GRIA3

Глутаматный рецептор 3 - это белок что у человека кодируется геном GRIA3 .

• 1 Функция
• 2 Взаимодействия
• 3 Редактирование РНК
  • 3.1 Тип
  • 3.2 Местоположение
  • 3.3 Сохранение
  • 3.4 Регулирование
  • 3.5 Последствия
    • 3.5.1 Структура
    • 3.5.2 Функция
• 4 См. Также
• 5 Ссылки
• 6 Дополнительная литература
• 7 Внешние ссылки

Глутаматные рецепторы являются преобладающими рецепторами возбуждающих нейротрансмиттеров в головном мозге млекопитающих и активируются в различных нормальных нейрофизиологических процессах. es. Эти рецепторы представляют собой гетеромерные белковые комплексы с множеством субъединиц, каждая из которых обладает трансмембранными областями, и все они расположены так, что образуют лиганд-зависимый ионный канал. Классификация рецепторов глутамата основана на их активации различными фармакологическими агонистами. Этот ген принадлежит к семейству рецепторов альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазол пропионата (AMPA). Альтернативный сплайсинг в этом локусе приводит к появлению нескольких различных изоформ, которые могут различаться по своим свойствам передачи сигнала.

GRIA3, как было показано, взаимодействует с GRIP1 и PICK1.

Несколько ионных каналов и рецепторов нейротрансмиттеров пре- мРНК в качестве субстратов для ADAR. Сюда входят 5 субъединиц рецептора глутамата: субъединицы ионотропного рецептора глутамата AMPA (Glur2, Glur3, Glur4 ) и субъединицы каинатного рецептора ( Glur5, Glur6 ). Ионные каналы, управляемые глутаматом, состоят из четырех субъединиц на канал, причем каждая субъединица вносит свой вклад в структуру петли поры. Структура петли пор связана со структурой, обнаруженной в K-каналах (например, канал Kv1.1 человека). Пре-мРНК канала K v 1.1 человека также подлежит редактированию РНК от A до I. Функция рецепторов глутамата заключается в обеспечении быстрой нейротрансмиссии в мозг. Разнообразие субъединиц определяется, а также сплайсинг РНК событиями редактирования РНК отдельных субъединиц. Это приводит к неизбежно высокому разнообразию этих рецепторов. GluR3 является генным продуктом гена GRIA3, и его пре-мРНК подлежит редактированию РНК.

Тип

Редактирование РНК от A до I катализируется семейством аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре- мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются как гуанозин механизмом трансляции клеток. Существует три члена ADAR 1-3 семейства ADAR, причем ADAR1 и ADAR2 являются единственными ферментативно активными членами. ADAR3, как полагают, играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, близкой к области редактирующего сайта, с остатками обычно в соседнем интроне, но могут быть экзонной последовательностью. Область, в которой основание спаривается с областью редактирования, известна как редактируемая комплементарная последовательность (ECS)

Location

Пре-мРНК этой субъединицы редактируется в одной позиции. Сайт редактирования R / G расположен в экзоне 13 между областями M3 и M4. Редактирование приводит к изменению кодона с аргинина (AGA) на глицин (GGA). Место редактирования соответствует двудольному домену взаимодействия лиганда рецептора. Сайт R / G находится у аминокислоты 769 непосредственно перед модулями flip and flop длиной 38 аминокислот, введенными путем альтернативного сплайсинга. Формы Flip и Flop присутствуют как в отредактированных, так и в неотредактированных версиях этого белка. Редактирующая комплементарная последовательность (ECS) находится в интронной последовательности рядом с экзоном. Интронная последовательность включает 5'-сайт сплайсинга. Предсказанная двухцепочечная область имеет длину 30 пар оснований. Остаток аденозина несовместим в кодируемом геномом транскрипте, однако это не так после редактирования. Несмотря на сходные последовательности с сайтом Q / R GluR-B, редактирование на этом сайте не происходит в пре-мРНК GluR-3. Редактирование приводит к тому, что целевой аденозин, который не совпадает до редактирования в структуре двухцепочечной РНК, становится сопоставленным после редактирования. Участвующая интронная последовательность содержит 5'-донорный сайт сплайсинга.

Сохранение

Редактирование также происходит у крыс.

Регламент

Редактирование GluR-3 осуществляется регулируется в мозгу крысы от низких уровней в эмбриональной стадии до значительного увеличения уровней редактирования при рождении. У человека редактируется 80-90% транскриптов GRIA3. Отсутствие редактирования сайта Q / R в этой субъединице рецептора глутамата связано с отсутствием необходимой интронной последовательности, необходимой для образования дуплекса.

Последствия

Структура

Редактирование приводит к изменению кодона с (AGA) на (GGA), замене R на G на сайте редактирования.

Функция

Редактирование на сайте R / G позволяет быстрее восстанавливаться после десенсибилизации. Неотредактированный Glu-R на этом сайте имеет более медленную скорость восстановления. Таким образом, редактирование позволяет устойчиво реагировать на быстрые стимулы. Здесь вероятно возникновение перекрестных помех между редактированием и склейкой. Редактирование происходит перед склейкой. Все рецепторы AMPA встречаются в альтернативно сплайсированных вариантах flip and flop. Рецепторы AMPA, которые присутствуют в форме Flop, теряют чувствительность быстрее, чем в обратной форме. Считается, что редактирование также влияет на сварку на этом сайте.

• рецептор AMPA

• GRIA3 + белок, + человеческий в Национальной библиотеке США of Medicine Медицинские предметные рубрики (MeSH)
• «DARNED».
• http://darned.ucc.ie
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9Z2W9 (рецептор глутамата 3) в PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.

Обратная связь: support@alphapedia.ru

Соглашение

О проекте