Гаплогруппа E-V38

редактировать

Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека

Гаплогруппа E-V38 (бывшая E3a / E1b1a)
Возможное время происхождение	41,700 лет назад
Возможное место происхождения	Африканский Рог
Предок	E-P2
Потомки	E-M2, E-M329
Определение мутаций	L222.1, V38, V100

Гаплогруппа E-V38 представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека. В основном распространен в Африке. E-V38 имеет две базальные ветви: E-M329 (ранее E1b1c или E1b1 *) и E-M2 (ранее E3a и E1b1a). Субклад E-M329 сегодня почти исключительно встречается в Эфиопии. E-M2 - преобладающий субклад в Западной Африке, Центральной Африке, Южной Африке и районе Великих африканских озер, и встречается с умеренными частотами в Северной Африке и Ближнем Востоке.

Содержание

1 Происхождение
2 Распространение
3 Субклада
- 3,1 E1b1a1
- 3,2 E1b1a2
4 Филогенетика
- 4.1 Филогенетическая история
  - 4.1.1 Научные публикации
5 Дерево
6 См. Также
- 6.1 Генетика
- 6.2 Y-ДНК E субклады
7 Примечания
8 Ссылки
9 Внешние ссылки

Истоки

Открытие двух SNP (V38 и V100) Тромбеттой и др. (2011) значительно изменили определение филогенетического дерева E-V38. Это привело авторов к предположению, что E-V38, возможно, возник в Восточной Африке. V38 присоединяется к E-M2, связанным с Западной Африкой, и к E-M329, связанным с северной Восточной Африкой, с более ранним общим предком, который, как и E-P2, возможно, также произошел из Восточной Африки. Нижележащий SNP E-M180, возможно, возник во влажных южно-центральной Сахаре саванне / лугах северной Африки между 14 000-10 000 лет назад. Согласно Wood et al. (2005) и Rosa et al. (2007), такие перемещения населения изменили ранее существовавшее популяционное Y-хромосомное разнообразие в Центральной, Южной и Южной Восточной Африке, заменив предыдущие частоты гаплогруппы в этих областях на доминирующие в настоящее время клоны E1b1a1. Однако следы более ранних обитателей сегодня можно наблюдать в этих регионах по присутствию гаплогрупп Y ДНК A1a, A1b, A2, A3 и B-M60, которые распространены в определенные популяции, такие как мбути и койсан.

Распространение

Частота и разнообразие этой гаплогруппы самые высокие в регионе Западной Африки. В Африке E-V38 демонстрирует клинальное распределение с запада на восток, а также с юга на север. Другими словами, частота гаплогруппы уменьшается по мере продвижения от западной и южной Африки к восточной и северной частям континента.

Субклады

E1b1a1

E1b1a1 - это определяется маркерами DYS271 / M2 / SY81, M291, P1 / PN1, P189, P293, V43 и V95. E-M2 - разнообразная гаплогруппа с множеством ответвлений.

E1b1a2

E1b1a2 определяется мутацией SNP M329. Большинство наблюдаемых случаев было обнаружено в Восточной Африке. Он был обнаружен в древней ДНК, выделенной из эфиопской окаменелости возрастом 4500 лет, которая называется Мота. Эта гаплогруппа часто встречается в Юго-Западной Эфиопии, особенно среди омотиков говорящих народов.

Филогенетика

Филогенетическая история

До В 2002 г. в академической литературе было по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

a >E1b1b1b1<131b>E1b1b1b2a<135c E1ab1b

YCC 2002/2008 (Сокращение)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(ε)	(ζ)	( η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
E-P29	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E*	E	E	E	E	E	E	E	E	E	E
E-M33	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E1 *	E1	E1a	E1a	E1	E1	E1a	E1a	E1a	E1a	E1a
	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E1a	E1a	E1a1	E1a1	E1a	E1a	E1a1	E1a1	E1a1	E1a1	E1a1
E-M75	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E2a	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2	E2
	21	III	3A	13	Eu3	H2	B	E2b	E2b	E2b	E2b1	-	-	-	-	-	-	-
E-P2	25	III	4	14	Eu3	H2	B	E3 *	E3	E1b	E1b1	E3	E3	E1b1	E1b1	E1b1	E1b1	E1b1
E-M2	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a*	E3a	E1b1	E1b1a	E3a	E3a	E1b1a	E1b1a	E1b1a	E1b1a1	E1b1a1
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a1	E3a1	E1b1a1	E1b1a1	E3a1	E3a1	E1b1a1	E1b1a1	E1b1a1	E1b1a1a1a	E1b1a1a1a
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a2	E3a2	E1b1a2	E1b1a2	E3a2	E3a2	E1b1a2	E1b1a2	E1ba12	удалено	удалено
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a3	E3a3	E1b1a3	E1b1a3	E3a3	E3a3	E1b1a3	E1b1a3	E1b1a3	E1b1a1a1c	E1b1a1a1c
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a4	E3a4	E1b1a4	E1b1a4	E3a4	E3a4	E1b1a4	E1b1a4	E1b1a4	E1b1a1a1g1c	E1b1a1a1g1c
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a5	E3a5	E1b1a5	E1b1a5	E	E3a5	E1b1a5	E1b1a5	E1b1a5	E1b1a1a1d	E1b1a1a1d
	8	III	5	15	Eu2	H2	B	E3a6	E3a6	E1b1a6	E1b1a6	E3a6	E3a6	E1b1a6	E1b1a6	E1b1a6	E1b1a1 a1e	E1b1a1a1e
E-M35	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b*	E3b	E1b1b1	E1b1b1	E3b1	E3b1	E1b1b1	E1b1b1	E1b1b1	удалено	удалено
E-M78	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b1 *	E3b1	E1b1b1a	E1b1b1a1	E3b1a	E3b1a	E1b1b1a	E1b1b1a	E1b1b1a	E1b1b1a1	E1b1b1a1
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	54 E3b1a>	E3b1a	E1b1b1a3a	E1b1b1a1c1	E3b1a3a	E3b1a3a	E1b1b1a3a	E1b1b1a3a	E1a	E1b1b1a3a	E1b1b1a1c1	E1b1b1a1c1
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b2*	E3b2	E1b1b1b	E3b1b	E3b1b	E1b1b1b	E1b1b1b	E1b1b1b	E1b1b1b1	E1b1b1b1a
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b2a	E3b2a	E1b1b1b1	E1b1b1b1a	E3b1b1	E3b>	E1b1b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1	E1b1b1b1a	E1b1b1b1a1
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b 2b	E3b2b	E1b1b1b2	E1b1b1b1b1	E3b1b2	E3b1b2	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b	E1b1b1b2a	E1b1b1b2a	E1b1b1b1a2a
E-M123	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b3*	E3b3	E1b1b1c	E1b1b1c	E3b1c	E3b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1c	E1b1b1b2a
	25	III	4	14	Eu4	H2	B	E3b3a*	E3b3a	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E3b1c1	E3b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1c1	E1b1b1b1b2a1 Eu4	H2	B	E3ba1	E3b3a1	E1b1b1c1a	E1b1b1c1a1	E3b1c1a	E3b1c1a	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1c1a1	E1b1b1b2a1a1

Исследовательские публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании YCC дерево.

αДжоблинг и Тайлер-Смит 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFJobling_and_Tyler-Smith2000 (help ) и Каладжиева 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFKaladjieva2001 (help )
βUnderhill 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFUnderhill2000 (help )
γHammer 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFHammer2001 (help )
δKarafet 2001 harvnb ошибка: нет цели: CITEREFKarafet2001 (help )
εSemino 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSemino2000 (help )
ζSu 1999 harvnb error: нет цели: CITEREFSu1999 (help )
ηCapelli 2001 harvnb error: нет цели: CITEREFCapelli2001 (help )

Tree

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогрупп основано на дереве Y-Chromosome Consortium (YCC) 2008 Tree, дерево гаплогруппы E ISOGG Y-ДНК и последующие опубликованные исследования.

E1b1a (L222.1, V38, V100)
- E1b1a1 (DYS271 / M2 / SY81, M291, P1 / PN1, P189, P293, V43, V95, Z1101, Z1107, Z1116, Z1120, Z1122, Z1123, Z1124, Z1125, Z1127, Z1130, Z11 33)
- E1b1a2 (M329)

"Y-хромосомный Адам "

A00

A0-T

A1a