Международное сотрудничество с базами данных нуклеотидных последовательностей

редактировать

Международное сотрудничество с базами данных нуклеотидных последовательностей (INSDC ) состоит из совместных усилий по сбору и распространению баз данных, содержащих последовательности ДНК и РНК. Он включает в себя следующие компьютеризированные базы данных : Банк данных ДНК Японии (Япония ), GenBank (США ) и Европейский архив нуклеотидов (UK ). Новые и обновленные данные о последовательностях нуклеотидов, внесенные исследовательскими группами в каждую из трех баз данных, синхронизируются на ежедневной основе благодаря постоянному взаимодействию между сотрудниками каждой сотрудничающей организации.

Синхронизация DDBJ / EMBL / GenBank поддерживается в соответствии с рядом руководящих принципов, разработанных и опубликованных Международным консультативным советом. Рекомендации состоят из общего определения таблиц функций для баз данных, которые регулируют содержание и синтаксис записей базы данных, в форме общего DTD (Определение типа документа).

Синтаксис называется INSDSeq, и его ядро ​​состоит из буквенной последовательности экспрессии гена (аминокислотная последовательность) и буквенной последовательности для нуклеотида оснований в гене или декодируемом сегменте. В операции DBFetch показывает типичную запись INSD в базе данных EBI; та же запись в NCBI.

Содержание

  • 1 См. также
  • 2 Внешние ссылки
  • 3 Ссылки
  • 4 Внешние ссылки

См. также

Внешние ссылки

Ссылки

Внешние ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-24 04:39:40
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте