Гаплогруппа HV (мтДНК)

Гаплогруппа HV - это гаплогруппа митохондриальной ДНК человека (мтДНК).

• 1 Происхождение
• 2 Распространение
• 3 субклада
  • 3.1 Дерево
  • 3.2 HV0 и HVSI C16298T
• 4 См. Также
• 5 Ссылки
• 6 Внешние ссылки

HV гаплогруппы происходит от гаплогруппа R0, которая, в свою очередь, происходит от гаплогруппы R. HV также является наследственной кладой гаплогрупп H и V.

Гаплогруппа HV встречается в основном в Западной Азии, Южной Европе, Восточной Европе и Северной Африке.

В Африке наибольшее количество кладов встречается среди Египтяне, населявшие оазис Эль-Хайез (14,3%). Субклад HV0, встречающийся среди мозабита берберов (8.24%),ливийцев (7.4%),Reguibate сахрави (6,48%), зената берберы (5,48%) и алжирцы (всего 4,84%; 2,15% -3,75% в Оране ).

В 2003 году было опубликовано исследование, в котором сообщалось о секвенировании мтДНК костей двух 24000-летних анатомически современных людей типа кроманьонцев из южных регионов. Италия. Исследование показало, что один из них принадлежал к гаплогруппе HV или R0. Гаплогруппа HV также была обнаружена среди древнеегипетских мумий, раскопанных на Абусир-эль-Мелек археологических раскопках в Среднем Египте, которые датируются доптолемеевым / поздним Новым царством, Птолемеев и римский периоды.

Гаплогруппа HV была обнаружена в различных окаменелостях, которые были проанализированы на предмет древней ДНК, включая образцы, связанные с Линейная керамика Альфельда (HV, Mezőkövesd-Mocsolyás, 1/3 или 33%), Linearbandkeramik (HV0a, Fajsz-Garadomb, 1/2 или 50%) и Германия среднего неолита (HV, Кведлинбург, 1/2 или 50%) культур.

Дерево

Это филогенетическое дерево субкладов HV гаплогруппы основано на статье van Oven (2009) и Малярчук и др. (2008).

• HV
  • HV0 (ранее известный как pre-V)
    • HV0a (ранее известный как preV * 2)
      • HV0a1
      • V
    • 195 (ранее известный как preV * 1)
      • HV0b
      • HV0c
  • HV1
    • HV1a
      • HV1a1
        • HV1a1a
      • HV1a2
    • HV1b
      • HV1b1
      • HV1b2
    • HV1c
  • 73
    • HV2
      • HV2a
  • HV4
    • HV4a
  • HV5
  • 16311 (ранее известный как HV3) (13 ± 2 тыс. Лет назад)
    • HV6 (ранее известный как HV3b) (15,4 ± 4,5 тыс. Лет назад)
      • HV6a (ранее известный как HV3b1)
    • HV7 ( ранее известный как HV3c)
    • HV8 (ранее известный как HV3d)
    • HV9 (ранее известный как HV3a) (8,2 ± 2,9 тыс. лет назад)
      • 152
        • HV9a
    • HV10
  • H

HV0 и HVSI C16298T

Определение мутации C / T в позиции 16298 в сегменте I, один из гипервариабельных сегментов помечен как HV0 по состоянию на 2012 год. Процент людей с положительным результатом теста на Вышеупомянутая мутация в исследовании западноевропейских популяций в 2002 году представлена ​​ниже.

В исследовании населения России и Польши процент людей с положительным результатом теста на эту мутацию составил пять процентов для обеих групп.

Исследование иракцев обобщило ряд предыдущих исследований, показывающих низкие уровни этой мутации среди населения Ближнего Востока и Италии.

Это мутация была обнаружена в древней ДНК, полученной из одного из девятнадцати человеческих останков, раскопанных на острове Гот. земля, Швеция, датированная 2800-2000 гг. до н.э. и археологически классифицированная как принадлежащая к культуре костной керамики.

Викискладе есть носители, относящиеся к гаплогруппе HV (мтДНК).

• Генеалогический ДНК-тест
• Генетическая генеалогия
• Популяционная генетика

1. ^Малярчук и др. (2008): «Основными компонентами среднего верхнего палеолита (26 000 YBP) были HV *, U1, возможно, U2 и U4, а основным компонентом раннего верхнего палеолита (45 000 YBP) была в основном гаплогруппа U5»
2. ^Малярчук и др. (2008): «Было высказано предположение, что большинство гаплогрупп HV, обнаруженных в настоящее время в Европе, происходят из региона Ближнего Востока и Кавказа (Richards et al. 2000; Tambets et al. 2000), но все еще остается много вопросов относительно классификации гаплогруппы, принадлежащие к семейству HV ".
3. ^ Ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2009). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека». Мутация человека. 30 (2): E386–94. doi : 10.1002 / humu.20921. PMID 18853457. S2CID 27566749.
4. ^Мартина Куянова; Луиза Перейра; Вероника Фернандес; Жоана Б. Перейра; Виктор Черный (2009). «Ближневосточный неолитический генетический вклад в небольшой оазис египетской Западной пустыни». Американский журнал физической антропологии. 140 (2): 336–346. doi : 10.1002 / ajpa.21078. PMID 19425100.
5. ^ Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорайя Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая неоднородность алжирских популяций человека». PLOS ONE. 10 (9): e0138453. Bibcode : 2015PLoSO..1038453B. doi : 10.1371 / journal.pone.0138453. PMC 4581715. PMID 26402429.; Таблица S5
6. ^Карима Фадхлауи-Зид; Лаура Родригес-Ботиге; Неджиб Науи; Амель Бенаммар-Эльгаайед; Франческ Калафель; Дэвид Комас (май 2011 г.). «Структура митохондриальной ДНК в Северной Африке выявляет генетический разрыв в долине Нила» (PDF). Американский журнал физической антропологии. 145 (1): 107–117. doi : 10.1002 / ajpa.21472. PMID 21312180. Проверено 20 апреля 2016 г.
7. ^Caramelli, D; Lalueza-Fox, C; Вернези, К; Лари, М; Casoli, A; Маллегни, Ф; Кьярелли, B; Dupanloup, I; и другие. (2003). «Доказательства генетического разрыва между неандертальцами и 24000-летними анатомически современными европейцами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (11): 6593–7. Bibcode : 2003PNAS..100.6593C. doi : 10.1073 / pnas.1130343100. PMC 164492. PMID 12743370.
8. ^Schuenemann, Verena J.; и другие. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение числа африканских предков к югу от Сахары в постримские периоды». Nature Communications. 8 : 15694. Bibcode : 2017NatCo... 815694S. doi : 10.1038 / ncomms15694. PMC 5459999. PMID 28556824.
9. ^Марк Липсон; и другие. (2017). «Параллельные палеогеномные трансекты раскрывают сложную генетическую историю ранних европейских фермеров». Природа. 551 (7680): 368–372. Bibcode : 2017Natur.551..368L. doi : 10.1038 / nature24476. PMC 5973800. PMID 29144465. Дата обращения 15 ноября 2017.
10. ^Малярчук Б.; Grzybowski, T.; Деренко, М.; Перкова, М.; Vanecek, T.; Lazur, J.; Gomolcak, P.; Цыбовский, И. (2008). «Филогения митохондриальной ДНК у восточных и западных славян». Молекулярная биология и эволюция. 25 (8): 1651–8. doi : 10.1093 / molbev / msn114. PMID 18477584.
11. ^Гаплогруппа HV Сайт митохондриальной ДНК Яна Логана 2009
12. ^Малярчук и др. (2008): «Возраст слияния всего HV3, определяемый переходом в np 16311, составляет 12700 ± 1960 YBP. Однако следует отметить, что HV3 может быть полифилетическим из-за гипервариабельности np 16311. Между тем, подкластеры HV3a и HV3b вероятно, являются монофилетическими, и их возраст оценивается в 8 200 ± 2 900 и 15 420 ± 4500 YBP, соответственно. Однако HV3b характеризуется высоким соотношением несинонимичных и синонимичных замен, поэтому возраст его слияния можно оценить как 11 837 ± 4 460 YBP, используя коэффициент предложено Кивисилдом и др. (2006) (таблица 2). То же, вероятно, верно и для оценки возраста гаплогруппы HV4 ».
13. ^Гонсалес, AM; Брем, А; Pérez, JA; Maca-Meyer, N; Флорес, К; Кабрера, В.М. (2003). «Сродство митохондриальной ДНК на атлантическом краю Европы». Американский журнал физической антропологии. 120 (4): 391–404. doi : 10.1002 / ajpa.10168. ПМИД 12627534.
14. ^Малярчук Б.А.; Гжибовски, Т; Деренко М.В.; Чарни, Дж; Возняк, М; Miścicka-Sliwka, D (2002). «Изменчивость митохондриальной ДНК у поляков и россиян». Анналы генетики человека. 66 (Часть 4): 261–83. DOI : 10.1046 / j.1469-1809.2002.00116.x. PMID 12418968. S2CID 221424344.
15. ^Аль-Захери, Нью-Йорк; Семино, О; Бенуцци, G; Магри, C; Пассарино, G; Торрони, А; Сантачиара-Бенеречетти, А.С. (2003). «Полиморфизмы Y-хромосомы и мтДНК в Ираке, перекресток раннего расселения людей и постнеолитических миграций». Молекулярная филогенетика и эволюция. 28 (3): 458–72. DOI : 10.1016 / S1055-7903 (03) 00039-3. PMID 12927131.
16. ^Мальмстрём, Хелена; Гилберт, М. Томас П.; Thomas, Mark G.; Брандстрём, Микаэль; Сторо, Ян; Мольнар, Петра; Андерсен, Пернилле К.; Бендиксен, Кристиан; и другие. (2009). «Древняя ДНК показывает отсутствие преемственности между неолитическими охотниками-собирателями и современными скандинавами». Текущая биология. 19 (20): 1758–62. DOI : 10.1016 / j.cub.2009.09.017. PMID 19781941. S2CID 9487217.

• Общие
  • Яна Логана Сайт митохондриальной ДНК
  • Манниса ван Овена Филотри
• Гаплогруппа HV
  • Распространение HV гаплогруппы, из Генографического проекта
  • Индийский проект генеалогической ДНК в ДНК генеалогического дерева
  • Проект мтДНК HV гаплогруппы в Семья ДНК дерева