На основе терминов геном и геномика, другими словами для описания всего наборы биологических данных, в основном наборы биомолекул, происходящие от одного организма, были придуманы с суффиксами -ome и - omics. Некоторые из этих терминов связаны друг с другом иерархически. Например, геном содержит ORFeome, который дает начало транскриптому, который транслируется в протеом. Другие термины перекрываются и относятся к структуре и / или функции подмножества белков (например, glycome, kinome ).
Омиколог - это ученый, изучающий омеомику, каталогизирующий все подполя «омиков».
Omics.org - это Wiki, которая собирает и перечисляет в алфавитном порядке все известные «омы» и «омики». «
-ome | Область исследования. (-omics) | Сборник | Родительская тема | Примечания | ||
---|---|---|---|---|---|---|
Протеомика аллергенов | ||||||
Библиом | Научно-библиографические данные | |||||
Медицина | Интервенционные исследования на людях данные из регистров клинических испытаний расширены за счет исследования результаты и ссылки на полученные публикации | |||||
Connectome | Connectomics | Структурные и функциональные мозговые связи в различных пространственно-временных масштабах | Neuroscience | |||
Cytome | Cytomics | Cellular системы организма | Цитология | |||
сайты | ||||||
Эмбриом | Эмбриомика | Клеточные линии эмбриональных клеток, экспрессируемые гены и антигены, присутствующие в процессе развития | Эмбриология | |||
Envirome | Enviromics | Факторы окружающей среды, связанные с генами (envirome) | ||||
Эпигеном | Эпигеномика | Эпигенетические модификации | Молекулярная генетика | Эпигеномика - это исследование полного набора эпигенетических модификаций генетического материала клетки, известных под общим названием эпигеном | ||
Экспосома (2005) | Индивидуальное воздействие окружающей среды, в том числе в пренатальной среде | Молекулярная генетика | Предлагаемый термин и область исследования болезнетворных эффектов факторов окружающей среды (компонент «воспитание » в «природа vs. воспитание »). | |||
Exposome (2009) | Composite производственные воздействия и | Безопасность и гигиена труда | Предложившие этот термин знали о предыдущем термине, использованном выше, но предложили применить этот термин к новой области. | |||
Экзом | Экзоны в геном | Molecular Genetics | ||||
Foodome | Foodomics | Food и Nutrition вопросы, связанные с биоактивностью, качеством, безопасностью и отслеживаемостью пищевых продуктов посредством применения и интеграции передовых технологий omics для улучшения самочувствия, здоровья и уверенности потребителей. | Питание | Термин был впервые определен в 2009 году | ||
Геном | Геномика. (Классическая генетика ) | Гены. (Последовательности ДНК / Хромосомы ) | Генетика | «Геном» относится к набору всех генов в организме. Однако термин «геном» был придуман за несколько десятилетий до того, как было обнаружено, что большая часть ДНК является «некодирующей » и не является частью гена; таким образом, «геном» первоначально относился ко всей коллекции ДНК в организме. Сегодня используются оба определения, в зависимости от контекста. | ||
Glycome | Glycomics | Glycans | Glycobiology | |||
Hologenome | Hologenomics | Геномы членов сообщества (т. Е. голобионтов ) | Метагеномика | |||
Интерфером | Интерферомика | Интерфероны | Иммунология | Также одноименная база данных. [3] | ||
Интерактом | Интерактомика | Все взаимодействия | Термин «интерактомика» обычно не используется. Вместо этого интерактомы считаются предметом изучения системной биологии. | |||
Иономики | Молекулярной биологии | |||||
Кинома | Киназ | Молекулярной биологии | Белки, которые добавляют фосфатную группу | |||
Липидом | Липидомика | Липиды | Биохимия | |||
Механом | Механические системы внутри организма | |||||
Метаболом | Метаболомика | Метаболиты | Все продукты биологической реакции (включая промежуточные продукты) | |||
Метагеном | Метагеномика | Генетический материал, обнаруженный в образце окружающей среды | Молекулярная биология | Генетический материал задан Предполагается, что они содержат ДНК нескольких организмов и, следовательно, несколько геномов, поэтому добавлен префикс мета-. | ||
Металлом | Металломика | Металлы и металлоиды | ||||
Микробиом | микробиомика | Сбор микроорганизмов в другом организме, таком как животное | Микробиология | |||
Протеомика | Разработано Pardo et al., 2012. [4] | |||||
ORFeome | Открытые рамки считывания (ORF) | Молекулярная генетика | ||||
Органомика | Взаимодействие с органами | Передача сигналов в клетках / Передача сигналов в клетках и инженерия тканей | Изучение перекрестных помех между органами с использованием физиологически релевантные модели in-vitro | |||
Вторичные метаболиты | Биохимия | Придуманы Марком Мартином и введены Джулианом Дэвисом в 2008 году, со ссылкой на латинское parvus для «маленького» и описанием « огромный микробный мир маленьких (секретируемых) молекул большого структурного разнообразия ". См. Также | ||||
Фармакогенетика | Фармакогенетика | SNP и их влияние на фармакокинетику и фармакодинамику | Фармакогеномика. Геномика | |||
Фармакогеномика | Эффект изменений в геноме по фармакологии | Фармакогенетика. Геномика | ||||
Феном | Феномика | Фенотипы | Генетика | |||
Физиома | Физиомика | Физиология организма | ||||
Фитохимические вещества | Термин был введен дель Кастильо и др., 2013, Food Research International, [5]. Фитохимия - это комплексная концепция, направленная на расширение знаний о биоактивности фитохимических веществ, которая приобретает все большее значение в сельском хозяйстве, пищевой промышленности, медицине и косметике | |||||
Протеом | Протеомика | Белки | Молекулярная биология | |||
Регулом | Факторы транскрипции и другие молекулы, участвующие в регуляции экспрессии генов | Молекулярная биология | ||||
Исследования Некоторые | Области исследований, охватываемые отдельным исследователем или организацией | Исследования | Созданы Иван Эрилл на встрече EBM 2011 г. | |||
Secretome | Secretomics | Секретные белки | Proteomics | Подмножество протеома, состоящее из белков, активно экспортируемых из клеток. 229>Влияние на овладение языком | Разработано в рамках проекта Human Speechome Project | |
Синтетом | Набор искусственных генов в организме | |||||
Транскриптом | Транскриптомика | Все молекулы РНК, включая мРНК, рРНК, тРНК и другие нкРНК | Molecular Bio logy | |||
Топоном | Топономика | Структура клеток и тканей | Молекулярная биология | |||
Волатилом | полная коллекция летучих метаболитов | Биомаркеры |
Для для наглядности некоторые темы указаны более одного раза.