| GATA3 |
|---|
|
|
| Идентификаторы |
|---|
| Псевдонимы | GATA3, HDR, HDRS, связывающий белок GATA 3 |
|---|
| Внешние идентификаторы | OMIM: 131320 MGI: 95663 HomoloGene: 1550 Генные карты: GATA3 |
|---|
|
| Расположение гена (мышь) |
|---|
 | | Chr. | Хромосома 2 (мышь) |
|---|
   | | Полоса | 2 A1 | 2 6,69 cM | Начало | 9,857,078 bp |
|---|
| Конец | 9,890,034 bp |
|---|
|
|
| Онтология гена |
|---|
| Молекулярная функция | •Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II. •Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II. •Связывание с бокс-доменом HMG. •связывание с хроматином. •связывание иона металла. •связывание с ДНК. •GO: 0001158 проксимальная область корового промотора, специфичное для последовательности связывание ДНК. •специфическое для последовательности связывание ДНК. •GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая. •GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая. •рецептор интерлейкина-2 связывание. •связывание с последовательностью корового промотора, специфичное для ДНК. •связывание с последовательностью регуляторной области транскрипции, специфическое для связывания ДНК. •активность димеризации белка. •связывание с E-боксом. •связывание с GO: 0001948 с белком. •связывание с ионом цинка. •связывание фактора транскрипции. •Коактиватор транскрипции GO: 0001105. •GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II. •GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции. •GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, полимер РНК erase II-специфический. •GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции. |
|---|
| Клеточный компонент | •ядро клетки. •комплекс регулятора транскрипции. •ядерный хроматин. •нуклеоплазма. |
|---|
| Биологический процесс | •отрицательная регуляция клетки пролиферация. •регуляция установления полярности клеток. •образование зачатка мочеточника. •негативная регуляция клеточного цикла. •селекция Т-клеток тимуса. •ответ на этанол. •позитивная регуляция дифференцировки Т-клеток. •эритроцитов дифференцировка. •положительная регуляция секреции интерлейкина-5. •морфогенез внутреннего уха. •созревание клеток. •регуляция метилирования гистона H3-K27. •морфогенез правого желудочка сердца. •передача сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы. •Процесс биосинтеза норэпинефрина. •развитие уха. •гомеостаз количества клеток. •развитие симпатической нервной системы. •дифференцировка Т-хелперов 2. •регуляция клеточного ответа на рентген. •определение судьбы клеток. •постэмбриональное развитие оптимизация. •клеточный ответ на стимул BMP. •развитие мезонефроса. •дифференцировка нейронов. •регуляция апоптотического процесса нейронов. •передача сигнала. •клеточный ответ на цитокиновый стимул. •клеточный ответ на интерлейкин-4. •сигнальный путь рецептора Т-клеток. •миграция нейронов. •позитивная регуляция продукции интерлейкина-5. •регуляция CD4-позитивной дифференцировки альфа-бета-Т-клеток. •развитие паращитовидных желез. •негативная регуляция ДНК деметилирование. •позитивная регуляция продукции интерлейкина-4. •негативная регуляция пролиферации эпителиальных клеток молочных желез. •Дункан Кийге. •развитие тимуса. •развитие нервной системы. •развитие отических пузырьков. •регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •позитивная регуляция продукции цитокинов Т-хелперами 2. •регуляция дифференцировки эпителиальных клеток нефронных канальцев. •позитивная регуляция выработки тироидных гормонов. •миграция лимфоцитов. •негативная регуляция выработка интерлейкина-2. •регуляция развития проекций нейронов. •развитие матки. •ведение аксонов. •переход от мезенхимы к эпителию. •негативная регуляция пролиферации клеток, участвующих в развитии мезонефроса. •морфогенез аортального клапана. •клеточный ответ на фактор некроза опухоли. •негативная регуляция дифференцировки жировых клеток. •морфогенез анатомической структуры. •клеточный ответ на интерферон-альфа. •негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •дифференцировка Т-клеток. •ответ на вирус. •негативная регуляция апоптотического процесса эндотелиальных клеток. •регуляция процесса биосинтеза цитокинов. •врожденная иммунная система. •канонический сигнальный путь Wnt, участвующий в развитии метанефрических почек. •позитивная регуляция регуляторной области транскрипции Связывание ДНК. •положительная регуляция миграции эндотелиальных клеток. •положительная регуляция продукции интерлейкина-13. •в эмбриональном развитии матки. •отрицательно e регуляция продукции гамма-интерферона. •гуморальный иммунный ответ. •рост развития. •развитие почек. •положительная регуляция образования зачатка мочеточника. •положительная регуляция экспрессии гена. •секреция гамма-интерферона. •дифференцировка тучных клеток. •позитивная регуляция секреции интерлейкина-13. •позитивная регуляция ацетилирования гистона H3-K9. •позитивная регуляция дифференцировки клеток. •негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •развитие мужских гонад. •морфогенез нефрального протока. •развитие межжелудочковой перегородки. •позитивная регуляция продукции цитокинов. •развитие хрусталика в глазах камерного типа. •негативная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста фибробластов, участвующего в формировании зачатка мочеточника. •транскрипция, ДНК-шаблон. •отрицательная регуляция экспрессии гена. •секреция паратироидного гормона. •образование нефрального протока. •процесс иммунной системы. •отрицательная регуляция воспалительного ответа ponse. •развитие глоточной системы. •развитие эмбрионального органа. •ответ на эстроген. •свертывание крови. •отрицательная регуляция сигнального пути рецептора нейротрофического фактора, происходящего из глиальных клеток, участвующего в формировании зачатка мочеточника. •положительной регуляции трансдукция сигнала. •созревание мочеточника. •позитивная регуляция ацетилирования гистонов H3-K14. •позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон. •ответ на гамма-излучение. •клеточный морфогенез. •эмбриональное кроветворение. •Социализация Африка. •негативная регуляция подвижности клеток. •дифференцировка про-Т-клеток. •передача сигналов TOR. •гиперчувствительность IV типа. •защитный ответ. •секреция интерлейкина-4. •регуляция метилирования гистонов H3-K4. •развитие почечной системы. •позитивная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B. •активация клеток. •ответ на лекарство. •ремоделирование хроматина. •дифференцировка Т-клеток в тимусе. •развитие улитки. •транскрипция из Промотор РНК-полимеразы II. •деубиквитинирование белка. •формирование анатомической структуры, участвующее в морфогенезе. •регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток. •опосредованный цитокинами сигнальный путь. •развитие сердца. •морфогенез органов животных. •гистогенез. •развитие клеток. •развитие пищеварительного тракта. •развитие иммунной системы. •регуляция дифференцировки эпителиальных клеток. •морфогенез мочеточника. |
|---|
| Источники: Amigo / QuickGO |
|
| Orthologs |
|---|
| Виды | Человек | Мышь |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq) | | |
|---|
| RefSeq (протеин) | |
|---|
| Местоположение (UCSC) | Chr 10: 8,05 - 8,08 Мб | Chr 2: 9,86 - 9,89 МБ |
|---|
| PubMed поиск | | |
|---|
| Wikidata |
|
GATA3 представляет собой фактор транскрипции, который у человека кодируется геном GATA3 . Исследования на животных моделях и на людях показывают, что он контролирует экспрессию широкого спектра биологически и клинически важных генов.
Фактор транскрипции GATA3 имеет решающее значение для эмбрионального развития различных тканей, а также для воспалительных процессов. и гуморальные иммунные ответы и правильное функционирование эндотелия кровеносных сосудов. GATA3 играет центральную роль в аллергии и иммунитете против глистных инфекций. GATA3 гаплонедостаточность (то есть потеря одного или двух унаследованных генов GATA3) приводит к врожденному нарушению, называемому синдромом Бараката.
Текущие клинические и лабораторные исследования сосредоточены на определении преимущества прямого или косвенного блокирования действия GATA3 при воспалительных и аллергических заболеваниях, таких как астма. Также предполагается, что он является клинически важным маркером для различных типов рака, особенно рака груди. Однако роль GATA3 в развитии этих видов рака (если таковая имеется) изучается и остается неясной.
Содержание
- 1 Ген
- 2 Белок
- 3 Патофизиология
- 4 Функция
- 5 Клиническая значимость
- 5.1 Мутации
- 5.2 Аллергия
- 5.3 Опухоли
- 5.3.1 Опухоли груди
- 5.3.1.1 Развитие
- 5.3.1.2 Маркер
- 5.3.2 Другие типы опухолей
- 6 Взаимодействия
- 7 См. Также
- 8 Ссылки
- 9 Дополнительная литература
- 10 Внешние ссылки
Ген
Ген GATA3 расположен близко к концу короткого плеча хромосомы 10 в положении p14. Он состоит из 8 экзонов и кодов для двух вариантов, а именно, GATA3, вариант 1, и GATA3, вариант 2. Экспрессия GATA3 может частично или иногда регулироваться антисмысловой РНК, GATA3-AS1, ген которого расположен рядом с геном GATA3 на коротком плече хромосомы 10 в положении p14. Различные типы мутаций, включая точечные мутации, а также мелкие и крупномасштабные делеционные мутации вызывают аутосомно-доминантные генетические расстройство, синдром Бараката (также называемый синдромом гипопаратиреоза, глухоты и почечной дисплазии). Местоположение GATA3 граничит с другими критическими сайтами на хромосоме 10, особенно с сайтом, расположенным в 10p14-p13. Мутации в этом сайте вызывают врожденное заболевание синдром ДиДжорджи / комплекс велокардиофациального синдрома 2 (или синдром ДиДжорджи 2). Крупномасштабные делеции в GATA3 могут охватывать область синдрома ДиДжорджи 2 и тем самым вызывать сложный синдром с признаками синдрома Бараката в сочетании с некоторыми из признаков синдрома ДиДжорджи 2. Нокаут обоих генов GATA3 у мышей смертельный исход: эти животные умирают на 11-м и 12-м днях эмбриона из-за внутреннего кровотечения. У них также наблюдаются грубые деформации головного мозга и позвоночника, а также аберрации гемопоэза в печени плода.
Белок
GATA3 вариант 1 представляет собой линейный белок, состоящий из 444 аминокислоты. Белок варианта 2 GATA3 представляет собой идентично структурированную изоформу, но на 1 аминокислоту короче, чем вариант 1 GATA3. О различиях, если таковые имеются, в функциях этих двух вариантов не сообщалось. Что касается наиболее изученного варианта, варианта 1, но предположительно также варианта 2, один из структурных мотивов цинкового пальца , ZNF2, расположен на С-конце белка. и связывается с последовательностями ДНК специфического промотора гена для регуляции экспрессии генов, контролируемых этими промоторами. Другой цинковый палец, ZNF1, находится на N-конце белка и взаимодействует с различными ядерными факторами, включая белок 1 цинкового пальца (то есть ZFPM1, также называемый Друзьями GATA1 [т.е. FOG -1]) и ZFPM2 (т.е. FOG-2), которые модулируют гено-стимулирующее действие GATA3.
Патофизиология
Фактор транскрипции GATA3 регулирует экспрессию задействованных генов. в развитии различных тканей, а также генов, участвующих в физиологических, а также патологических гуморальных воспалительных и аллергических реакциях.
Функция
GATA3 принадлежит к семейству GATA из факторов транскрипции. Исследования делеции гена на мышах показывают, что Gata3 (мышиный ген, эквивалентный GATA3) имеет решающее значение для эмбрионального развития и / или функции различных типов клеток (например, жировых клеток, клетки нервного гребня, лимфоциты ) и ткани (например, почки, печень, головной мозг, спинной мозг, молочные железы). Исследования на людях предполагают участие GATA3 в следующем:
- 1)GATA3 необходим для развития паращитовидной железы, сенсорного компонента (ов) слуховой системы и почек у животных и людей. Он также может способствовать развитию влагалища и матки у людей.
- 2)У людей GATA3 необходим для развития и / или функционирования врожденных лимфоидных клеток (ILC), особенно группы 2 ILC, а также для развития Т-хелперных клеток, (Th-клеток), в частности Tdiv class="ht"-клеток. ILC группы 2 и клетки Tdiv class="ht" и, следовательно, GATA3, имеют решающее значение для развития аллергических и гуморальных иммунных ответов у людей. Сопоставимые исследования на животных показывают участие GATA3 в развитии лимфоцитов, которые опосредуют аллергический и гуморальный иммунитет, а также аллергические и плечевые иммунные ответы.
- 3)GATA3 способствует секреции IL-4, IL-5 и IL-13 из клеток Tdiv class="ht" человека и оказывает аналогичное действие на сопоставимые лимфоциты мыши. Все три интерлейкина служат для стимулирования аллергических реакций,
- 4)GATA3 индуцирует созревание клеток-предшественников в эпителиальные клетки груди и поддерживает эти клетки в их зрелом состоянии. состояние у мышей и, возможно, людей.
- 5)У мышей GATA3 отвечает за нормальное развитие различных тканей, включая кожу, жировые клетки, тимус и нервную систему.
Клиническое значение
Мутации
Инактивирующие мутации в одном из двух родительских генов GATA3 вызывают врожденное расстройство гипопаратиреоз с нейросенсорной глухотой и пороки развития почек, т.е. синдром Бараката. Этот редкий синдром может возникать в семьях или как новая мутация у человека из семьи, не страдающей этим заболеванием. Мутации в GATA3 вызывают различные степени гипопаратиреоза, глухоты и заболевания почек врожденные дефекты из-за 1) индивидуальных различий в пенетрантности мутации, 2) спорадическая и пока необъяснимая связь с пороками развития матки и влагалища и 3) мутации, выходящие за пределы гена GATA3 в хромосомные области, где мутации ответственны за развитие других типов аномалий которые являются характеристикой синдрома ДеДжорджи 2. Синдром Бараката возникает из-за гаплонедостаточности уровней GATA3, то есть уровней фактора транскрипции, которые недостаточны для нормального развития указанных тканей во время эмбриогенеза.
Аллергия
Исследования на мышах показывают, что ингибирование экспрессии GATA3 с использованием методов антисмысловой РНК подавляет аллергическое воспаление. Белок сверхэкспрессируется в пораженных тканях людей с различными формами аллергии, включая астму, ринит, носовые полипы и атопическую экзему. Это предполагает, что он может играть определенную роль в развитии этих расстройств. В клиническом исследовании фазы IIA лиц, страдающих аллерген-индуцированной астмой, ингаляция дезоксирибозима ST010, который специфически инактивирует GATA3 матричную РНК, в течение 28 дней снизилась раньше и поздний иммунный ответ легких на вдыхаемый аллерген. Считается, что клиническая польза от ингибирования GATA3 при этом расстройстве связана с нарушением функции ILC группы 2 и Tdiv class="ht"-клеток, например, путем снижения продукции IL-4, IL-13 и особенно IL-5. Предполагается, что уменьшение этих эозинофилов -стимулирующих интерлейкинов снижает способность этих клеток стимулировать аллергическую реактивность и ответы. По тем же причинам это лечение может оказаться клинически полезным для лечения других аллергических заболеваний.
Опухоли
Опухоли груди
Развитие
GATA3 является одним из из трех генов мутировали в>10% рака груди (Атлас генома рака). Исследования на мышах показывают, что этот ген имеет решающее значение для нормального развития ткани молочной железы и напрямую регулирует дифференцировку люминальных клеток (то есть клеток, выстилающих протоки молочных желез) при экспериментально индуцированном раке молочной железы. Аналитические исследования тканей рака молочной железы человека показывают, что GATA3 необходим для определенного типа рака молочной железы низкого риска (например, просвета A), является неотъемлемой частью экспрессии рецептора эстрогена альфа и (при отрицательном рецепторе эстрогена / андрогене рецептор-положительный рак) рецептор андрогена передача сигналов. Эти исследования показывают, что GATA3 участвует в развитии по крайней мере определенных типов рака груди у людей. Однако есть разногласия по этому поводу: некоторые исследования предполагают, что экспрессия GATA3 действует как ингибирующая, а другие исследования предполагают, что он действует, способствуя развитию, росту и / или распространению этого рака. Необходимы дальнейшие исследования для выяснения роли, если таковая имеется, GATA3 в развитии рака груди.
Маркер
Иммуоцитохимический анализ белка GATA3 в клетках груди является ценным маркером для диагностики первичной груди рак, будучи положительным в 94% случаев. Он особенно ценен при раке молочной железы, положительном по рецепторам эстрогена, но менее чувствителен (повышен на 435-66%), хотя все еще более ценен, чем многие другие маркеры, для диагностики тройного отрицательного рака груди. Этот анализ широко используется в качестве клинически ценного маркера рака груди.
Другие типы опухолей
Подобно опухолям груди, роль GATA3 в генезе других типов опухолей неясна, но обнаружение его продукт фактора транскрипции может быть полезен в диагностике. Иммуоцитохимический анализ белка GATA3 считается ценным маркером для определенных типов рака мочевого пузыря и рака уретры, а также для опухолей паращитовидной железы (злокачественных или доброкачественных), Отчеты одной серии предполагают, что этот анализ также может быть полезен для диагностики опухолей слюнных желез, карциномы слюнных протоков, секреторных карцином молочных аналогов, доброкачественных опухолей яичников Опухоли Бреннера, доброкачественные остатки клеток Вальтхарда и параганглиомы.
Взаимодействия
Было показано, что GATA3 взаимодействует со следующими регуляторами факторов транскрипции : ZFPM1 и ZFPM2 ; LMO1 ; и FOXA1. Эти регуляторы могут способствовать или ингибировать GATA3 при стимуляции экспрессии его генов-мишеней.
См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, в общественном достоянии.
.. 
.. 