Проект секвенирования генома гриппа

редактировать

Проект секвенирования генома гриппа (IGSP), инициированная в начале 2004 г., направлена ​​на изучение эволюции гриппа путем предоставления общедоступного набора данных полных последовательностей генома гриппа из коллекций изолятов, представляющих различные распределения видов.

Проект финансируется Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), подразделением Национальных институтов здравоохранения (NIH), и был работает на базе Центра микробного секвенирования NIAID Института геномных исследований (TIGR, который в 2006 году стал Институтом Вентера). Информация о последовательности, созданная в рамках проекта, постоянно помещалась в общественное достояние через GenBank.

Содержание

  • 1 Истоки
  • 2 Цели исследования
  • 3 Результаты
  • 4 Принадлежности
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние ссылки

Происхождение

В конце 2003 года Дэвид Липман, Стивен Зальцберг и консорциум других ученых написали предложение начать секвенирование большого количества вирусов гриппа в Институте геномных исследований (TIGR). До этого проекта в открытом доступе была лишь небольшая часть геномов гриппа. Их предложение было одобрено Национальными институтами здравоохранения (NIH), и позже оно стало IGSP. Позднее в том же году в ТИГР началась разработка новых технологий под руководством Элоди Гедин, и первая публикация, описывающая>100 геномов гриппа, появилась в 2005 году в журнале Nature

Цели исследования

Проект собирает все данные о последовательностях общедоступно через GenBank, международную, финансируемую Национальным институтом здравоохранения, базу данных с возможностью поиска. Это исследование помогает международным исследователям получить информацию, необходимую для разработки новых вакцин, методов лечения и диагностики, а также улучшить понимание общей молекулярной эволюции гриппа и других генетических факторов, определяющих их вирулентность. Такие знания могут не только помочь смягчить воздействие ежегодных эпидемий гриппа, но также могут улучшить научные знания о появлении пандемических вирусов гриппа.

Результаты

Проект завершил свою первые геномы в марте 2005 г., и с тех пор он быстро увеличился. К середине 2008 г. было полностью секвенировано более 3000 изолятов вирусов гриппа, эндемичных для популяций людей («человеческий грипп»), птиц («птичий грипп») и свиней («свиной грипп»), включая многие штаммы H3N2 (человек), H1N1 (человек) и H5N1 (avian).

Принадлежность

Проект финансируется Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), который является составной частью NIH, который является агентством Министерства здравоохранения и социальных служб США..

IGSP расширился и теперь включает постоянно растущий список сотрудников, которые внесли свой вклад как опыт, так и ценные коллекции изолятов гриппа. Среди первых участников были Питер Палезе из Медицинской школы Маунт-Синай в Нью-Йорке, Джилл Тейлор из Центра Уодсворта в Департаменте штата Нью-Йорк of Health, Лэнс Дженнингс (Новая Зеландия), Джефф Таубенбергер из Института патологии вооруженных сил (который позже перешел в NIH), Ричард Слемонс из Университета штата Огайо и Роб Вебстер из детской больницы Св. Джуда в Мемфисе, Теннесси.

В 2006 году к проекту присоединилась Илария Капуа из Италии, предоставившая ценную коллекцию изолятов птичьего гриппа (включая несколько штаммов H5N1 ). Некоторые из этих птичьих изолятов были описаны в публикации в Emerging Infectious Diseases в 2007 году. Нэнси Кокс из Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC) и Роберт Коуч из Медицинского колледжа Бейлора также присоединился к проекту в 2006 году, предоставив более 150 изолятов гриппа B.

В рамках проекта начались перспективные исследования сезона гриппа 2007 года с сотрудниками Флоренс Буржуа и Кеннетом Мандлом из Детской больницы Бостона и Гарвардской школы общественного здравоохранения и Лорел Эдельман из Surveillance Data Inc.

.

Ссылки

Внешние ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-24 14:41:44
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте