HOMER1

редактировать
HOMER1
белка HOMER1 PDB 1ddv.png
Идентификаторы
Псевдонимы HOMER1, HOMER, HOMER1A, HOMER1B, HOMER1C, SYN47, Ves-1, homer scaffol ding белок 1, белок 1 гомера каркаса
Внешние идентификаторыOMIM: 604798 MGI: 1347345 HomoloGene: 3155 Генные карты: HOMER1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человека)
Chr. Хромосома 5 (человек)
Хромосома 5 (человека) Геномное местоположение для HOMER1 Геномное местоположение для HOMER1
Полоса 5q14. 1Начало79,372,636 bp
Конец79,514,134 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HOMER1 213793 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entre z

9456

26556

Ensembl

ENSG00000152413

ENSMUSG00000007617

UniProt

Q86YM7

Q9Z2Y3

RefSeq (mRNA)

>NM_001277078

NM_001284189. NM_011982. NM_147176. NM_152134. NM_001347598

RefSeq (белок)

NP_001264006. NP_001264007. NP_001264007. NP_001264007. NP_001264534 338>NP_036112. NP_671705. NP_687036

Местоположение (UCSC)Chr 5: 79,37 - 79,51 МБ Chr 13: 93,3 - 93,41 МБ
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

гомолог белка Гомера 1 или Homer1 - нейрональный белок, который у человека кодируется HOMER1 ген. Другие названия - Vesl и PSD-Zip45.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Распределение тканей
  • 3 Функция
  • 4 См. Также
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
Структура

Homer1 белок имеет N-концевой домен EVH1, участвующий во взаимодействии с белками, и C-концевой домен со спиральной спиралью, участвующий в самоассоциации. Он состоит из двух основных вариантов сращивания, краткого (Homer1a) и длинного (Homer1b и c). Homer1a имеет только домен EVH1 и является мономерным, тогда как Homer1b и 1c имеют оба домена EVH1 и coiled-coil и являются тетрамерными. Спиральную катушку можно дополнительно разделить на половину N-вывода и половину C-вывода. Предполагается, что N-концевая половина домена спиральной спирали будет параллельным димером, тогда как половина С-конца является гибридом димерной и антипараллельной тетрамерной спиральной спирали. В целом, длинный Гомер, по прогнозам, имеет структуру, похожую на гантель, где две пары доменов EVH1 расположены с двух сторон от длинного (~ 50 нм) домена спиральной спирали. У млекопитающих есть Homer2 и Homer3 в дополнение к Homer1, которые имеют аналогичную доменную структуру. Они также имеют аналогичные формы с альтернативным соединением.

Димерно-тетрамерный домен спиральной спирали Homer1b. Визуализация PDB на основе 3CVE.
Распределение в тканях

Homer1 широко экспрессируется в центральной нервной системе, а также в периферических тканях, включая сердце, почки, яичник, семенник и скелетная мышца. Субклеточно в нейронах Homer1 сосредоточен в постсинаптических структурах и составляет основную часть постсинаптической плотности.

Функция

домен EVH1 взаимодействует с мотивом PPXXF. Этот мотив последовательности существует в группе 1 метаботрофного рецептора глутамата (mGluR1 и mGluR5), IP3рецепторов (IP 3 R), Shank, каналы семейства канонических (TRPC) потенциальных рецепторов, дребрин, динамин3, CENTG1 и рецептор рианодина. Предполагается, что благодаря своей тетрамерной структуре длинные формы Homer (такие как Homer1b и Homer1c) перекрестно связывают различные белки. Например, mGluR группы 1 перекрестно связан с его сигнальным рецептором IP 3. Кроме того, предполагается, что посредством сшивания другого мультимерного белка Shank он содержит ядро ​​постсинаптической плотности.

. Примечательно, что экспрессия Homer1a индуцируется нейрональной активностью, в то время как экспрессия Homer1b и 1c является конститутивной. Таким образом, Homer1a классифицируется как ранний ген. Homer1a, действует как естественный, который блокирует взаимодействие между длинными формами и их белками-лигандами, конкурируя с участком связывания EVH1 на белках-лигандах. Таким образом, короткая форма Гомера разъединяет передачу сигналов mGluR, а также сокращает структуру дендритного шипа. Таким образом, сокращенная форма Гомера считается частью механизма гомеостатической пластичности, который снижает чувствительность нейронов, когда входная активность слишком высока. Длинная форма Homer1c играет роль в синаптической пластичности и стабилизации синаптических изменений во время долгосрочной потенциации.

Сообщается, что домен спиральной спирали взаимодействует и активируется Cdc42. Взаимодействие с Cdc42 ингибирует активность Cdc42 по ремоделированию структуры дендритных шипов.

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-22 09:33:27
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте