Гаплогруппа A (Y-ДНК)

редактировать
Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека
Гаплогруппа A
Возможное время происхожденияпримерно 270000 лет назад или около 275000 лет назад (303-241000 лет назад) или 291000 лет назад или 359000 пар оснований (начало линии A00)
Возраст слияния275000 лет назад (разделен с другими линиями)
Возможное место происхожденияВозможно Западная или Центральная Африка
ПредокY-MRCA человека (A00-T)
Потомкипервичный: A00 (AF6 / L1284), A0-T. (их подклады включают гаплогруппы A00a, A00b, A00c, A0, A1 и BT.)
Наивысшие частотыСубклады макрогаплогрупп, обнаруженные среди различных групп населения в Северо-Западной и Центральной Африке

Гаплогруппа A, также известная как A-V148 и A-CTS2809 / L991, является гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека. Это основополагающая гаплогруппа для всех известных патрилинейных линий, переносимых современными людьми, и, таким образом, Y-хромосома l Адам.

Ранее также известный как «клада I», носители существующих подклассов гаплогруппы A полностью обнаружены в Африке (или среди потомков недавно перемещенных африканских популяций), в отличие от потомка гаплогруппы BT (клады II-X), носители которой участвовали в миграции из Африки анатомически современных людей.

Самые базальные субклады гаплогруппы A по возрасту расхождения составляют «A00», «A0», «A1» (также «A1a-T») и «A2-T». Гаплогруппа BT, которая является предком всех неафриканских гаплогрупп, является субкладом A2-T.

Содержание

  • 1 Происхождение
  • 2 Распространение
    • 2.1 Африка
      • 2.1.1 Великие африканские озера
      • 2.1.2 Центральная Африка
      • 2.1.3 Африканский Рог
      • 2.1. 4 Северная Африка
      • 2.1.5 Верхний Нил
      • 2.1.6 Южная Африка
    • 2.2 Азия
    • 2.3 Европа
  • 3 Структура и распределение субкладов
    • 3.1 Филогенетическая структура
    • 3.2 Распространение субкладов
      • 3.2.1 A00 (A00-AF6)
      • 3.2.2 A0 (A-V148)
      • 3.2.3 A1 (A-P305)
      • 3.2.4 A1a (A-M31)
      • 3.2.5 A1b1a1a (A-M6)
      • 3.2.6 A1b1b (A-M32)
      • 3.2.7 A1b1b1 (A-M28)
      • 3.2.8 A1b1b2a (A-M51)
      • 3.2. 9 A1b1b2b (A-M13)
  • 4 Номенклатура и таксономическая история
  • 5 См. Также
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки

Происхождение

Прогнозируемое пространственно-частотное распределение гаплогруппы A в Африке.

Существуют терминологические трудности, но поскольку «гаплогруппа A» стала обозначать «основную гаплогруппу» (то есть современной человеческой популяции), гаплогруппа A не определяется какой-либо мутацией, а относится к любой гаплогруппе, которая не является потомком так logroup BT, т.е. определяется отсутствием определяющей мутации этой группы (M91). Согласно этому определению, гаплогруппа A включает все мутации, которые произошли между Y-MRCA (примерно 270 тыс. Лет назад) и мутацией, определяющей гаплогруппу BT (примерно 80–70 тыс. Лет назад), включая любые существующие субклады. это еще предстоит открыть.

Носители гаплогруппы A (т.е. отсутствие определяющей мутации гаплогруппы BT) были обнаружены в районах, населенных охотниками-собирателями Южной Африки, особенно среди народа сан. Кроме того, самые базальные линии митохондриальной ДНК L0 также в значительной степени ограничены San. Тем не менее, линия A из южной части Африки является подклассом линии A, обнаруженной в других частях Африки, что позволяет предположить, что субгаплогруппа A прибыла в Южную Африку из других мест.

Две самые базальные линии гаплогруппы A, A0 и A1 (до объявления об открытии гаплогруппы A00 в 2013 году) были обнаружены в Западной Африке, Северо-Западной Африке и Центральной Африке. Cruciani et al. (2011) предполагают, что эти линии могли возникнуть где-то между Центральной и Северо-Западной Африкой. Scozzari et al. (2012) также поддержали «гипотезу происхождения гаплогруппы A1b [то есть A0 ] в северо-западном квадранте Африканского континента».

Гаплогруппа A1b1b2 была обнаружена среди древних окаменелости, обнаруженные в заливе Балито в Квазулу-Натал, Южная Африка, которые датируются примерно 2149-1831 гг. до н.э. (2/2; 100%).

Распространение

По определению гаплогруппы A как "не BT ", она почти полностью ограничена Африкой, хотя сообщается об очень небольшой горстке носителей. в Европе и Западной Азии.

Клада достигает своих самых высоких современных частот в популяциях бушменов охотников-собирателей Южной Африки, за которым следуют многие нилотские группы в Восточной Африке. Однако самые старые подклассы гаплогруппы A встречаются исключительно в Центральной - Северо-Западной Африке, где она (и, соответственно, патрилинейный предок современных людей) считается чтобы возникнуть. Оценки ее временной глубины сильно различались: в отдельных исследованиях 2013 г. либо около 190 тыс. Лет назад, либо около 140 тыс. Лет назад, а с включением ранее неизвестной гаплогруппы «A00» - примерно до 270 тыс. Лет назад в исследованиях 2015 г.

Кладу также довольно часто наблюдали в определенных популяциях Эфиопии, а также в некоторых группах пигмеев в Центральной Африке и реже Нигер-Конго говорящие, которые в основном принадлежат к кладе E1b1a. Гаплогруппа E в целом, как полагают, возникла в Северо-Восточной Африке, а позже была завезена в Западную Африку, откуда она распространилась около 5000 лет назад в Центральную, Южную и Юго-Восточную Африку с 197>Расширение банту. Согласно Wood et al. (2005) и Rosa et al. (2007), такие относительно недавние перемещения населения из Западной Африки изменили ранее существовавшее популяционное Y-хромосомное разнообразие в Центральной, Южной и Юго-Восточной Африке, заменив предыдущие гаплогруппы в этих областях доминирующими в настоящее время линиями E1b1a. Однако следы предковых жителей сегодня можно наблюдать в этих регионах по присутствию гаплогрупп ДНК Y A-M91 и B-M60, которые распространены в определенных реликтовых популяциях, таких как Mbuti. Пигмеи и койсанский.

гаплогруппа A частоты
Африка
Исследуемая популяцияЧастота. (в%)
Цумкве Сан (Намибия)66%
Нама (Намибия)64
Динка (Судан)62
Шиллук (Судан)53
Нуба (Судан)46
Койсан 44
Эфиопские евреи 41
! Кунг / Секеле~ 40
Боргу (Судан)35
Нуэр (Судан)33
Мех (Судан)31
Масаи (Кения)27
Нара (Эритрея)20
Масалит (Судан)19
Амхара (Эфиопия)~ 16
Эфиопы 14
банту (Кения)14
Мандара (Камерун)14
Хауса (Судан)13
Кхве (Южная Африка)12
Фульбе (Камерун)12
Дама (Намибия)11
Оромо (Эфиопия)10
Кунама (Эритрея)10
Южно-семитский (Эфиопия)10
Египтяне )3

В составной выборке из 3551 африканского мужчины частота гаплогруппы A составила 5,4%. Самые высокие частоты гаплогруппы A были зарегистрированы среди койсанцев Южной Африки, бета-израильтян и нило-сахарцев из Судана.

Африка

Великие африканские озера

Банту в Кении (14%, Луис и др. 2004) и Ирак в Танзании (3/43 = От 7,0% (Луис и др., 2004) до 1/6 = 17% (Найт и др., 2003)).

Центральная Африка

Гаплогруппа A3b2-M13 наблюдалась в популяциях северного Камеруна (2/9 = 22% тупури, 4/28 = 14%, 2 / 17 = 12% Фульбе ) и восточная ДРК (2/9 = 22% Алур, 1/18 = 6% Хема, 1/47 = 2% Мбути ).

Гаплогруппа A-M91 (xA1a-M31, A2-M6 / M14 / P3 / P4, A3-M32) наблюдалась у бакола жителей южного Камеруна (3/33 = 9%).

Без тестирования на какой-либо субклад Y-ДНК гаплогруппы A наблюдалась в образцах нескольких популяций Габона, включая 9% (3/33) образца Бака, 3% (1/36) выборки, 2% (1/46) выборки Дума, 2% (1/57) выборки, и 2% (1/60) выборки Цого.

Африканского Рога

гаплогруппа A обнаруживаются на низких и умеренных частотах в Африканском Роге. Наиболее часто клады наблюдаются среди 41% выборки Beta Israel, встречающейся среди 41% одной выборки из этой популяции (Cruciani et al. 2002). В других частях региона гаплогруппа A зарегистрирована в 14,6% (7/48) выборке Amhara, 10,3% (8/78) в выборке Oromo и 13,6% (12/88) другого образца из Эфиопии.

Северная Африка

В Северной Африке гаплогруппа в значительной степени отсутствует. Его субклад A1 наблюдался с очень высокой частотой следа среди марокканцев.

Верхний Нил

Гаплогруппа A3b2-M13 распространена среди южносуданцев (53%), особенно суданцев динка (61,5%). Гаплогруппа A3b2-M13 также наблюдалась в другой выборке южного суданского населения с частотой 45% (18/40), включая 1/40 A3b2a-M171.

Далее вниз по течению. в долине Нила субклад A3b2 также наблюдался с очень низкой частотой в выборке египетских мужчин (3%).

Южная Африка

Одно исследование 2005 года обнаружило гаплогруппу A в выборках различных койсаноязычных племен с частотой от 10% до 70%. Эта конкретная гаплогруппа не была обнаружена в выборке Хадзабе из Танзании, населения, которое иногда предлагается как остаток населения позднего каменного века койсанидов.

Азия

В Азии гаплогруппа A с низкой частотой наблюдалась в Малой Азии и на Ближнем Востоке среди эгейских турок, палестинцев, иорданцев, йеменцев.

Европа

Гаплогруппа A1a (A-M31), по-видимому, присутствует среди очень небольшого числа фенотипически мужчин северной Европы с досовременных времен - лучшим документированным примером являются мужчины с фамилией Ревис., который возник в Йоркшире, Англия.

A3a2 (A-M13; ранее A3b2) наблюдался на очень низких частотах на некоторых островах Средиземного моря. Без тестирования на какой-либо субклад гаплогруппа A была обнаружена в выборке греков из Митилини на Эгейском острове Лесбос и в выборках португальцев из южной Португалии, центральной Португалии и Мадейра. Авторы одного исследования сообщили, что обнаружили гаплогруппу A у 3,1% (2/65) выборки киприотов, хотя они окончательно не исключили возможность того, что любой из этих людей может принадлежать к редкий субклад гаплогруппы BT, включая гаплогруппу CT.

Структура и распределение субкладов

Филогенетическая структура

Y-хромосомный Адам . A00 (AF6 / L1284)

  • A00a (L1149, FGC25576, FGC26292, FGC26293, FGC27741)
  • A00b (A4987 / YP3666, A4981, A4982 / YP2683, A4984 / YP29986, A499285, A4984 / YP29986, A499285 / YP3731)

A0-T (L1085)

  • A0(CTS2809 / L991) ранее A1b
  • A1(P305) ранее A1a-T, A0 и A1b
    • A1a (M31)
    • A1b (P108) ранее A2-T
      • A1b1 (L419 / PF712)
        • A1b1a (L602, V50, V82, V198, V224)
          • A1b1a1 (M14) ранее A2
            • A1b1a1a (M6)
              • A1b1a1a1 (P28) ранее A1b1a1a1b и A2b
        • A1b1b (M32) ранее A3
          • A1b1b1 (M28) ранее A3a
          • A1b1b2 (L427)
            • A1b1b2a ( M51 / Page42) ранее A3b1
              • A1b1b2a1 (P291)
            • A1b1b2b (M13 / PF1374) ранее A3b2
              • A1b1b2b1 (M118)
      • BT (M91)

( Вышеупомянутое филогенетическое дерево основано на исследованиях ISOGG, YCC и других, рецензируемых исследованиях.

Распределение субкладов

A00 (A00-AF6)

Mendez et al. (2013) объявили об открытии ранее неизвестной гаплогруппы, для которой они предложили обозначение «A00». Его предполагаемый возраст составляет около 359 тыс. Лет назад, поэтому он примерно современен, но немного предшествует известному внешнему виду самых ранних известных анатомически современных людей, таких как Джебель Ирхуд. A00 также иногда называют «Y-хромосомой Перри» (или просто «Y-хромосомой Перри»). Эта ранее неизвестная гаплогруппа была обнаружена в 2012 году в Y-хромосоме мужчины афроамериканца, который представил свою ДНК для коммерческого генеалогического анализа.) Последующее открытие других мужчин, принадлежащих к A00, привело к реклассификации Перри Y как A00a (A-L1149).

Исследователи позже обнаружили, что A00 был у 11 Mbo мужчин из Западного Камеруна (из выборки 174 (6,32%). Последующие исследования показали, что общая частота A00 был даже выше среди Mbo, т.е. 9,3% (8 из 86) позже было обнаружено, что они попадают в диапазон A00b (A-A4987).

Дальнейшие исследования 2015 года показывают, что современные Население с самой высокой концентрацией A00 - это (или нвех), йемба группа Камеруна (фр: Bangoua (peuple) ): 27 из 67 (40,3%) выборок были положительными на A00a (L1149). Один человек из Bangwa не вписывался ни в A00a, ни в A00b.

Генетики секвенировали данные ДНК всего генома четырех человек, похороненных на месте Шум Лака Камерун между 8000–3000 лет назад, которые были наиболее генетически похожи на пигмеев мбути. Один человек нес глубоко дивергентную гаплогруппу Y-хромосомы A00.

A0 (A-V148)

Имена гаплогрупп «A-V148» и «A-CTS2809 / L991» относятся к та же гаплогруппа.

A1 (A-P305)

A1 (P305; ранее известный как A0 и A1b) встречается только у пигмеев бакола (Южный Камерун ) на 8,3% и берберы из Алжира на 1,5%. Также обнаружен в Гане.

A1a (A-M31)

Субклад A1a (M31) был обнаружен примерно в 2,8% (8/282) из ​​семи выборок различных этнических групп. в Гвинее-Бисау, особенно среди Папель-Манджако-Манканья (5/64 = 7,8%). В более раннем исследовании, опубликованном в 2003 году, Gonçalves et al. сообщили об обнаружении A1a-M31 в 5,1% (14/276) образцов из Гвинеи-Бисау и в 0,5% (1/201) пары образцов из Кабо-Верде. Авторы другого исследования сообщили об обнаружении гаплогруппы A1a-M31 в 5% (2/39) выборки мандинка из Сенегамбии и 2% (1/55) выборки. из догонов из Мали. Гаплогруппа A1a-M31 также была обнаружена у 3% (2/64) выборки берберов из Марокко и у 2,3% (1/44) выборки неопределенной этнической принадлежности. от Мали.

В 2007 году семь мужчин из Йоркшира, Англии с необычной фамилией Ревис были идентифицированы как выходцы из субклада A1a (M31). Было обнаружено, что у этих мужчин был общий предок по мужской линии с 18 века, но никакой предыдущей информации об африканском происхождении не было известно.

A1b1a1a (A-M6)

Субклад A1b1a1a ( M6; ранее A2 и A1b1a1a-M6) обычно встречается у койсанских народов. Авторы одного исследования сообщили об обнаружении гаплогруппы A-M6 (xA-P28) в 28% (8/29) выборке Цумкве Сан и 16% (5/32) в выборке ! Kung / Sekele и гаплогруппа A2b-P28 в 17% (5/29) выборки Цумкве Сан, 9% (3/32) выборки ! Kung / Sekele, 9% (1 / 11) выборки Nama и 6% (1/18) выборки Dama. Авторы другого исследования сообщили об обнаружении гаплогруппы A2 у 15,4% (6/39) выборки койсанских мужчин, включая 5/39 A2-M6 / M14 / M23 / M29 / M49 / M71 / M135 / M141 (xA2a-M114).) и 1/39 A2a-M114.

A1b1b (A-M32)

Клада A1b1b (M32; ранее A3) содержит самые густонаселенные ветви гаплогруппы A и в основном встречается в Восточная Африка и Южная Африка.

A1b1b1 (A-M28)

Субклад A1b1b1 (M28; ранее A3a) редко встречается на Африканском Роге.. В 5% (1/20) смешанной выборки носителей южносемитских языков из Эфиопии, 1,1% (1/88) выборки эфиопов и 0,5% (1/201) сомалийцев.

A1b1b2a (A-M51)

Субклад A1b1b2a (M51; ранее A3b1) наиболее часто встречается у койсанских народов (6/11 = 55% Nama, 11 / 39 = 28% Койсан, 7/32 = 22% ! Кунг / Секеле, 6/29 = 21% Цумкве Сан, 1/18 = 6% Дама). Однако он также был обнаружен с меньшей частотой среди народов банту из Южной Африки, в том числе 2/28 = 7% сото-тсвана, 3/53 = 6% нехойсанских южноафриканцев, 4/80 = 5% коса и 1/29 = 3% зулу.

A1b1b2b (A-M13)

Субклад A1b1b2b (M13; ранее A3b2) в основном распространен среди нилотских популяций в Восточной Африке и северном Камеруне. Он отличается от субкладов A, которые встречаются в койсанских образцах и лишь отдаленно связаны с ними (на самом деле это только один из многих субкладов в гаплогруппе A). Это открытие предполагает древнее расхождение.

В Судане гаплогруппа A-M13 была обнаружена у 28/53 = 52,8% южносуданцев, 13/28 = 46,4% Нубийцы центрального Судана, 25/90 = 27,8% западных суданцев, 4/32 = 12,5% местных хауса и 5/216 = 2,3% северных Суданцы.

В Эфиопии в одном исследовании сообщалось об обнаружении гаплогруппы A-M13 у 14,6% (7/48) выборки амхара и 10,3% (8 / 78) образца Оромо. В другом исследовании сообщается об обнаружении гаплогруппы A3b2b-M118 у 6,8% (6/88) и гаплогруппы A3b2 * -M13 (xA3b2a-M171, A3b2b-M118) у 5,7% (5/88) смешанной выборки эфиопов, что составляет всего 12,5% (11/88) A3b2-M13.

Гаплогруппа A-M13 также иногда наблюдалась за пределами Центральной и Восточной Африки, например, в Эгейском регионе из Турция (2/30 = 6,7%), йеменские евреи (1/20 = 5%), Египет (4/147 = 2,7%, 3/92 = 3,3 %), палестинские арабы (2/143 = 1,4%), Сардиния (1/77 = 1,3%, 1/22 = 4,5%), столица Иордании, Амман (1/101 = 1%) и Оман (1/121 = 0,8%).

Гаплогруппа A-M13 была обнаружена среди трех окаменелостей периода неолита, раскопанных на стоянке Кадрука в Судане.

Номенклатура и таксономическая история

До 2002 года в академических В литературе не менее семи систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Пересмотренное генеалогическое древо y-хромосомы, проведенное Cruciani et al. 2011 г. по сравнению с генеалогическим древом из Karafet et al. 2008. (Показанный здесь «A1a-T» теперь известен как A1, а «A2-T» теперь известен как A1b.)

Первоначальное секвенирование Y-хромосомы человека показало, что первое расщепление в Y-хромосоме генеалогическое древо произошло с мутациями, которые отделили гаплогруппу BT от Y-хромосомы Адама и гаплогруппу A в более широком смысле. Впоследствии стало известно о многих промежуточных расщеплениях между Y-хромосомой Адама и BT.

Существенный сдвиг в понимании дерева Y-ДНК произошел с публикацией (Cruciani 2011) harv error: no target: CITEREFCruciani2011 (help ). Хотя маркер SNP M91 рассматривался как ключ к идентификации гаплогруппы BT, было установлено, что область, окружающая M91, была горячей точкой мутаций, которая склонна к повторяющимся обратным мутациям. Более того, отрезок 8T гаплогруппы A представлял наследственное состояние M91, а 9T гаплогруппы BT - производное состояние, которое возникло после вставки 1T. Это объясняет, почему субклады A1b и A1a, самые глубокие ветви гаплогруппы A, оба обладают 8Т-отрезком. Точно так же маркер P97, который также использовался для идентификации гаплогруппы A, обладал наследственным состоянием в гаплогруппе A, но производным состоянием в гаплогруппе BT. В конечном итоге тенденция M91 к обратным мутациям и (следовательно) его ненадежность привели к тому, что M91 был отклонен ISOGG в качестве определяющего SNP в 2016 году. И наоборот, P97 был сохранен в качестве определяющего маркера гаплогруппы BT.

YCC 2002/2008 (Сокращение)(α)(β)(γ)(δ)(ε)(ζ)( η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
7I1A1H1AA1A1A1A1aA1A1A1aA1aA1aA1aA1a
27I23H1AA2 *A2A2A2A2A2A2A2A2A2A1b1a1a
27I23H1AA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA2aA1b1a1a1a
27I24H1AA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA2bA1b1a1a1b
********A3A3A3A3A3A3A3A3A3A1b1b
7I1A1H1AA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA3aA1b1b1
7I1A1H1AA3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A3b1A1b1b2a
7I1A2Eu1H1AA3b2 *A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A3b2A1b1b2b
7I1A2Eu1H1AA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aA3b2aудалено
7I1A2Eu1H1AA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA3b2bA1b1b2b1

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены при создании Дерева YCC.

  • αДжоблинг и Тайлер-Смит 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFJobling_and_Tyler-Smith2000 (help ) и Каладжиева 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFKaladjieva2001 (help )
  • βUnderhill 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFUnderhill2000 (help )
  • γHammer 2001 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFHammer2001 (help )
  • δKarafet 2001 harvnb ошибка: нет цели: CITEREFKarafet2001 (help )
  • εSemino 2000 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSemino2000 (help )
  • ζSu 1999 ошибка harvnb: нет цели: CITEREFSu1999 (help )
  • ηCapelli 2001 harvnb error: no target: CITEREFCapelli2001 (help )

См. также

субклады Y-ДНК A

Ссылки

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы, относящиеся к гаплогруппе A Y-ДНК.
"Y-хромосомный Адам "
A00 A0-T
A0 A1
A1a
BT
B CT
DE CF
D E C F
GHIJK
G HIJK
IJK H
IJ K
I J LT K2
L T K2a K2b
K-M2313 K2b1 P
NO S M P1
N O Q R
Последняя правка сделана 2021-05-22 13:08:42
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте