Войти
| Кари Стефанссон | |
|---|---|
 Основатель и генеральный директор deCODE Genetics | |
| Родился | (1949-04-06) 6 апреля 1949 г. (71 год). Рейкьявик, Исландия |
| Национальность | Исландский |
| Alma mater | Университет Исландии |
| Известен по | популяционной генетике |
| Супруг (и) | Валгердур Олафсдоттир (1970-настоящее время) |
| Дети | 3 |
| Награды | Избран в Национальную академию наук; Премия Уильяма Аллана; Премия Андерса Яре; Медаль Ганса Кребса |
| Веб-сайт | www.decode.com |
Кари Стефанссон (или Кари Стефанссон ; родился 6 апреля 1949 года) - исландский гражданин невролог, основатель и генеральный директор биофармацевтической компании deCODE genetics в Рейкьявике. В Исландии он первым применил популяционную генетику для понимания вариаций в последовательности генома человека. Его работа была сосредоточена на том, как генерируется геномное разнообразие, и на открытии вариантов последовательностей, влияющих на восприимчивость к распространенным заболеваниям. Этот популяционный подход послужил моделью для национальных геномных проектов по всему миру и способствовал реализации нескольких аспектов точной медицины.
Стефанссон родился в 1949 году в Рейкьявике, Исландии. Он был вторым младшим из пяти детей Сольвейга Халлдорсдоттира и [ ], известного радиоведущего, писателя и члена парламента от демократов-социалистов. Он закончил свое среднее образование в младшем колледже Рейкьявика и получил степень M.D. в 1976 году и Dr. med. в 1986 году из Университета Исландии.
После стажировки в Национальной больнице Исландии он поступил в Университет Чикаго, чтобы работать под руководством Барри Арнасона (по совпадению канадец исландского происхождения ). Там он закончил ординатуры по направлениям неврология и невропатология, а в 1983 году поступил на факультет. В 1993 году он был назначен профессором неврологии, невропатологии и неврологии в Гарвардском университете и начальником отделения невропатологии бостонской больницы Бет Исраэль. Находясь в Бостоне, он и его коллега Джеффри Гулчер решили вернуться в Исландию, чтобы провести генетические исследования, чтобы определить риск рассеянного склероза. Стефанссон оставил обе должности в 1997 году, основав deCODE и вернувшись в Рейкьявик. С 2010 года он является профессором медицины Исландского университета. Он сертифицированный невролог и невропатолог в Исландии и США.
Академическая работа Стефанссона была сосредоточена на нейродегенеративных заболеваниях. Подход к исследованию, основанный на биологии белков, включал попытку составить карту сложных процессов с использованием ограниченных образцов, в основном тканей мозга умерших пациентов. Несмотря на постоянные публикации, Стефанссон был разочарован темпами прогресса и часто не знал, участвуют ли описываемые им белки в возникновении болезни или в результате процесса болезни. Он и его коллеги поставили под сомнение даже общепринятое определение рассеянного склероза (РС) как аутоиммунного заболевания.
Когда его взяли из Чикаго в Гарвард, Стефанссон, как и многие другие ученые-медики, начал думать, что геном может стать лучшей отправной точкой для таких исследований, чем биология. Гены кодируют белки, поэтому выявление генов и конкретных генетических вариаций, которые пациенты имеют тенденцию разделять чаще, чем здоровые люди, должно обеспечить точку опоры в патогенезе болезни. Поступая так, они могли указать на биологически релевантные мишени для новых лекарств и прогностической диагностики.
Однако в середине 1990-х инструменты для считывания последовательности генома были примитивными. Данных было мало, и их было дорого получать, и на начальном этапе Human Genome Project основное внимание уделялось разработке более эффективных методов. Между тем, одним из решений было использование генетики - того, как геном смешивается и передается от одного поколения к другому - как средство получения дополнительной информации из имеющихся данных. Братья и сестры разделяют половину своих геномов; но кузены - один восьмой, троюродные братья - один тридцать второй и т. д. Таким образом, изучение пациентов, связанных расширенными генеалогиями, должно позволить более эффективно находить унаследованный компонент любого фенотипа или признака, даже используя маркеры с низким разрешением.
Важный вопрос заключался в том, можно ли и где найти такие расширенные генеалогии. Многим ведущим генетикам не приходило в голову спрашивать об общих заболеваниях. Будучи исландцем, Стефанссон не понаслышке знал о страсти страны к генеалогии, вырос и прошел обучение в национальной системе здравоохранения. В 1995 году он и его коллега и бывший аспирант Джеффри Гулчер решили поехать в Исландию, чтобы изучать рассеянный склероз. Работая с врачами национальной системы здравоохранения, они выявили сотни пациентов и родственников, которые сдали им образцы крови для начала исследования. Как исландцы, они были почти по определению родственниками, и благодаря общенациональному генеалогическому развлечению эти отношения могли быть установлены.
Когда Стефанссон и Гулчер вернулись в Бостон, их предложение о предоставлении гранта было отклонено Национальным институтом здравоохранения, у которого не было опыта финансирования работы с пациентами, находящимися в отдаленном родстве. Но Стефанссон увидел в Исландии потенциал для использования того же подхода для поиска генетической составляющей практически любого распространенного заболевания. Это выходило за рамки академической лаборатории, и он связался с фирмами венчурного капитала, чтобы узнать, можно ли финансировать такое предприятие как частную компанию. Летом 1996 года он привлек 12 миллионов долларов от нескольких американских венчурных фондов для создания генетики deCODE. Он и Гулчер переехали в Исландию, чтобы начать работу, и в следующем году оставили свои позиции в Гарварде.
Стефанссон задумал deCODE как предприятие промышленного масштаба в области генетики человека. В отличие от преобладающей академической модели ученых, выполняющих отдельные проекты в своих отдельных лабораториях, он предложил собрать и создать как можно больше генеалогических, медицинских и геномных данных от всего населения. Используя биоинформатику и статистику, deCODE может затем объединить и проанализировать все эти данные вместе для корреляции между вариациями в последовательности и любым заболеванием или признаком, практически без гипотез. Бизнес-модель заключалась в том, чтобы финансировать эти усилия через партнерство с фармацевтическими компаниями, которые будут использовать открытия для разработки новых лекарств.
Исландия имела источники данных, необходимые для этого «популяционного подхода»: высококачественное здравоохранение с одним плательщиком. система; относительно однородная популяция, что сделает поиск вариантов заболевания менее сложным; образованные граждане, готовые предоставить ДНК, медицинскую и медицинскую информацию для исследований; и, что самое уникальное, всеобъемлющие национальные генеалогии. Мэри Клэр Кинг, которая использовала семейные родословные для определения BRCA1 при раке груди, была среди ученых, которые осознали потенциал этих записей. Как она сказала жителю Нью-Йорка, «возможность проследить генеалогию целой нации на протяжении тысячи лет... и получить образцы крови и тканей здоровых живых людей... может стать одним из сокровищ современной медицины. «
С самого начала практически все в стратегии Стефансона было бездоказательным или спорным. Сообщество геномиков все еще было далеко от создания первой последовательности генома человека; он предлагал систему данных для добычи сотен тысяч геномов. Гены, связанные с более редкими синдромами, были идентифицированы в изолированных семьях на Сардинии, Ньюфаундленде, Финляндии и в других местах, а вариант BRCA2 был обнаружен в Исландии, но он хотел изучить наиболее распространенные проблемы общественного здравоохранения. Wall Street Journal назвал это предприятие «большой авантюрой», сославшись на известных ученых, которые «на сегодняшний день нет научных доказательств того, что исследователи могут расшифровать генетику сложной болезни среди населения Исландии или любой другой страны». А deCODE была частной компанией, которая рассматривала целую страну в качестве единицы исследования с беспрецедентным уровнем общественного участия и участия, которое это повлекло за собой.
Наибольшую полемику вызвало предложение Стефанссона в 1997 году создать базу данных копий медицинских записей из национальной службы здравоохранения для сопоставления с генеалогическими и геномными данными. При поддержке подавляющего большинства общественности и членов парламента в 1998 г. был принят Закон о базе данных сектора здравоохранения, разрешающий создание такой базы данных и лицензирование ее для коммерческого использования. Но против него яростно возражали группа местных ученых и врачей, а также многих международных специалистов по биоэтике. Противники Исландской базы данных по сектору здравоохранения (IHD) возражали против использования общедоступных данных частным предприятием и против предполагаемого согласия в качестве модели использования медицинских записей в исследованиях. Они утверждали, что проект поставит под угрозу конфиденциальность данных людей, задушит научную свободу, и в целом не одобряли новую финансируемую венчурными предприятиями модель биомедицинских инноваций, которую представляет deCODE.
В сотнях интервью и статей Стефанссон подвергался нападкам - и столь же решительно защищался - IHD и его более широкому подходу. Он утверждал, что deCODE не подменяет традиционные источники данных или исследователей, а создает новый масштаб ресурсов и возможностей, в том числе для службы здравоохранения; приносить пользу сообществу за счет репатриации и использования исландских ученых в передовых областях; а также соблюдение международных норм согласия при установлении новых стандартов в крупномасштабных исследованиях под надзором государственных органов по биоэтике и защите данных и новых протоколов защиты данных и конфиденциальности. Критики в то время остались не убежденными. Специалист по биоэтике из Стэнфорда Хэнк Грили просто пришел к выводу, что «исландская модель не является хорошим прецедентом для аналогичных исследований в другом месте».
Как архитектор, научный руководитель и публичное лицо deCODE, Стефанссон внес фундаментальный вклад в демонстрацию того, что геномика может быть реализована в национальном масштабе, и в предоставлении реального примера того, как это сделать. К тому времени, когда Human Genome Project и Celera опубликовали свой проект последовательностей человеческого генома в 2001 году, его видение популяционной генетики уже сформировалось и привело к ранним открытиям вариабельности последовательностей, связанных с болезни, эволюция человека и история популяции. В 2002 году deCODE использовала свои возможности в Исландии для публикации генетической карты генома, которая использовалась для завершения окончательной сборки эталонной последовательности генома человека. К середине десятилетия даже бывшие критики признали, что то, что Стефанссон создавал в Исландии посредством полностью согласованного индивидуального участия и сбора данных, действительно было важным примером для перспективных проектов генома в Великобритании, США, Канаде, Швеции, Эстонии и других странах, а также для фонда. новых институтов, таких как Broad Institute.
Одним из столпов успеха стратегии Стефанссона была его способность убедить десятки тысяч людей добровольно принять участие в исследованиях deCODE, а также связать и проанализировать свои данные, используя генеалогии. Раннее партнерство с местным разработчиком программного обеспечения Фридриком Скуласон создало компьютеризированную национальную генеалогическую базу данных, которая объединила всех живущих исландцев и включила большинство людей, которые когда-либо жили в Исландии за последние одиннадцать столетий. В 2003 году одна версия этой базы данных, получившая название Íslendingabók, стала бесплатно доступной онлайн для всех, у кого есть исландский национальный идентификационный номер, и ею ежедневно пользуются тысячи граждан. Версия, используемая в исследовании, заменяет имена зашифрованными личными идентификаторами, контролируемыми Комиссией по защите данных Исландии. Это позволяет создавать родословные, связывающие генетические и фенотипические данные любой группы людей анонимным образом. Стефанссон и Гулчер опубликовали структуру этой системы защиты данных для использования в других геномных проектах.
Основным средством привлечения для исследования deCODE было сотрудничество с врачами службы здравоохранения, которые составляют списки пациентов с различными заболеваниями. которые затем приглашаются принять участие. Участие предполагает не только письменное информированное согласие, но и заполнение анкет о состоянии здоровья; прохождение подробного клинического обследования и измерений; и сдача крови для выделения ДНК; все это происходит в специальной клинике и требует от участников нескольких часов для выполнения. IHD так и не был создан, его научное и деловое обоснование в значительной степени вытеснилось реакцией исландцев, которые по очереди предоставляли свои данные. К 2003 году, когда около 95% людей попросили об участии и согласились принять участие, более 100 000 человек принимали участие в исследовании одного или нескольких из трех десятков заболеваний. К 2007 году это число выросло до 130 000; а к 2018 году - более 160 000. Это примерно 70% всех взрослых граждан, у 60 000 из которых был секвенирован весь свой геном.
На каждом последующем этапе технологии считывания генома - от микросателлитных маркеров до SNP для полногеномного секвенирования - это участие уникально для доли населения и также неизменно составляет одну из самых больших коллекций геномных данных в мире в абсолютном выражении. Используя генеалогии, deCODE может вменять данные о последовательностях всей популяции, давая единый зашифрованный, пригодный для анализа набор данных из более чем 300 000 полных геномов.
Побуждая своих коллег по deCODE к постоянному построению и повторно запросив эти наборы данных о населении, Стефанссон внес постоянный вклад в понимание того, как генерируются вариации в последовательности генома и как они влияют на здоровье и болезни. Майлс Акстон, давний редактор журнала Nature Genetics, отметил на праздновании 20-летия deCODE, что это руководство поставило deCODE и Исландию «в авангарде революции, которая принесла многое из того, что было обещано при картировании генома человека» <63.>
Эти открытия, инструменты и наблюдения были представлены научному сообществу в сотнях научных публикаций. Стефанссон направляет и контролирует все исследования в deCODE и является старшим автором его статей, а руководители проектов и групп являются первыми авторами и соавторами из сотен местных и международных учреждений и организаций, с которыми deCODE сотрудничает. Многие из них представляют собой значительный вклад в эту область, и Стефанссон и несколько его коллег из deCODE неизменно входят в число наиболее цитируемых ученых в области генетики и молекулярной биологии.
В более чем дюжине крупных статей, опубликованных за почти двадцать лет, Стефанссон и его коллеги использовали свой целостный взгляд на всю популяцию, чтобы построить новую картину генома человека как системы для передачи информации. Они предоставили подробное представление о том, как геном использует рекомбинацию, мутацию de novo и преобразование гена для стимулирования и создания собственного разнообразия, но в определенных пределах.
В 2002 году deCODE опубликовала свою первую рекомбинационную карту генома человека. Он был сконструирован с использованием 5000 микросателлитных маркеров и выдвинул на первый план 104 поправки к черновому варианту сборки генома в рамках проекта «Геном человека», что немедленно повысило точность черновика с 93 до 99%. Но с точки зрения эволюционной биологии он в новых деталях продемонстрировал неслучайное расположение рекомбинаций - перестановку генома, которая приводит к образованию яйцеклеток и сперматозоидов, - и что женщины рекомбинируют в 1,6 раза больше, чем мужчины.
Затем они показали, что пожилые женщины рекомбинируют чаще, чем молодые; что более высокая рекомбинация коррелирует с более высокой фертильностью; и что большая инверсия на хромосоме 17 в настоящее время находится под положительным эволюционным отбором в европейских популяциях, причем носители имеют более высокие уровни рекомбинации и фертильности, чем не носители. Вторая карта рекомбинации, опубликованная в 2010 году, использовала 300 000 SNP и выявила различные горячие точки рекомбинации между женщинами и мужчинами, а также новые генетические вариации, которые влияют на скорость рекомбинации, и которые влияют на это по-разному в европейских и африканских популяциях.
Эта карта также показали, что в то время как женщины ответственны за большую часть рекомбинации, мужчины генерируют основную часть мутаций de novo. В широко обсуждаемой статье 2012 года они продемонстрировали, что количество таких мутаций - вариантов, которые появляются в геномах детей, но не наследуются ни от одного из родителей, - увеличивается с возрастом отца и представляет собой основной источник редких детских болезней. Подробный анализ различных типов и распределения материнских и отцовских мутаций de novo был опубликован в 2017 году, и последующий документ продемонстрировал, как мутации de novo могут передаваться от родителей.
Третий источник геномного разнообразия, преобразования генов трудно обнаружить, кроме как при просмотре очень обширных генеалогий. deCODE объединил геномные и генеалогические данные примерно 150 000 человек, чтобы продемонстрировать, что этот процесс, как и кроссоверная рекомбинация, более распространен у женщин; зависит от возраста; и что преобразования мужских и женских генов, как правило, дополняют друг друга, так что они сдерживают друг друга. В 2019 году deCODE использовал генеалогии, большое количество полных геномных последовательностей (WGS), которые он завершил впредыдущие годы, и данные генотипирования по большей части населения, опубликовать третью рекомбинационную карту генома. Это первая карта, созданная с использованием данных WGS, и, как и предыдущие карты, открыта для глобального сообщества.
Вклад в историю популяций и генетическую антропологию включает новаторские работы по скорости и механизмам мутаций в митохондриях и Y-хромосома; сравнение древней ДНК с современной; соответствующих норвежских и кельтских корней митохондрий и Y-хромосом в исландском населении; наблюдения за феноменом генетического дрейфа, когда изолированная популяция со временем расходуется с исходными популяциями; связь между родством и плодородием; влияние структуры популяции на варианты, связанные с заболеванием, и наоборот, популяционный каталог нокаутов среди людей, у которых отсутствует гены.
В 2018 году deCODE использовала свои возможности для реконструкции генома Ганса Джонатан, один из первых исландцев африканского происхождения. Он иммигрировал в Исландию в 1802 году, и его геном был реконструирован из фрагментов геномов 180 из почти 800 его живых потомков, прослеженных через Íslendingabok.
Стефанссон, вероятно, наиболее часто известен вкладом, который он и его коллеги по deCODE внесли в открытие генетических вариаций, связанных с риском заболеваний и рядом других признаков. Популяционный подход - масштаб и широта ресурсов и акцент на кросс-майнинг разрозненных наборов данных - был ключом к этой производительности. Это позволяет использовать как широкие, так и строгие определения фенотипов, быстро проверять идеи, ученым, работающим с deCODE, за тем, куда ведут данные, а не за собственными гипотезами. Это привело к целому ряду открытий, которые связывают болезни и иногда используют генетику даже для необычного переопределения фенотипов, и Стефанссон потратил много времени, объясняя эти открытия и их научным и непрофессиональным СМИ. Как правило, открытия, сделанные в Исландии, публикуются вместе с проверкой на других популяциях. И наоборот, deCODE часто использует свои ресурсы для проверки открытий, сделанных в других местах. Среди наиболее примечательных из этих открытий по заболеванию и признаку:
В 2012 году был обнаружен вариант гена APP, который защищает носителей от Болезнь Альцгеймера (AD) и защитные люди от когнитивных нарушений. Он широко цитировался и использовался при разработке ингибиторов BACE1 в качестве использования методов лечения. Стефанссон и команда deCODE также представлены варианты в генах TREM2 и ABCA7, которые увеличивают риск БА.
Стефанссон и его команда использовали обширные наборы данных компании и связи между заболеваниями и характеристиками, чтобы новые варианты риска психических заболеваний, а также уточнить понимание нарушений, которые определяют эти состояния и природу самого познания. Исследования, проведенные в начале 2000-х годов, выявили участие гена Нейрегулин 1 в шизофрении, что привело к существенным исследованиям этого пути нового. В течение следующих пятнадцати лет они использовали стандартные определения GWAS и сниженного плодовитости в промежуточном фенотипе для SNP и вариаций числа копий (CNV), связанных с риском шизофрении и других расстройств; что генетические факторы риска шизофрении и аутизма вызывают когнитивные нарушения даже у контрольных субъектов; они связали шизофрению, биполярное расстройство как с творческими способностями, так и с риском зависимости; они определили генетические варианты, связанные с уровнем образования и познания в детстве; и присутствует, что эти варианты в настоящее время проходят отрицательный эволюционный отбор. При рассмотрении общих психических расстройств, когнитивных процессов и когнитивных функций эта работа способствует нынешнему пониманию этих состояний как отдельных фенотипов, как связанных через нарушение фундаментальных когнитивных функций.
Стефанссон и его коллеги создали множество новаторских открытий вариантов генома, связанных с риском многих распространенных видов рака. Они сыграли роль новой в формировании общепринятой парадигмы понимания: его следует определять, по крайней мере, в молекулярных терминах, как и в том, где он возникает в организме. deCODE опубликовал доказательства этого в семейной совокупности всех видов рака, диагностики у кого-либо в Исландии за пятьдесят лет, а также в другом совокупном исследованиих. Они не подвергаются определенным группам населения. Они представляют, что локус хромосомы 8q24 несет в себе варианты риска для многих видов рака, а варианты генах TERT, TP53 и LG24 - как факторы риска для нескольких видов рака.
deCODE обнаружил ряд последовательных, связанных с риском. рака простаты (а также его защитного варианта), рака груди, меланомы и базальноклеточного рака щитовидной железы, рака мочевого пузыря, рака яичников, рака почки, рака желудка, рака яичек, рака легких и клонального гематопоэза. Три исследования, проведенных для почти лет, показали, что как распространенные, так и редкие варианты, связанные с повышенной никотиновой зависимостью, и количество выкуриваемых сигарет в день также являются факторами риска рака легких и периферических заболеваний артерий; то есть генетическая предрасположенность к курению одновременно фактором риска заболеваний, связанным с курением.
Стефанссон и его группа исследователей сердечно-сосудистой системы сотрудничали по всему миру с помощью различных распространенных и редких вариантов, связанных с риском фибрилляции предсердий, ишемической болезни сердца (ИБС), инсульта, заболевания периферических артерий, синдрома слабости синусового узла, а также аневризмы аорты и внутричерепных аневризм. Среди их недавних открытий, заслуживающих внимания - редкий вариант гена ASGR1, который обеспечивает существенную защиту от ишемической болезни сердца, причины основной смерти в странах. Это открытие используется при открытии и разработке лекарств в Amgen. Другое очень крупное исследование, анализирующее данные клинических и полногеномных последовательностей примерно 300 000 человек, обнаружило более десятка редких вариантов, соответствующего повышенному уровню относительно холестерина. Однако генетическая связь позволяет с риском ИБСила по-новому взглянуть на то, как холестерин связан с сердечными заболеваниями. Они сообщили, что измерение холестерина не-ЛПВП (так называемого «хорошего холестерина») лучше отражает риск, чем измерение холестерина ЛПНП (или «плохого»), что является современной стандартной практикой.
deCODE обнаружил связь между диабетом 2 типа (T2D) и вариантами гена TCF7L2, важного из известных генетических факторов риска, а также методами CDKAL1 и других генов, связанными с инсулиновым ответом, как повышенными, так и пониженными nT2D. риск. Команда deCODE внесла вклад в понимание генетической изменчивости, влияющей на ряд других заболеваний и признаков, включая глаукому; менархе; эссенциальный тремор; предрасположенность к туберкулезу; высота; экспрессия генов; пигментация волос, глаз и кожи; стеноз аортального клапана; риносинусит; и десятки других.
Сообщается, что в 2014 году Стефанссон удивил Дэвида Альтшулера, тогдашнего заместителя директора Института Броуда, который зашел в deCODE на обратном пути из Финляндии и Швеции. Альтшулер руководил исследованиями СД2 и обнаружил редкий вариант, который, кажется, защищает от развития болезни даже тех, кто имеет все общие факторы риска, связанные с образом жизни. Стефанссон позвонил одному из руководителей своей группы и попросил его проверить поиск ассоциации в данных deCODE. В течение нескольких минут они подтвердили, что у исландцев не было точного варианта, используя другой спецшулера, но это был другой в том же гене, который явно защищал от СД2. Затем команда deCODE добавила свой вариант в статье, опубликованную в Nature Genetics.
Разработка Стефанссоном и руководство deCODE как частным предприятием, построенным после массового участия внесла свой вклад в новые модели взаимодействия, разработки продуктов и государственно-частного партнерства в медицинских исследованийх.
Хотя deCODE представляет собой первый и наиболее широкий национальный геномный проект, он никогда не финансируется. Этот бизнес всегда был основан на добровольном участии граждан и врачей национальной системы здравоохранения в качестве партнеров в научных открытиях. Эти отношения между гражданами и частным выражением, которые казались Стефанссонными, говорящими друг с другом, часто используемыми, становятся все более распространенными. Превратившая небольшие размеры страны и историческая изоляция в уникальном преимуществе в этой области. Другая причина заключается в том, что использование использования для создания и продажи реальных продуктов для улучшения медицины и здоровья. В интервью 2017 года бывший президент Исландии Вигдис Финнбогадоттир выразил общее мнение: «Если исландцы могут внести свой вклад в здоровье мира, я более чем горжусь. Я благодарен ».
Бизнес deCODE был бурным, но Стефанссон всегда явно работал над тем, чтобы превратить свои открытия в полезные с медицинской точки зрения и коммерчески успешные продукты. Некоторые из них были в высшей степени инновационные и инновационные пути для новых секторов рынка. Спустя годы после Íslendingabok разместил генеалогии исландцев в Интернете, Genographic Project и такие компании, как MyHeritage, FamilyTreeDNA и Ancestry запустили веб-сайты, чтобы люди во всем мире могли попытаться использовать генетику для построения своей генеалогии. В ноябре 2007 года deCODE запустила deCODEme, первую службу персональной геномики, а на следующий день - Google с поддержкой 23andMe. DeCODEme включает в себя методы оценки индивидуальной предрасположенности к десяткам распространенных заболеваний, согласно рекомендациям 23andMe и другим распространенным заболеваниям. Опубликованные маркеры риска deCODE, обеспечивающие наиболее проверенную основу для всех подобных услуг.
Стефанссон также руководил выводом deCODE на рынок клинических тестов на полигенный риск диабета 2 типа, сердечного приступа, рака простаты, фибрилляции предсердий и инсульта. Маркетинг этих продуктов и deCODEme прекратился из-за финансовых проблем компании в 2011 году, но недавние громкие исследования, проведенные в Массачусетской больнице общего профиля, возродили интерес к тестированию на полигенные риски с медицинской точки зрения. В этих тестах используется больше маркеров и новые алгоритмы, чтобы развить варианты риска и подход, примененный в Исландии для тех же болезней.
Однако основной целью Стефанссона всегда было использование генома для информирования о разработке лучших лекарств. Чтобы найти лекарственные цели, лежащие в путях распространения, а не полагаться на методы и методы в медицинской химии, и иметь методы лечения, используются общепринятые термины. возможность проверять и проверять прописывать лекарства пациента, которые хорошо поддаются лечению. Это решает давние проблемы производительности при разработке лекарств, и Стефанссон финансирует компанию в основном за счет партнерства с фармацевтическими компаниями. Сделка с компанией Roche по открытию гена и цели на 200 миллионов долларов в 1998 г. стала первым признаком интереса отрасли к геномике для создания лучших лекарств. Были созданы другие партнерские отношения с Merck, Pfizer, Astra Zeneca и другими. В середине 2000-х компания ввела в клиническую разработку несколько своих собственных соединений, но не имела финансовых ресурсов для продолжения их разработки после банкротства и реструктуризации в 2009 году.
Безусловно, самый длительный, самый глубокий и самый продуктивный партнерство было именно с Amgen. В 2012 году Amgen купила deCODE за 415 миллионов долларов. С тех пор она действует как полностью находящаяся в собственности, но вполне независимая дочерняя компания, применяя свои возможности в рамках разработки лекарств Amgen, сохраняя при этом местный контроль над своими данными и наукой. При полной поддержке Amgen она продолжила публиковать коммерчески значимые открытия в области генов и лекарственных препаратов, а также о человеческом разнообразии и эволюции, являясь ярким примером того, как коммерческие цели, фундаментальная наука и публичное распространение результатов могут быть взаимовыгодными.
Интеграция с Amgen совпала с началом крупномасштабного секвенирования всего генома в deCODE и вменением этих данных во все исландские данные компании. Обладая этими данными, Стефанссон и его коллеги из Amgen полагали, что геномика может преобразить разработку лекарств, что было невозможно с использованием только данных SNP-чипа и GWAS. Важно отметить, что они могли идентифицировать редкие, сильнодействующие мутации, влияющие на общие фенотипы - короче говоря, на самые крайние версии распространенных заболеваний - давая лекарственные мишени с потенциально лучше подтвержденным и более поддающимся лечению терапевтическим потенциалом. Этому «редкому для общего» подходу сейчас следуют многие фармацевтические компании. Идентификация ASGR1 была примером этого и была использована при открытии новых лекарств для борьбы с холестерином.
В более широком смысле, давний главный научный сотрудник Amgen Шон Харпер сказал в 2018 году, что «с приобретением deCODE мы получили промышленные возможности для популяционной генетики, "которые могут обеспечить генетическую проверку человека для любой мишени или соединения. deCODE провела оценку всего клинического портфеля Amgen в течение месяца после приобретения, предоставив информацию, которая помогла избежать клинических неудач, а также расставить приоритеты и направить испытания. Харпер утверждает, что эта модель «разработка лекарств, ориентированная на цель» позволила компании решить свой собственный вариант эндемичной отраслевой проблемы производительности. Он подсчитал, что «просто [имея] сильную генетическую поддержку для половины вашего трубопровода вы можете повысить рентабельность инвестиций в НИОКР примерно на 50%».
В В 2018 году deCODE запустила веб-сайт, который позволяет исландцам запрашивать анализ данных их последовательностей, чтобы определить, несут ли они SNP в гене BRCA2, связанном со значительно повышенным риском рака груди и простаты. у исландцев. Это был первый случай, когда deCODE, которая в первую очередь является исследовательской организацией, вернула участникам информацию из своих исследовательских данных. Стефанссон много лет пытался убедить Министерство здравоохранения Исландии в том, что это серьезная проблема общественного здравоохранения, которую данные deCODE могут решить практически бесплатно, и что это был лишь один из наиболее очевидных вариантов применения точной медицины в здравоохранении. в Исландии.
Ввиду отсутствия реакции со стороны системы здравоохранения Стефанссон пошел дальше и передал дело в руки граждан. По состоянию на конец 2018 года около 40000 человек, более десяти процентов населения, использовали сайт, чтобы узнать свой статус BRCA2. Сотни людей смогли узнать, что они являются носителями, и Национальная больница создала свои консультационные и другие службы, чтобы помочь им решить, как они хотят использовать эту информацию для защиты своего здоровья. Учитывая уровни заболеваемости и смертности от рака груди и простаты, связанные с BRCA2, доступность этой информации должна позволить предотвратить и раннее обнаружение сотен видов рака и спасти десятки жизней.
Представляем Стефанссона на лекцию Уильяма Аллана На ежегодной конференции Американского общества генетики человека 2017 года Марк Дейли, в то время содиректор Институт Броуда, сказал:
«невозможно упустить из широко распространенную парадигму, включающую набор биобанков с полным вовлечением населения, историческими данными медицинских регистров, инвестициями в крупномасштабный сбор генетических данных и статистической методологией, а также совместные последующие действия в академических и отраслевых рамках. Что Кари и его коллеги из deCODE предоставили шаблон для этой системы открытий. Более того, легко забыть, когда Кари основал deCODE Genetics 21 год назад, концепции считались довольно радикальными и маловероятными. Он был как в прямом, так и в переносном смысле. как выразился Питер Доннелли, «количество стран, вкладывающих миллионы в аналогичные ресурсы, является удивительным свидетельством его видения».
Следуя дальше Успех Исландии, совместные предприятия, которые могут быть реализуются или планируются национальные проекты генома различного масштаба, основание, включающее (через UK Biobank, а также Genomics Англия и Scottish Genomes Partnership отдельно); США (Все мы, а также Программа для ветеранов на миллион ), Австралия, Канада, Дубай, Эстония, Финляндия, Франция, Гонконг, Япония, Нидерланды, Катар, Саудовская Аравия, Сингапур, Южная Корея, Швеция и Турция. Проекты, в степени или частично финансируемые фармацевтические компании для информирования об открытии мишеней для лекарств, включая FinnGen (частично планетет Марк Дейли), Regeneron / Geisinger и Genomics Медицина Ирландии. 265>В апреле 2019 года Стефанссон был назначен первым президентом Северного общества генетики человека и точной медицины. Общество было создано для создания пан-скандинавской основы для исследований в области генетики человека и применения геномики в области во всем регионе цели с генерации и интеграции геномных и медицинских данных из Исландии, Норвегии, Швеции, Дании, Финляндии и Эстонии.
Стефанссон получил одни из самых высоких наград в области биомедицинских исследований и генетики, включая Премию Андерса Джара, Премию Уильяма Аллана и медаль Ганса Кребса. Его работа была признана пациентами и исследовательскими организациями, такими как Американское общество Альцгеймера, а также крупными международными изданиями и организациями, включая Time, Newsweek, Forbes, BusinessWeek и Всемирный экономический форум. Он также получил высшую награду Исландии - Орден Сокола. В 2019 году он был избран иностранным сотрудником Национальной академии наук США и получил международную премию KFJ от Rigshospitalet, одного из старейших и самых престижных медицинских учреждений в Дании.
В июне 2012 года его дочь Сольвейг «Сола» Карадоттир вышла замуж за Дхани Харрисона, сына покойного Джорджа Харрисона и его женой Оливией. Харрисон. Они расстались в 2016 году.
Стефанссон является образцом для профессора Ларуса Йоханссона в Дауданс óvissi tími Оринн Бертелссон и главный злодей сатирической книги Аттара М. Норёфьёру 2007 года «Йон Асгейр и афмелисвейслан», в которой он создает женскую версию Давида Оддссона из образца волос Давида. Он является образцом для Хрольфура Зофаниаса Магнуссона, директора компании CoDex, в исполнении Сьона. В своем романе 2002 года Джар Сити, Арналдур Индридасон смешивает критические и юмористические отсылки к deCODE и Стефанссону, создав смутно зловещий институт генетики в Рейкьявике, возглавляемый скрупулезно вежливой миниатюрной брюнеткой по имени Каритас.. В версии фильма 2006 года режиссера Бальтасара Кормакура Стефанссон (рост 6 футов 5 дюймов, с седыми волосами) играет самого себя, добавляя момент верите, но теряя сатирическую иронию своего Он также снимался в документальном фильме Бобби Фишер против мира, где участвовал в противоречивых дебатах с покойным Бобби Фишером.
