Иммунопротеомика

редактировать
Пример иммунопротеомического эксперимента, включающего вестерн-блот-анализ

Иммунопротеомика - это исследование больших наборов белков (протеомика ), участвующая в иммунном ответе.

Примеры общих применений иммунопротеомики включают:

  • Выделение и масс-спектрометрическую идентификацию MHC (главный комплекс гистосовместимости) связывающие пептиды
  • Очистка и идентификация белков антигенов связывающих специфических антител (или других аффинных реагентов)
  • Сравнительная иммунопротеомика для идентификации белков и путей, модулируемых конкретный инфекционный организм, заболевание или токсин.

Идентификация белков в иммунопротеомике осуществляется с помощью методов, включая методы на основе геля, микроматрицы и ДНК, причем масс-спектроскопия обычно является основным методом идентификации.

Содержание

  • 1 Приложения
    • 1.1 Иммунология
    • 1.2 Dr ug engineering
  • 2 Технология и оборудование
    • 2.1 Масс-спектрометрия
    • 2.2 2-D гель-электрофорез и вестерн-блоттинг
    • 2.3 2-D жидкостная хроматография
    • 2.4 Микроматрица
  • 3 См. также
  • 4 Ссылки
  • 5 Внешние ссылки

Приложения

Иммунология

Иммунопротеомика использовалась и использовалась для повышения научного понимания как аутоиммунных заболеваний патологии, так и прогрессирования. Используя биохимические методы, ген и, в конечном итоге, экспрессию белка можно измерить с высокой точностью. С помощью этой информации потенциально можно выяснить биохимические пути, вызывающие патологию в таких состояниях, как рассеянный склероз и болезнь Крона. Идентификация сывороточных антител, в частности, оказалась очень полезной в качестве диагностического инструмента для ряда заболеваний в современной медицине, в значительной степени из-за относительно высокой стабильности сывороточных антител.

Иммунопротеомные методы дополнительно используются для выделение антител. Идентифицируя антитела и приступая к их секвенированию, ученые могут идентифицировать потенциальные белковые мишени указанных антител. При этом можно определить антиген (ы), ответственный за конкретный иммунный ответ. Идентификация и конструирование антител, участвующих в патологии аутоиммунного заболевания, могут предложить новые методы лечения заболеваний.

Разработка лекарств

Путем идентификации антигенов, ответственных за конкретный иммунный ответ, можно определить жизнеспособные мишени для новых лекарств. Кроме того, специфические антигены можно дополнительно классифицировать на основе иммунореактивности для идентификации будущих потенциальных препаратов вакцины. В дополнение к идентификации вакцин-кандидатов, иммунопротеомные методы, такие как вестерн-блоттинг, могут дополнительно использоваться для измерения эффективности данной вакцины.

Технология и оборудование

Масс-спектрометрия

Масс-спектрометрия можно использовать при секвенировании мотивов связывания MHC, которые впоследствии можно использовать для прогнозирования эпитопов Т-клеток . Методика массового отпечатка пальца пептида (PMF) может быть использована для проверки масс-спектра пептида по базе данных протеиновых гидролизов, которые уже были задокументированы. Если масс-спектр интересующего белка, а также белка из базы данных имеет большое количество гомологии, вполне вероятно, что интересующий белок содержится в образце.

2- Электрофорез в D-геле и вестерн-блоттинг

Методы двумерного гель-электрофореза (2-D гель) в кульминации с вестерн-блоттингом использовались в течение многих лет для определения величины иммунного ответа. Это может быть достигнуто путем сравнения различных образцов с маркерами размера молекулярной массы для качественного анализа и с известными количествами белковых стандартов для количественного анализа.

Обычное устройство для 2D-гель-электрофореза

2-D жидкость хроматография

Сочетая жидкостную хроматографию с множеством других методов иммунодетекции, такими как серологический протеомный анализ (SERPA), можно анализировать гидрофобность, PI, относительная масса и реактивность антител к антителам в данной сыворотке.

Микроматричный

анализ различных сывороток с помощью микроматрицы может использоваться как средство для выявления изменений в экспрессии генов раньше, после и во время данного иммунного ответа.

Пример иммунопротеомных мышей

См. Также

Ссылки

Внешние ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-23 12:14:51
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте