Гексозаминидаза

редактировать
β-N-ацетилгексозаминидаза
Гексозаминидаза A (гетеродимер, с взаимодействиями Ван-дер-Ваальса).jpg Гексозаминидаза A (Hex A)
Идентификаторы
Номер EC 3.2.1.52
Номер CAS 9012-33-3
Базы данных
IntEnz IntEnz view
BRENDA Запись BRENDA
ExPASy Просмотр NiceZyme
KEGG Запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Онтология генов AmiGO / QuickGO

гексозаминидаза (EC 3.2.1.52, бета-ацетиламинодезоксигексозидаза, N-ацетил-бета-D-гексозаминидаза, N-ацетил-бета-гексозаминидаза, N-ацетилгексозаминидаза, бета-гексозаминидаза, бета-ацетилгексозаминидаза, бета-DN-ацетилгексозаминидаза, бета-N-ацетил-D-гексозаминидаза, бета-N-ацетилглюкозаминидаза, гексозам inidase A, N-ацетилгексозаминидаза, бета-D-гексозаминидаза) представляет собой фермент, участвующий в гидролизе концевых остатков N-ацетил-D- гексозамина в N -ацетил-β-D-гексозаминиды.

Содержание
  • 1 Изозимы и гены
    • 1.1 Лизосомные изоферменты A, B и S
      • 1.1.1 Функция
      • 1.1.2 Механизм действия
      • 1.1.3 Генные мутации, приводящие к болезни Тея – Сакса
    • 1.2 Цитозольные изоферменты C и D
  • 2 Ссылки
  • 3 Внешние ссылки
Изоферменты и гены

лизосомы A, B и S-изоферменты

Функциональные лизосомные ферменты β-гексозаминидазы имеют димерную структуру. Три изофермента продуцируются комбинацией субъединиц α и β с образованием любого из трех активных димеров:

гексозаминидаза. изоферментсостав субъединицыфункция
Aα / β гетеродимертолько изофермент, который может гидролизовать G M2 ганглиозид in vivo
Bβ / β гомодимерсуществует в тканях, но неизвестная физиологическая функция
Sα / α гомодимерсуществует в тканях, но его физиологическая функция неизвестна.

Субъединицы α и β кодируются отдельными генами, HEXA и HEXB соответственно. Бета-гексозаминидаза и кофактор GM2протеин-активатор катализируют разложение G M2ганглиозидов и других молекул, содержащих концевые N-ацетилгексозамины. Генные мутации в HEXB часто приводят к болезни Сандхоффа ; тогда как мутации в HEXA уменьшают гидролиз ганглиозидов G M2, что является основной причиной болезни Тея – Сакса.

β-гексозаминидазы субъединица альфа
Идентификаторы
СимволHEXA
Ген NCBI 3073
HGNC 4878
OMIM 606869
RefSeq NM_000520
UniProt P06865
Прочие данные
Номер ЕС 3.2.1.52
Locus Chr. 15 q24.1
бета-субъединица β-гексозаминидазы
Идентификаторы
СимволHEXB
ген NCBI 3074
HGNC 4879
OMIM 606873
RefSeq NM_000521
UniProt P07686
Другие данные
Номер ЕС 3.2.1.52
Locus Chr. 5 q13.3

Функция

Несмотря на то, что альфа- и бета-субъединицы лизосомальной гексозаминидазы могут расщеплять остатки GalNAc, только альфа-субъединица способна гидролизовать G M2 ганглиозидов из-за ключевого остатка Arg -424 и петлевой структуры, которая образуется из аминокислотной последовательности в альфа-субъединице. Петля в альфа-субъединице, состоящая из Gly -280, Ser -281, Glu -282 и Pro -283, которые отсутствует в бета-субъединице, служит идеальной структурой для связывания активаторного белка G M2 (G M2 AP), а аргинин необходим для связывания N-ацетил- остаток нейраминовой кислоты ганглиозидов G M2. Белок-активатор G M2 транспортирует ганглиозиды G M2 и представляет липиды гексозаминидазе, поэтому функциональный фермент гексозаминидаза способен гидролизовать G M2 ганглиозидов в ганглиозиды G M3 путем удаления остатка N-ацетилгалактозамина (GalNAc) из ганглиозидов G M2.

Механизм действия

A Michaelis комплекс, состоящий из остатка глутамата, остатка GalNAc на ганглиозиде G M2 и остатка аспартата, приводит к образованию промежуточного иона оксазолиния. Остаток глутамата (альфа Glu-323 / бета Glu-355) работает как кислота, отдавая свой водород гликозидному атому кислорода на остатке GalNAc. Остаток аспартата (альфа-Asp-322 / бета-Asp-354) позиционирует C2-ацетаминдогруппу так, что она может быть атакована нуклеофилом (атом кислорода N-ацетамидо на углероде 1 субстрата). Остаток аспартата стабилизирует положительный заряд на атоме азота в промежуточном ионе оксазолиния. После образования промежуточного соединения иона оксазолиния вода атакует электрофильный ацетальный углерод. Глутамат действует как основание, депротонируя воду, что приводит к образованию комплекса продукта и ганглиозида G M3.

Гидролиз ганглиозида G M2 до G M3 ганглиозид, катализируемый гексозаминидазой А. Механизм гидролиза ганглиозида G M2 и удаления остатка GalNAc с образованием ганглиозида G M3.

Генные мутации приводит к болезни Тея – Сакса

Существует множество мутаций, которые приводят к дефициту гексозаминидазы, включая делеции генов, бессмысленные мутации и миссенс-мутации. Болезнь Тея – Сакса возникает, когда гексозаминидаза А теряет способность функционировать. Люди с болезнью Тея-Сакса не могут удалить остаток GalNAc из ганглиозида G M2, и в результате они накапливают в 100-1000 раз больше ганглиозидов G M2 мозг, чем у нормального человека. Только в детских случаях болезни Тея – Сакса было обнаружено более 100 различных мутаций.

Наиболее частая мутация, которая встречается более чем у 80 процентов пациентов Тея – Сакса, возникает в результате добавления четырех пар оснований (TATC) в экзоне 11 гена Hex A. Эта вставка приводит к ранней остановке кодона, который вызывает дефицит Hex A.

Дети, рожденные с Tay-Sachs, обычно умирают в возрасте от двух до четырех лет от аспирации и пневмонии. Тай-Сакс вызывает церебральную дегенерацию и слепоту. Пациенты также испытывают вялость конечностей и судороги. На данный момент не существует излечения или эффективного лечения болезни Тея-Сакса.

NAG-тиазолин, NGT, действует как механический ингибитор гексозаминидазы А. У пациентов с болезнью Тея-Сакса (неправильно свернутый) гексозаминидаза A), NGT действует как молекулярный шаперон, связываясь в активном центре гексозаминидазы A, что помогает создать правильно свернутую гексозаминидазу A. Стабильная димерная конформация гексозаминидазы A имеет способность покидать эндоплазматический ретикулум и направляется в лизосому, где он может выполнять деградацию ганглиозидов G M2. Две субъединицы гексозаминидазы A показаны ниже:

Показано, что активный сайт альфа-субъединицы связан с NAG-тиазолином (NGT) в бета-гексозаминидазе. PDB : 2GK1 Светло-зеленый контур, окружающий NGT, представляет поверхность Ван-дер-Ваальса NGT. Важнейшие аминокислоты в активном сайте, которые способны образовывать водородную связь с NGT, включают аргинин 178 и глутамат 462. Показано, что активный сайт бета-субъединицы связан с NAG-тиазолином (NGT) в бета-гексозаминидазе. PDB : 2GK1 Голубой контур, окружающий NGT, представляет поверхность Ван-дер-Ваальса NGT. Важнейшие аминокислоты в активном центре, которые способны образовывать водородную связь с NGT, включают глутамат 491 и аспартат 452.

Цитозольные изоферменты C и D

Бифункциональный белок NCOAT (n ядерный c итоплазматическая O -GlcNAcase и a цетил t рансфераза), который кодируется геном MGEA5, обладает как активности гексозаминидазы и гистонацетилтрансферазы. NCOAT также известен как гексозаминидаза C и имеет отличную субстратную специфичность по сравнению с лизосомальной гексозаминидазой A. однонуклеотидный полиморфизм в гене O-GlcNAcase человека связан с сахарным диабетом 2 типа.

A Четвертый полипептид гексозаминидазы млекопитающих, который был обозначен как гексозаминидаза D (HEXDC), был недавно идентифицирован.

гексозаминидаза C
Идентификаторы
СимволMGEA5
ген NCBI 10724
HGNC 7056
OMIM 604039
RefSeq NM_012215
UniProt O60502
Другие данные
Номер EC 3.2.1.52
Locus Chr. 10 q24.1-24.3
гексозаминидаза D
Идентификаторы
СимволHEXDC
Альт. символыFLJ23825
ген NCBI 284004
HGNC 26307
RefSeq NM_173620
UniProt Q8IYN4
Прочие данные
EC число 3.2.1.52
Locus Chr. 17 q25.3
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-23 10:59:06
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте