Гаплогруппа L0 (мтДНК)

редактировать
Гаплогруппа L0
Возможное время происхождения130-200 тыс. Лет назад
Возможное место происхожденияЮжная Африка или Юго-Восточная Африка
ПредокL (Митохондриальная Ева )
ПотомкиL0a'b'f'k, L0d
Определяющие мутации263 !, 1048, 3516A, 5442, 6185, 9042, 9347, 10589, 12007, 12720

Гаплогруппа L0 представляет собой гаплогруппу митохондриальной ДНК человека (мтДНК).

Содержание

  • 1 Происхождение
  • 2 Распространение
  • 3 Взаимодействие лекарств и болезней
  • 4 Субклады
    • 4.1 Дерево
  • 5 См. Также
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки

Происхождение

Регион в Африке, где Тишков обнаружил самый высокий уровень митохондриального разнообразия (зеленый), и регион Behar et al. постулируется, что самое древнее деление в человеческой популяции начало происходить (светло-коричневый)

L0 - одна из двух ветвей от самого недавнего общего предка (MRCA) для общей материнской линии человека. Гаплогруппа состоит из пяти основных ветвей (L0a, L0b, L0d, L0f, L0k). Четыре из них изначально были классифицированы на субклады L1, L1a, L1d, L1f и L1k.

В 2014 году анализ древней ДНК скелета 2330-летнего самца-фуражира из Южной Африки показал, что этот образец принадлежал к субкладу мтДНК L0d2c1c. Эта материнская гаплогруппа сегодня наиболее тесно связана с дзю, подгруппой коренного народа сан, что указывает на преемственность населения в регионе. В 2016 году было обнаружено, что высушенная мумия позднего железного века из региона Тули на севере Ботсваны также принадлежит к гаплогруппе L0.

MRCA (мтДНК)
L0

L0a

L0b

L0f

L0k

L0d

L1-6

L1

L2-6

Распределение

Прогнозируемое пространственное распределение гаплогруппы L0 в Африке. Карты частот для L0 (всего), L0a, L0b, L0d, L0f и L0k

L0 чаще всего встречается в Африке к югу от Сахары. Наиболее часто он встречается у койсанского народа и составляет в среднем 73%. Некоторые из самых высоких частот: Намибия (! Xun ) 79%, Южная Африка (Khwe /! Xun) 83%, и Ботсвана (! Кунг ) 100%.

Гаплогруппа L0d встречается среди койсанских групп Южной Африки ближе к хоидской стороне, при этом (после L0k) более санидская, но в значительной степени ограничена койсанами в целом. L0d также часто встречается в цветном населении Южной Африки, и его частота колеблется от 60% до 71%. Это иллюстрирует огромный материнский вклад койсанского народа в развитие цветного населения Южной Африки.

Гаплогруппа L0k - вторая по распространенности гаплогруппа в койсанских группах, более близких к санидской стороне (после L0d), более хоидская, но в значительной степени ограниченная койсанской группой в целом. Хотя связанная с Хойсаном гаплогруппа L0d была обнаружена с высокой частотой в цветном населении Южной Африки, L0k не наблюдалась в двух исследованиях с участием больших групп цветных людей.

Гаплогруппа L0f присутствует в относительно небольших частотах в Танзания, Восточная Африка среди народа сандаве в Танзании, который старше койсан.

Гаплогруппа L0a наиболее распространена в популяциях Юго-Восточной Африки (25% в Мозамбике ). Среди гвинейцев он имеет частоту от 1% до 5%, а группа Balanta показывает повышенную частоту примерно на 11%. Гаплогруппа L0a имеет палеолитическую временную глубину около 33 000 лет и, вероятно, достигла Гвинеи между 10 000 и 4 000 лет назад. Это также часто встречается в Мбути и Биака Пигмеи. L0a встречается с частотой почти 25% в Hadramawt (Йемен ).

гаплогруппа L0b Эфиопия.

Взаимодействие лекарств и болезней

У пациентов тем, кто получает препарат ставудин для лечения ВИЧ, гаплогруппа L0a2 связана с более высокой вероятностью периферической невропатии в качестве побочного эффекта.

Субклады

Дерево

Схематическое дерево гаплогруппы L0. MSA: Средний каменный век, LSA: Поздний каменный век, ka: тысячу лет назад.

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы L0 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека и последующие опубликованные исследования.

  • Самый недавний общий предок (MRCA)
    • L0
      • L0d
        • L0d3
        • L0d1'2
          • L0d1
            • L0d1a
            • L0d1b
            • L0d1c
              • L0d1c1
          • L0d2
            • L0d2a'b
              • L0d2a
                • L0d2a1
              • L0d2b
            • L0d2c
              • L0d2c1c
      • L0a'b'f'k
        • L0k
          • L0 k1
          • L0k2
        • L0a'b'f
          • L0f
            • L0f1
            • L0f2
              • L0f2a
              • L0f2b
          • L0a ' b
            • L0a
              • L0a1
                • L0a1a
                  • L0a1a2
                • L0a1b
                  • L0a1b1
                    • L0a1b1a
                  • L0a1b2a
                • L0a1b2
              • 92>
              • L0a1d
            • L0a2
              • L0a2a
                • L0a2a1
                  • L0a2a1a
                    • L0a2a1a1
                    • L0a2a1a2a2 <25a2>130>
                    • L0a2a2a
                • L0a2b
                  • L0a2ba
                • L0a2c
                • L0a2d
              • L0a3
              • L0a4
            • L0b

См. Также

Викискладе есть материалы, связанные с гаплогруппой L0 (мтДНК).

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

Митохондриальная Ева (L )
L0 L1–6
L1 L2 L3 L4 L5 L6
M N
CZ D E G Q O A S R I W X Y
C Z B F R0 до JT P U
HV JT K
H V J T

Ссылки

Внешние ссылки

  • Общие
  • Гаплогруппа L0
    • Роза, Александра; Брем, Антонио; Кивисилд, Тоомас; Мецпалу, Эне; Виллемс, Ричард (2004). «Профиль мтДНК жителей Западной Африки в Гвинее: на пути к лучшему пониманию региона Сенегамбия». Анналы генетики человека. 68 (4): 340–52. doi : 10.1046 / j.1529-8817.2004.00100.x. PMID 15225159. S2CID 15391342. Основываясь на предыдущих знаниях африканских полных последовательностей, парафилетическая клада L1 разделена на две монофилетические единицы L0, захватывающие ранее определенные клоны L1a и L1d, и кладу L1, которая включает клады L1b и L1c…
    • Pavesi, A. (2005)). «Использование полиомавируса JC в отслеживании модели миграции людей, относящейся к доисторическим временам». Журнал общей вирусологии. 86 (5): 1315–26. doi : 10.1099 / vir.0.80650-0. PMID 15831942. Первая ось мтДНК, с другой стороны, помещает предковую гаплогруппу L0 в крайнее левое положение, поскольку она дала начало одной единственной линии…
    • Мишмар, Дэн; Руис-Песини, Эдуардо; Брэндон, Мартин; Уоллес, Дуглас С. (2004). «Митохондриальные ДНК-подобные последовательности в ядре (NUMT): понимание нашего африканского происхождения и механизма интеграции чужеродной ДНК». Мутация человека. 23 (2): 125–33. doi : 10.1002 / humu.10304. PMID 14722916. S2CID 25109836. мтДНК гаплогруппы L0, гаплогруппа, которую мы ранее пришли к выводу, лежит в основе мтДНК человека. дерево на основе филогенетического анализа…
    • Найт, Алек; Андерхилл, Питер А.; Мортенсен, Холли М.; Животовский, Лев А.; Лин, Алиса А.; Henn, Brenna M.; Луи, Дороти; Рулен, Мерритт; Гора, Джоанна Л. (2003). «Африканская Y-хромосома и дивергенция мтДНК обеспечивает понимание истории языков клика». Текущая биология. 13 (6): 464–73. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (03) 00130-1. PMID 12646128. S2CID 52862939.
Последняя правка сделана 2021-05-22 13:09:39
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте