GABRB3

редактировать
GABRB3
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы GABRB3, ECA5, субъединица бета3 рецептора гамма-аминомасляной кислоты типа A, EIEE43, субъединица рецептора гамма-аминомасляной кислоты типа A бета3
Внешние идентификаторыOMIM: 137192 MGI: 95621 HomoloGene: 633 GenCards : GABRB3
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человека)
Chr. Хромосома 15 (человек)
Хромосома 15 (человека) Геномное местоположение GABRB3 Геномное местоположение GABRB3
Полоса 15q12Начало26 543 546 bp
Конец26 939 539 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GABRB3 205850 с в fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

2562

14402

Ensembl

ENSG00000166206

ENSMUSG00000033676

UniProt

P28472

P63080

RefSeq (мРНК)

NM_000814. NM_003211200_MM_003211200_31 400>NM_021912

NM_001038701. NM_008071

RefSeq (протеин)

NP_000805. NP_001178249. NP_001178250. NP_001265560. NP_068712 <1027490>NP_40>NP_068712 <1027490>NP_403 (UCSC)

Chr 15: 26,54 - 26,94 Мб Chr 7: 57,42 - 57,83 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица бета-3 рецептора гамма-аминомасляной кислоты представляет собой белок, который i у человека кодируется геном GABRB3 . Он расположен в области 15q12 в геноме человека и занимает площадь 250 килобайт. Этот ген включает 10 экзонов в пределах своей кодирующей области. Благодаря альтернативному сплайсингу, ген кодирует многие изоформы белка, все из которых являются субъединицами в ГАМК A рецепторе, лиганд-зависимом ионный канал. Субъединица бета-3 экспрессируется на разных уровнях в коре головного мозга, гиппокампе, мозжечке, таламусе, оливковом теле. и грушевидная кора головного мозга на разных этапах развития и зрелости. Дефицит GABRB3 вовлечен во многие расстройства нервного развития и синдромы человека, такие как синдром Ангельмана, синдром Прадера-Вилли, несиндромные орофациальные щели, эпилепсия и аутизм. Эффекты метаквалона и этамидата опосредуются GABBR3 положительной аллостерической модуляцией.

Содержание

  • 1 Ген
  • 2 Функция
  • 3 Структура
  • 4 Экспрессия
    • 4.1 Паттерны импринтинга
  • 5 Регламент
  • 6 Клиническая значимость
    • 6.1 Синдром Ангельмана
    • 6.2 Несиндромная орофациальная щель
    • 6.3 Расстройство аутистического спектра
    • 6.4 Эпилепсия / абсансная эпилепсия в детском возрасте
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Дополнительная литература
  • 10 Внешние ссылки

Ген

Ген GABRB3 расположен на длинном плече хромосомы 15, в области q12 в геноме человека. Он расположен в генном кластере с двумя другими генами, GABRG3 и GABRA5. GABRB3 был первым геном, который был картирован в этой конкретной области. Он занимает около 250 килобайт и включает 10 экзонов в своей кодирующей области, а также два дополнительных альтернативных первых экзона, которые кодируют сигнальные пептиды. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие изоформы с отдельными сигнальными пептидами. Этот ген расположен в области импринтинга, которая охватывает область 15q11-13. Его последовательность значительно длиннее, чем у двух других генов, обнаруженных в его кластере генов, из-за большого 150 т.п.н. интрона, который он несет. Наблюдается закономерность репликации гена GABRB3, у людей материнский аллель реплицируется позже, чем отцовский аллель. Обоснование и значение этого паттерна неизвестны.

При сравнении генетической последовательности субъединицы бета-3 человека с последовательностями других субъединиц бета-3 позвоночных обнаруживается высокий уровень генетической консервативности. У мышей ген Gabrb3 расположен на хромосоме 7 его генома в стиле кластера генов, аналогичном некоторым другим субъединицам рецептора GABA A.

Функция

GABRB3 кодирует член семейства лиганд-управляемых ионных каналов. Кодируемый белок представляет собой одну из по меньшей мере 13 отдельных субъединиц мультисубъединичного хлоридного канала, который служит рецептором для гамма-аминомасляной кислоты, основного тормозного нейромедиатора нервной системы. Два других гена в кластере генов кодируют родственные субъединицы семейства. Во время развития, когда субъединица GABRB3 функционирует оптимально, ее роль в рецепторе GABA A позволяет пролиферацию, миграцию и дифференцировку клеток-предшественников, которые приводят к правильному развитию мозга. ГАМК А рецепторная функция ингибируется ионами цинка . Ионы связываются с рецептором аллостерически, механизм, который критически зависит от состава субъединиц рецептора.

De novo гетерозиготные миссенс-мутации в высококонсервативной области Ген GABRB3 может уменьшать амплитуды пикового тока нейронов или изменять кинетические свойства канала. Это приводит к потере ингибирующих свойств рецептора.

Субъединица бета-3 имеет очень сходные функции с человеческой версией субъединицы.

Структура

Кристаллическая структура гомопентамера β3 человека был опубликован в 2014 году. Изучение кристаллической структуры гомопентамера β3 человека выявило уникальные качества, которые наблюдаются только у эукариотических рецепторов цистеиновой петли. Характеристика рецептора и субъединиц GABA A помогает механистически определить мутации внутри субъединиц и то, какое прямое влияние мутации могут иметь на белок и его взаимодействия.

Экспрессия

Экспрессия GABRB3 не является постоянной среди всех клеток или на всех стадиях развития. Распределение экспрессии субъединиц рецептора GABA A (включая GABRB3) во время развития указывает на то, что GABA может функционировать как нейротрофический фактор, влияя на нейронную дифференцировку, рост и организацию цепи. Экспрессия субъединицы бета-3 достигает пика в разное время в разных частях мозга во время развития. Наивысшая экспрессия Gabrb3 у мышей в коре головного мозга и гиппокампе достигается пренатально, тогда как постнатально - в коре мозжечка. После наивысшего пика экспрессии экспрессия Gabrb3 существенно подавляется в таламусе и нижнем оливковом теле мыши. К зрелому возрасту уровень экспрессии в коре головного мозга и гиппокампе опускается ниже уровня экспрессии в процессе развития, но экспрессия в мозжечке не изменяется постнатально. Наивысшие уровни экспрессии Gabrb3 в зрелом мозге мыши наблюдаются в клетках Пуркинье и гранулярных клетках мозжечка, гиппокампа и грушевидной коры.

У людей субъединица бета-3, а также субъединицы двух соседних с ней генов (GABRG3 и GABRA5) биаллельно экспрессируются в коре головного мозга, что указывает на то, что ген не подвергается импринтингу в этих клетках.

Паттерны импринтинга

Из-за расположения GABRB3 в области импринтинга 15q11-13, обнаруженной у людей, этот ген подвергается импринтингу в зависимости от расположения и состояния развития клеток. Импринтинг отсутствует в головном мозге мыши, имея равную экспрессию материнских и отцовских аллелей.

Регламент

Фосфорилирование ГАМК A посредством цАМФ-зависимая протеинкиназа (PKA) обладает регулирующим действием, зависящим от задействованной бета-субъединицы. Механизм, с помощью которого киназа нацеливается на субъединицу bata-3, неизвестен. AKAP79 / 150 связывается непосредственно с субъединицей GABRB3, которая имеет решающее значение для ее собственного фосфорилирования, опосредованного PKA.

Gabrb3 демонстрирует значительно сниженную постнатальную экспрессию, когда у мышей дефицит MECP2. Когда ген MECP2 нокаутирован, экспрессия Gabrb3 снижается, что предполагает взаимосвязь положительной регуляции между двумя генами.

Клиническая значимость

Мутации в этом гене могут быть связаны с патогенезом синдрома Ангельмана, несиндромных орофациальных щелей, эпилепсии и аутизма. Ген GABRB3 был связан с навыками саванта, сопровождающими такие нарушения.

У мышей нокаутная мутация Gabrb3 вызывает тяжелую неонатальную смертность с присутствующим фенотипом волчьей пасти, выжившие, страдающие гиперактивностью, отсутствием координации и эпилептическими припадками. У этих мышей также наблюдаются изменения вестибулярной системы внутри уха, что приводит к плохим навыкам плавания, затруднению ходьбы по решетчатому полу и, как обнаружено, беспорядочно бегает кругами.

Синдром Ангельмана

Делеция гена GABRB3 приводит к синдрому Ангельмана у человека в зависимости от родительского происхождения делеции. Удаление отцовского аллеля GABRB3 не имеет известных последствий для этого синдрома, в то время как делеция материнского аллеля GABRB3 приводит к развитию синдрома.

Несиндромное орофациальное расщепление

Существует сильная связь между Уровни экспрессии GABRB3 и развитие собственно неба. Нарушение экспрессии GABRB3 может быть связано с пороком развития несиндромной заячьей губы с волчьей пастью или без нее. Расщелина губы и неба также наблюдалась у детей с перевернутыми дупликациями, охватывающими локус GABRB3. Нокаут субъединицы бета-3 у мышей приводит к расщеплению вторичного неба. Нормальные черты лица могут быть восстановлены путем встраивания трансгена Gabrb3 в геном мыши, в результате чего ген Gabrb3 в первую очередь отвечает за формирование волчьей пасти.

Расстройство аутистического спектра

Дупликации области синдрома Прадера-Вилли / Ангельмана, также известной как область импринтинга (15q11-13), которая включает ген GABRB3, присутствуют у некоторых пациентов с диагнозом аутизм. У этих пациентов наблюдаются классические симптомы, связанные с заболеванием. Дупликации области 15q11-13 у аутичных пациентов почти всегда имеют материнское происхождение (не отцовское) и составляют 1-2% случаев диагностированного аутистического расстройства. Этот ген также является кандидатом на аутизм из-за физиологической реакции бензодиазепина на рецептор ГАМК-А при использовании для лечения судорог и тревожных расстройств.

Мышь с дефицитом гена Gabrb3 была предложена в качестве модели расстройство аутистического спектра. Эти мыши демонстрируют аналогичные фенотипические симптомы, такие как неизбирательное внимание, дефицит различных исследовательских параметров, общительность, социальная новизна, гнездование и более низкая частота выращивания, что можно приравнять к характеристикам, обнаруживаемым у пациентов с диагнозом расстройство аутистического спектра. При изучении мышей с дефицитом Gabrb3 наблюдалась значительная гипоплазия червя мозжечка.

Неизвестная связь между аутизмом и локусом 155CA-2, расположенным внутри интрона в GABRB3.

Эпилепсия / Абсолютная эпилепсия в детстве

Дефекты передачи ГАМК часто были связаны с эпилепсией на животных моделях и в человеческих синдромах. У пациентов с синдромом Ангельмана с делецией гена GABRB3 наблюдаются абсансы. Снижение экспрессии субъединицы бета-3 является потенциальным фактором абсансной эпилепсии у детей.

См. Также

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-05-21 08:35:17
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru