Доступен ряд онлайновых нейробиологических баз данных, которые предоставляют информацию относительно экспрессии генов, нейронов, макроскопических структура мозга и неврологические или психиатрические расстройства. Некоторые базы данных содержат описательные и числовые данные, некоторые - о функциях мозга, другие предлагают доступ к «необработанным» данным визуализации, таким как посмертные срезы мозга или 3D МРТ и фМРТ <38.>изображения. Некоторые фокусируются на человеческом мозге, другие - на нечеловеческом.
Поскольку количество баз данных, которые стремятся распространить информацию о структуре, развитии и функциях мозга, растет, растет потребность в сопоставлении самих этих ресурсов. В результате теперь существуют базы данных нейробиологии, некоторые из которых достигают более 3000 записей.
Имя | Описание | Организм | Уровень (ген, нейрон, макроскопический) | Данные (МРТ, фМРТ, изображения, описательные, числовые) | Нарушение | Зарегистрироваться для просмотра данных? | Ссылка. | |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Атлас мозга Аллена | Атлас, окрашенные срезы головного мозга, показывающие развитие и экспрессию генов | Мышь, человек | Макроскопия, ген | Изображения | Здоровый | Нет | ||
Инициатива по нейровизуализации болезни Альцгеймера (ADNI) | Структурные МРТ-изображения | Человек | Макроскопические | Наборы данных МРТ | Здоровые люди и болезнь Альцгеймера | Да | ||
Большой мозг | Трехмерная реконструкция полного мозга из окрашенных клеток-тел гистологических срезов с изотропным разрешением 20 микрон | Человек | Микроскопические | Изображения | Здоровые | Нет | ||
Данные фМРТ и МРТ BIRN | ФМРТ, МРТ сканирование и атласы для мозга человека и мыши | Мышь, человек | Многоуровневый: области мозга, соединения, нейроны, паттерны экспрессии генов | наборы данных МРТ, наборы данных фМРТ | Здоровый, Пожилой | Нет | ||
База данных нейровизуализации биполярного расстройства | Мета-анализ и база данных исследований МРТ | Человек | Макроскопический | Описательные числовые данные | Биполярное расстройство | № | ||
Система управления архитектурой мозга | Интернет-ресурс с информацией о нейронных схемах | Крыса, мышь, человек | Многоуровневые: области мозга, связи, нейроны, паттерны экспрессии генов | Описательные, числовые | Здоровые | Нет | ||
Облако мозга | Экспрессия генов в Префронтальная кора человека | Человек | Паттерны экспрессии генов | Описательные, числовые | Здоровые | Нет | ||
Brain-Development.org | Структурные изображения МРТ и атласы | Человек | Макроскопические | Наборы данных МРТ | Плоды, здоровые и недоношенные новорожденные | Да | ||
Braingraph.org | Брейнграфы, вычисленные на основе данных Human Connectome Project | Human | Макроскопические, до 1015 узлов | ориентированные и неориентированные графики в анатомически аннотированном формате GraphML | Healthy | Нет | ||
Braininfo | Атлас, схематический атлас Макака a fascicularis | Macaque | Macroscopic | Схематические изображения | Healthy | Да | ||
Платформа интерфейса мозговой машины | Различные типы связанных данных к интерфейсу мозг-машина | Человек, Обезьяна | Макроскопические, Нейронные | Изображения, Числовые | Здоровые | Нет | ||
BrainMap. org | База данных координат фМРТ | Человек | Макроскопический | Описательный | Здоровый | Да | ||
BrainMaps | Атлас, окрашенные с высоким разрешением срезы головного мозга | человека, приматов и неприматов (всего 14 видов) | нейронных и макроскопических | Изображения | Здоров | Нет | ||
Brain / MINDS Dataportal | Атлас, МРТ in-vivo и ex-vivo, записи ЭКоГ | Обыкновенная мартышка, человек | Макроскопические | Изображения | Здоровые | Нет | ||
База данных Бреде | База данных координат фМРТ и ПЭТ | Человек | Макроскопический | Описательный | Здоровый | Нет | ||
Brainmuseum.org / MSU Brai n Банк биоразнообразия | Атлас, окрашенные срезы мозга и изображения МРТ | Человек и 62 других вида | Макроскопические | Изображения | Здоровые | Нет | ||
Брейномика / Локализатор | ФМРТ и МРТ, поведенческие данные | Человек | Макроскопические | Изображения, числовые | Здоровый | Нет | ||
Атлас подкорковых тканей Caltech | МРТ | Человек | Макроскопический | МРТ | Здоров | Нет | ||
Архив изображений рака | МРТ, КТ и ПЭТ-изображения онкологических больных с подтверждающими клиническими данными (во многих случаях) | Макроскопические | изображения человека, описательные, числовые | Рак | № | |||
База данных транскриптомов развития мозжечка | Атлас, окрашенные срезы из головного мозга мышей, демонстрирующих развитие мозжечка и экспрессию генов | Мышь | Макроскопические, Ген | Изображения | Здоровые | Нет | ||
Совместные Исследования в области вычислительной нейробиологии CRCNS.org | Многие k индексы результатов нейробиологии, которые имеют отношение к моделированию | Человек и несколько других видов | Многоуровневый | Спайковые поезда, LFP, MUA, MRI | Здоровые | Да | ||
База данных для охвата экспериментов и моделей (DREAM) | Получение данных (поведенческие, обобщение, адаптация, обучение, спайк, фМРТ, неопределенность) | Человек и обезьяна | Макроскопический | кинематический, спайк, фМРТ | здоровый | Да | ||
наборы данных фМРТ из опубликованных исследований | человек | Макроскопические | наборы данных фМРТ | Здоровые | Да | |||
Проект GLIMPS (визуализация глюкозы при паркинсонических синдромах) | Международный FDG-PET сканировать базу данных нейродегенеративных заболеваний | человека | Макроскопические | FDG-PET изображения | болезнь Паркинсона (PD), болезнь Альцгеймера (AD), множественная системная атрофия (MSA), прогрессирующий надъядерный паралич (PSP) и т. Д. | Да | ||
Портал гиппокампа | Схемотехника, нейронные типы, электро физиология | Взрослый человек | Нейрон | Морфология клеток, электрофизиология, состав областей, связь | Здоровые | Да | ||
Международная эпилепсия База данных электрофизиологии (IEEG.org) | ЭЭГ, метаданные, изображения, аннотации данных | Модели эпилепсии у людей и животных | ЭЭГ, локальные поля, микро-ЭКоГ | Электрофизиология | Нездоровые, несколько здоровых | Да | ||
Международная инициатива по обмену данными нейровизуализации (INDI) | Данные функциональной связи из многих разных групп | Беспозвоночные (всего 47 видов) | Макроскопические | Функциональные связи | Здоровые, нездоровые | Да | ||
Мозг беспозвоночных Платформа | Фотографии вскрытия нервной системы беспозвоночных | Беспозвоночные (всего 47 видов) | Макроскопические | Фото | Здоровые | Нет | ||
Атлас JuBrain | Вероятностные цитоархитектонические трехмерные карты человеческого мозга | Человеческий | Мезоскоп ic | Структурный | Здоровый | Нет | ||
Атлас Кимата | Функциональный атлас коры головного мозга человека | Человек | Макроскопические | Функциональные | Здоровые | Нет | ||
База данных нейровизуализации большого депрессивного расстройства | Мета-анализ и база данных МРТ-исследований | Человек | Макроскопическое | Описательное, числовое | Большое депрессивное расстройство | Нет | ||
Атлас генов мартышки | Экспрессия генов во всем мозге обыкновенной мартышки | Обыкновенная мартышка | Макроскопические, генные | изображения | Здоровые | Нет | ||
Библиотека мозга мыши | Атлас, окрашенные срезы из мозга мыши | Мышь | Макроскопические | Изображения | Здоровые | Нет | ||
Объемные наборы данных, атласы и исследования коннектомики | Несколько | Мультимасштабных | изображений (3D, 4D) | Различные | Нет | |||
Neuroelectro.org | Электрофизиология нейронов | Человек, другие | Нейрон | Собственно электрофизиология связи и данные | Здоровый | Нет | ||
Neuromorpho.org | 3D-модели реальных нейронов | Человека, крысы, мышь, обезьяна, другие | Neuron | Изображения и трехмерные данные | Здоровые | Нет | ||
Neuromorphometrics.com | МРТ-сканирование мозга с ручной маркировкой | Человек | Макроскопическое | Т1-взвешенное МРТ, помеченные объемы | Здоровые | Нет | ||
NeuronDB | База данных свойств и классификации нейронов | Человеческий | Нейрон | Описательный | Здоровый | Нет | ||
Совместная лаборатория по инструментам и ресурсам нейровизуализации (NITRC) | Отмеченное наградами бесплатное сотрудничество с более чем 1000 программными инструментами нейроинформатики, наборами данных для визуализации и ресурсами сообщества, включая форумы и мероприятия. | Человек, мышь, крыса, прочее | Микроскопические, макроскопические | Наборы данных | Здоровые и больные | Нет | ||
Открытый доступ Серия исследований изображений (OASIS) | Структурные МРТ-изображения | Человека | Макроскопические | Наборы данных МРТ | Здоровые и болезнь Альцгеймера Болезнь | Да | ||
OpenNeuro | Большой и разнообразный набор исходных данных из различных исследований, распространяемых по разрешительным лицензиям (CC0 и CC-BY ). Все наборы данных отформатированы в соответствии с одним и тем же форматом (Структура данных изображений мозга ), и к ним можно получить доступ через Amazon S3. | Человек | Макроскопический | Функциональный, структурная, диффузная МРТ и магнитоэнцефалография наборы данных | Здоровые и различные заболевания | Нет | ||
Открытый архив МЭГ (OMEGA) | Магнитоэнцефалография, структурная МРТ наборы данных и демографические данные | Человек | Макроскопический | МЭГ, наборы данных МРТ T1, демографические данные | Здоровый, СДВГ, Черепно-мозговая травма | Да | ||
Репозиторий PAIN | Структурные, диффузионные и функциональные наборы данных МРТ | Человек | Человеческий макроскопический | Наборы данных МРТ и метаданные | Здоровые и болезненные состояния | Да | ||
Атлас мозга свиньи | Атлас мозга свиньи - это трехмерный усредненный мозг на основе МРТ и атлас неонатального поросенка (Sus scrofa). | Свинья (Sus scrofa) | Макроскопическая | Структурная МРТ | Здоровая | Да | ||
База данных типов клеток приматов | PrimateDatabase.com, общедоступный веб-архив записей внутриклеточных патч-зажимов и высокодетальных трехмерных цифровых реконструкций морфологии нейронов. | Примат, не являющийся человеком, и человек | Нейрон | Электрофизиология, морфология и трехмерные реконструкции | Здоровые | Нет | ||
SchizConnect | SchizConnect - это открытая общедоступная виртуальная база данных с функцией поиска и загрузки для изображений нейровизуализации (МРТ) шизофрении и связанных данных. | Человек | Макроскопический | Наборы структурных, диффузных и функциональных данных МРТ, когнитивные и клинические оценки | Шизофрения (+ братья и сестры), биполярное расстройство, контроль (+ братьев и сестер) | Да | ||
База данных ЭЭГ храма | Более 30 000 клинических ЭЭГ и сопутствующие отчеты неврологов | Человек | Макроскопическая | ЭЭГ | Здоровые и различные заболевания | Да | ||
Набор данных МРТ всего головного мозга со сверхвысоким разрешением T1-взвешенных | T1-взвешенных данных МРТ, полученных с использованием предполагаемой коррекции движения со сверхвысоким изотропным разрешением 250 мкм. | Человек | Мезоскопический | Набор структурных данных МРТ, включая данные сканера от исходных до обработанных | Здоровый | Нет | ||
UNC-Wisconsin Neurodevelopment База данных Rhesus MRI | МРТ-изображения со структурным и диффузионным взвешиванием в Native и Atlas Space | Macaque | Макроскопические | Наборы данных МРТ | Здоровые | Нет | ||
Атлас всего мозга | Атлас, структурные МРТ-изображения и ПЭТ-изображения | Человек | Макроскопические | Изображения | Здоровые и разнообразные заболевания | Нет | ||
NeuroVault | Статистические карты без пороговых значений из исследований МРТ и ПЭТ. | Человек | Макроскопические | Изображения | Здоровые и различные заболевания | Нет |
Имя | Описание | Организм | Уровень (ген, нейрон, макроскопический) | Данные (МРТ, фМРТ, изображения, описательные, числовые) | Беспорядок | Зарегистрироваться для просмотра данных? | Ссылка. |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Neuroscience Information Framework | Мета-база данных релевантных для нейробиологии данных, включающая более 100 баз данных. | Человек, мышь, крыса, червь | Микроскопические, макроскопические | Наборы данных | Здоровые и больные | Нет |
Neuroscience feed at RightRelevance.