполнительный директор Института генома Макдоннелла.
Повторное секвенирование всего генома: Группа повторного секвенирования всего генома занимается разработкой и оптимизацией процедур отбора проб, производственного секвенирования и анализа последовательности для геномных исследований болезней человека, уделяя особое внимание раку.
Сборка De Novo: Группа сборки De Novo отвечает за сбор секвенированных фрагментов геномов различных видов и объединение их как можно более связно и точно.
Микробная геномика: Группа микробной геномики представляет ряд мероприятий, от секвенирования отдельных бактерий до исследований популяционной геномики видов микробов и анализа сложных метагеномных образцов.
Целевое повторное секвенирование: Группа целевого повторного секвенирования секвенирует определенные области геномов с использованием нескольких различных методов, включая ПЦР, а также методы гибридной селекции.
Транскриптомы: Группа Транскриптомов работает над различными аспектами секвенирования и анализа транскриптомов на основе секвенирования РНК следующего поколения.
Институт генома Макдоннелла делает все данные о последовательностях доступными для исследовательского сообщества в ожидании соответствующего анализа качества. Некоторые из этих данных являются предварительными и могут содержать ошибки и пропуски. Данные также изменяются в зависимости от наличия новых версий данных и сборок.
В соответствии с политикой публикации данных NHGRI, все пользователи должны указывать McDonnell Genome Institute в качестве источника данных.
Информационно-пропагандистский отдел Института генома Макдоннелла был создан в 2003 году в ответ на План действий Национального института исследования генома человека в отношении меньшинств. С момента своего создания Outreach проводит мероприятия, которые служат для обучения школьников и общества в целом геномике и роли, которую Институт генома Макдоннелла играет в этой области. Информационно-пропагандистская деятельность привлекла тысячи посетителей посредством туров, презентаций, научных ярмарок и различных выездных мероприятий. Департамент создал возможности в исследованиях геномики, целью которых является увеличение числа недопредставленных меньшинств, получивших докторские степени в области геномики / генетики. В рамках OGR были реализованы две программы, которые предоставляют исследовательские возможности для студентов (бакалавриат) и недавних выпускников колледжей (экстенсивное обучение).
Институт генома Макдоннелла расположен в кампусе Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе, штат Миссури, по адресу 4444 Forest Park Avenue. До него можно добраться по метро Metrolink (центральная станция Вест-Энд).
У Института генома Макдоннелла есть отдельный центр обработки данных, расположенный через дорогу на 222 Newstead Avenue. ЦОД стоимостью 20 миллионов долларов и площадью 16 000 квадратных футов был построен с полностью резервированными системами питания и охлаждения, способными вместить более 100 стоек с вычислительными системами и системами хранения высокой плотности.
Центр обработки данных McDonnell Genome Institute является первым «зеленым» зданием на территории медицинского факультета и получил золотой статус Leadership in Energy and Environment Design (LEED) от Совета по экологическому строительству США. В центре обработки данных также находится устаревшее серверное помещение площадью 1 200 кв. Футов (110 м 2) с фальшполами, резервным питанием и охлаждением.
Координаты : 38 ° 38′13,7 ″ с.ш., 90 ° 15′24,8 ″ з.д. / 38,637139 ° с.ш. 90,256889 ° з.д. / 38.637139; -90,256889
