Войти
Пример аминокислотной последовательности, нанесенной на спиральное колесо. Алифатические остатки показаны в виде синих квадратов, полярные или отрицательно заряженные остатки - в виде красных ромбов, а положительно заряженные остатки - в виде черных восьмиугольников. A спиральное колесо представляет собой тип графика или визуальное представление, используемое для иллюстрации свойств альфа-спиралей в белках.
. последовательность из аминокислот, которые составляют спиральную область Вторичная структура белка нанесена на график с вращением, где угол поворота между последовательными аминокислотами составляет 100 °, так что окончательное представление смотрит вниз по оси спирали.
На графике видно концентрируются ли гидрофобные аминокислоты на одной стороне спирали, обычно с полярными или гидрофильными аминокислотами на другой. Такое расположение является обычным для альфа-спиралей внутри глобулярных белков, где одна грань спирали ориентирована к гидрофобному ядру, а одна грань ориентирована к поверхность, открытая растворителем. Также выявлены специфические паттерны, характерные для белковых складок и стыковочных мотивов белка, как при идентификации участков димеризации лейциновой молнии и спиральных спиралей. Эту проекционную диаграмму часто называют «колесом Эдмундсона» в честь ее изобретателя.
Винтовые колеса можно рисовать с помощью различных программных пакетов, включая helixvis в R, heliquest в R или через сервер HELIQUEST.
