встроенный анализатор шума - intrinsic Noise Analyzer

Встроенный анализатор шума (iNA) - это программное обеспечение с открытым исходным кодом для изучения кинетики реакций в живых клетках. Программное обеспечение анализирует математические модели кинетики внутриклеточных реакций, таких как экспрессия генов, регуляторные сети или сигнальные пути, для количественной оценки колебаний концентрации из-за случайного характера химических реакций.

В хорошо перемешанных условиях, концентрации в живых клетках часто моделируются набором детерминированных реакций уравнений скорости. Этот подход часто становится неточным, когда некоторые молекулярные частицы присутствуют в низком количестве молекул на ячейку из-за случайности, присущей кинетике химической реакции. Эта случайность приводит к колебаниям количества внутриклеточных молекул и, следовательно, к межклеточной изменчивости. Более точное стохастическое описание этих систем дается с помощью главного химического уравнения. Последнее можно легко смоделировать с помощью методов Монте-Карло, таких как алгоритм стохастического моделирования. Однако этот метод часто становится неэффективным с вычислительной точки зрения из-за большого объема выборки, необходимого для точной статистики. iNA обеспечивает более эффективный способ получения желаемой статистики с помощью увеличения размера системы с помощью основного химического уравнения - метода систематической аналитической аппроксимации.

• домашняя страница iNA
• iNA (Windows)
• iNA (MacOSX)