GRIA4

редактировать
GRIA4
Идентификаторы
Псевдонимы GRIA4, GLUR4, GLUR4C, GLURD, GluA4, глутамат-ионотропный рецептор Подблок 4 типа AMPA, NEDSGA
Внешние идентификаторыOMIM: 138246 MGI: 95811 HomoloGene: 20227 Генные карты: GRIA4
Местоположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr. Хромосома 11 (человек)
Хромосома 11 (человек) Геномное расположение GRIA4 Геномное расположение GRIA4
Полоса 11q22.3Начало105,609,994 bp
Конец105,982,092 bp
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

2893

14802

Ensembl

ENSG00000152578

ENSMUSG00000025892

UniProt

P48058

Q9Z2W8

RefSeq (m 219>NM_000829. NM_001077243. NM_001077244. NM_001112812

NM_001113180. NM_001113181. NM_019691

RefSeq (белок)

NP_0008102701200>NP_0008102701 NP30711 NP30700700

NP_001106651. NP_001106652. NP_062665

Местоположение (UCSC)Chr 11: 105,61 - 105,98 Мб Chr 9: 4,42 - 4,8 Мб PubMed поискВикиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Глутаматный рецептор 4 - это белок, который у человека кодируется геном GRIA4 .

Этот ген член семейства ионных каналов, управляемых L-глутаматом, которые обеспечивают быструю синаптическую возбуждающую нейротрансмиссию. Эти каналы также реагируют на агонист глутамата, альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазолпропионат (AMPA). Некоторые гаплотипы этого гена показывают положительную связь с шизофренией. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.

Содержание
  • 1 Взаимодействия
  • 2 Редактирование РНК
    • 2.1 Тип
    • 2.2 Местоположение
    • 2.3 Сохранение
    • 2.4 Регулирование
    • 2.5 Последствия
      • 2.5.1 Структура
      • 2.5.2 Функция
  • 3 См. Также
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 Внешние ссылки
Взаимодействия

Было показано, что GRIA4 взаимодействует с CACNG2, GRIP1, PICK1 и PRKCG.

редактированием РНК

Некоторые ионные каналы и рецепторы нейротрансмиттеров пре-мРНК являются субстратами для ADAR. Сюда входят 5 субъединиц глутаматного рецептора, ионотропные субъединицы глутаматного рецептора AMPA (Glur2, Glur3, Glur4) и субъединицы каинатного рецептора (Glur5, Glur6). Ионные каналы, управляемые глутаматом, состоят из четырех субъединиц на канал. Их функция заключается в обеспечении быстрой нейротрансмиссии в мозг. Разнообразие субъединиц определяется, как и сплайсинг РНК, событиями редактирования РНК отдельных субъединиц. Это приводит к необходимому разнообразию рецепторов. GluR4 является продуктом гена GRIA4, и его пре-мРНК подлежит редактированию РНК.

Редактирование РНК типа

от A до I катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре- мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются механизмом трансляции клеток как гуанозин. Есть три члена семейства ADAR, ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, тогда как ADAR 3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, близкой к области редактирующего сайта, с остатками обычно в соседнем интроне, но могут быть экзонной последовательностью. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая комплементарная последовательность (ECS).

Местоположение

Пре-мРНК этой субъединицы редактируется в одной позиции. Сайт редактирования R / G расположен в экзоне 13 между областями от M3 до M4. Редактирование приводит к замене кодона с аргинина (AGA) на глицин (GGA). Местоположение редактирования соответствует двудольному домену взаимодействия лиганда рецептора. ((((((37)))))) Сайт R / G находится в аминокислоте 769 непосредственно перед переворотом длиной 3 аминокислоты. и флоп-модули, представленные альтернативным соединением. Формы Flip и Flop присутствуют как в отредактированных, так и в неотредактированных версиях этого белка. Редактирующая комплементарная последовательность (ECS) находится в интронной последовательности рядом с экзоном. Интронная последовательность включает 5'-сайт сплайсинга, а предполагаемая двухцепочечная область имеет длину 30 пар оснований. Остаток аденозина несовместим в кодируемом геномом транскрипте, однако это не так после редактирования. Несмотря на сходные последовательности с сайтом Q / R GluR-B, редактирование этого сайта не происходит в пре-мРНК GluR-3. Редактирование приводит к тому, что целевой аденозин, который не совпадает до редактирования в структуре двухцепочечной РНК, становится сопоставленным после редактирования. Участвующая интронная последовательность содержит 5'-донорский сайт сплайсинга.

Сохранение

Редактирование также происходит у крыс.

Регламент

Редактирование GluR-3 осуществляется регулируется в мозгу крысы от низких уровней в эмбриональной стадии до значительного увеличения уровней редактирования при рождении. У человека редактируется 80-90% транскриптов GRIA3. Отсутствие редактирования сайта Q / R в этой субъединице рецептора глутамата связано с отсутствием необходимой интронной последовательности, необходимой для образования дуплекса.

Последствия

Структура

Редактирование приводит к изменению кодона с (AGA) на (GGA), замене R на G на сайте редактирования.

Функция

Редактирование на сайте R / G позволяет быстрее восстанавливаться после десенсибилизации. Неотредактированный Glu-R на этом сайте имеет более медленную скорость восстановления. Таким образом, редактирование позволяет устойчиво реагировать на быстрые стимулы. Здесь вероятно возникновение перекрестных помех между редактированием и склейкой. Редактирование происходит перед склейкой. Все рецепторы AMPA встречаются в альтернативно сплайсированных вариантах flip and flop. Рецепторы AMPA, которые присутствуют в форме Flop, теряют чувствительность быстрее, чем в обратной форме. Также считается, что редактирование влияет на сплайсинг на этом сайте

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественное достояние.

Последняя правка сделана 2021-05-21 09:22:32
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте