Порядки генов представляют собой перестановку расположения генома. Было проведено изрядное количество исследований, пытающихся определить, эволюционируют ли гены порядки в соответствии с молекулярными часами (гипотеза молекулярных часов ) или скачками (прерывистое равновесие ).
Некоторые исследования порядков генов в митохондриальных геномах животных показывают, что скорость мутаций порядков генов не является постоянной в некоторых степенях.
.