FYN |
---|
|
Доступные структуры |
---|
PDB | Поиск ортолога: PDBe RCSB |
---|
Список идентификационных кодов PDB |
---|
1A0N, 1AOT, 1AOU, 1AVZ, 1AZG, 1EFN, 1FYN, 1G83, 1M27, 1NYF, 1NYG, 1SHF, 1ZBJ, 2DQ7, 3H0F, 3H0H, 3H0I, 3UA6, 3UA7, 4D8D, 4EIK, 2MQI, 2MRJ, 2MRK, 4U17, 4U1P, 4ZNX |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | FYN, SLK, SYN, протоонкоген p59-FYN, тирозинкиназа семейства Src |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM: 137025 MGI: 95602 HomoloGene: 48068 GenCards : FYN |
---|
|
Расположение гена (мышь) |
---|
| Chr. | Хромосома 10 (мышь) |
---|
| Полоса | 10 B1 | 10 20,51 см | Начало | 39,368,855 bp |
---|
Конец | 39,565,381 bp |
---|
|
|
Онтология генов |
---|
Молекулярная функция | •Связывание рецептора CD4. •связывание ионного канала. •GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса. •GO: 0001948 связывание с белком. •связывание с рецептором CD8. •активность киназы. •связывание тубулина. •связывание с рецептором. •связывание с АТФ. •активность протеинкиназы. •связывание иона металла. •рецептор пептидного гормона связывание. •связывание с Т-клеточным рецептором. •трансферазная активность. •связывание с эфриновым рецептором. •связывание с нуклеотидом. •связывание с рецептором фактора роста. •связывание с фосфатидилинозитол-3-киназой. •связывание с рецептором, сопряженным с G-белком. •немембранная активность протеинтирозинкиназы. •фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфат-3-киназная активность. •протеинтирозинкиназная активность. •Ras активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов. •связывание ферментов. •связывание идентичного белка. •активность преобразователя сигнала. •связывание метаботропного рецептора глутамата 5 типа. •связывание альфа-тубулина. •связывание тау-белка. •активность тау-протеинкиназы. •специфическое связывание неупорядоченного домена. |
---|
Клеточный компонент | •цитоплазма. •мембрана. •внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны. •митохондрия. •ядро клетки. •мембранный плот. •внутриклеточная мембраносвязанная органелла. •актиновая нить. •периферия клетки. •эндосома. •клеточная мембрана. •цитозоль. •GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность. •дендрит. •тело клетки. •перинуклеарная область цитоплазмы. •перинуклеарная эндоплазматическая ретикулум. •проекция глиальных клеток. •коллатераль Шаффера - синапс CA1. •глутаматергический синапс. •постсинаптическая плотность, внутриклеточный компонент. |
---|
Биологический процесс | •негативная регуляция апоптотического процесса нейрона. •адаптивный иммунный ответ. •обучение. •активация тромбоцитов. •сигнальный путь рецептора клеточной поверхности. •сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов. •пищевое поведение. •ответ на этанол. •транспорт ионов кальция. •регуляция апоптотического процесса. •клеточный ответ на бета-стимул трансформирующего фактора роста. •Fc-гамма сигнальный путь рецептора, участвующий в фагоцитозе. •отрицательная регуляция катаболического процесса протеина. •сигнальный путь трансмембранного рецептора протеинтирозинкиназы. •стимулирующий путь передачи сигнала рецептора лектина С-типа. •отрицательная регуляция экспрессии гена. •аутофосфорилирование. •Активация Т-клеток. •обнаружение механического стимула, участвующего в сенсорном восприятии боли. •дифференцировка клеток. •морфогенез дендритов. •фосфорилирование. •процесс иммунной системы. •миграция нейронов. •клеточный ответ на тромбоциты- стимул производного фактора роста. •регуляция формы клеток. •аутофосфорилирование пептидил-тирозина. •передача сигналов, опосредованная фосфатидилинозитолом. •миграция лейкоцитов. •позитивная регуляция про локализация теина в ядре. •GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала. •активированная пролиферация Т-клеток. •сигнальный путь рецептора эфрина. •клеточный ответ на стимул фактора роста. •костимуляция Т-клеток. •свертывание крови. •регуляция защитного ответа на вирус вирусом. •каскад MAPK. •управление аксоном. •развитие многоклеточного организма. •отрицательная регуляция убиквитинирования белка. •клеточный ответ на стимул пептидного гормона. •регуляция пролиферации клеток. •позитивная регуляция развития проекции нейронов. •позитивная регуляция передачи сигналов I-kappaB / NF-kappaB. •позитивная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы. •фосфорилирование пептидил-тирозина. •развитие переднего мозга. •негативная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути в отсутствие лиганда. •сигнальный путь Т-клеточного рецептора. •миграция клеток. •ответ на лекарство. •GO: 0022415 вирусный процесс. •врожденная иммунная система. •GO: 0032320, GO : 00 32321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase. •фосфорилирование фосфатидилинозитола. •регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы. •фосфорилирование белка. •регуляция развития центральной нервной системы. •фосфорилирование пептидил-тирозина. •положительная регуляция нацеливания белков на мембрану. •положительная регуляция гибели нейронов. •отрицательная регуляция поддержания дендритного позвоночника. •ответ на бета-амилоид. •регуляция импорта ионов кальция через плазматическую мембрану. •ответ на синглетный кислород. •сердечный процесс. •отрицательная регуляция процесса биосинтеза перекиси водорода. •сигнальный путь, опосредованный цитокинами. •положительная регуляция фосфорилирования тирозина белка STAT. •ответ на перекись водорода. •модуляция химической синаптической передачи. •позитивная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B. •поддержание дендритного позвоночника. •регуляция пути передачи сигналов рецептора глутамата. •негативная регуляция индуцированной окислительным стрессом гибели клеток. •позитивная регуляция немембранной активности протеинтирозинкиназы. •клеточный ответ на L-глутамат. •клеточный ответ на глицин. •позитивная регуляция локализации белка на мембране. •позитивная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа. •клеточный ответ на бета-амилоид. |
---|
Источники: Amigo / QuickGO |
|
Orthologs |
---|
Виды | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (mRNA_312427>>NM_002037. NM_153047. NM_153048. NM_001370529 |
---|
| RefSeq (белок) | |
---|
Местоположение (UCSC) | Chr 6: 111,66 - 111,87 Мб | Chr 10: 39,37 - 39,57 Мб |
---|
PubMed поиск | | |
---|
Викиданные |
|
P тирозинпротеинкиназа ротоонкогена Fyn (p59-FYN, Slk, Syn, MGC45350, Gene ID 2534) - это фермент, который у человека кодируется геном FYN .
Fyn является членом семейства киназ Src массой 59 кДа, который обычно связан с Т-клеточной и нейрональной передачей сигналов в процессе развития и нормальной клеточной физиологии. Нарушения в этих сигнальных путях часто влияют на формирование различных видов рака. По определению как протоонкоген, Fyn кодирует белки, которые помогают регулировать рост клеток. Изменения в его последовательности ДНК превращают его в онкоген, который приводит к образованию другого белка, влияющего на нормальную регуляцию клеток.
Fyn является членом протеин-тирозинкиназы онкогены семейство. Он кодирует ассоциированную с мембраной тирозинкиназу, которая участвует в контроле роста клеток. Белок связывается с субъединицей p85 фосфатидилинозитол-3-киназы и взаимодействует с fyn-связывающим белком. Существуют альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие разные изоформы.
Содержание
- 1 История
- 2 Функция
- 3 Роль в сигнальных путях
- 4 Взаимодействия
- 5 Роль в биологии рака
- 6 Ссылки
- 7 Дополнительная литература
- 8 Внешние ссылки
История
Fyn является членом Src-семейства киназ (SFK), первым идентифицированным протоонкогеном. Открытие семейства Src в 1976 г. привело к присуждению Нобелевской премии по медицине в 1989 г. Дж. М. Бишопу и Э. М. Вармусу. Fyn был впервые идентифицирован в 1986 году как Syn или Slk с помощью зондов, полученных из v-yes и v-fgr. Общей чертой SFK является то, что они обычно активируются при раке. Fyn функционально отличается от членов своего семейства тем, что он взаимодействует с FAK и паксиллином (PXN) в регуляции морфологии и подвижности клеток.
Функция
Fyn - это белок, присутствующий в передаче сигналов путь интегринов, который активирует ras. Fyn представляет собой тирозинспецифическую фосфотрансферазу, которая является членом семейства Src нерецепторных тирозиновых протеинкиназ. (Это семейство также включает Abl, Src, киназу фокальной адгезии и киназу Janus.) Fyn расположен ниже нескольких рецепторов клеточной поверхности, обычно связанных с развитием нейронов и передачей сигналов Т-клеток. Когда fyn активируется, он вызывает последующую активацию молекулярных сигналов, которые управляют процессами, важными для роста и подвижности клеток. Fyn в первую очередь локализован в цитоплазматическом листке плазматической мембраны, где он фосфорилирует остатки тирозина на ключевых мишенях, участвующих во множестве различных сигнальных путей. Фосфорилирование тирозина целевых белков с помощью Fyn служит либо для регулирования активности целевого белка, и / или для создания сайта связывания на целевом белке, который рекрутирует другие сигнальные молекулы. Fyn также является супрессором опухолей. Когда эта нормальная биология нарушена, измененный Fyn становится участником неопластической трансформации нормальных клеток в раковые по пути от преинвазивного к инвазивному и, в конечном итоге, к метастазированию.
Роль в сигнальных путях
Понимание роли fyn в нормальной биологии имеет решающее значение для понимания его роли в развитии рака, поскольку рак - это нарушение регуляции этих нормальных путей. Знание того, какие пути включают Fyn, даст ключевое понимание для разработки потенциальных фармакологических агентов для ослабления этой неконтролируемой передачи сигналов.
По крайней мере три инструмента были полезны для определения потребности в функции Fyn в конкретной сигнальной системе:
- клетки, полученные от Fyn - / - мышей (а также клетки, полученные из Fyn, Src, Yes, мыши с тройным нокаутом Fyn (SYF));
- киназа-неактивная, доминантно-отрицательная мутантная форма Fyn (K299M);
- фармакологические ингибиторы киназ семейства Src, такие как PP2 ; обратите внимание, что PP2 также ингибирует другие тирозиновые протеинкиназы, такие как Abl, PDGFR и c-Kit.
. Используя эти инструменты, потребность в Fyn была показана для следующих сигнальные пути: Т и В-клеточная передача сигналов рецептора, интегрин -опосредованная передача сигналов, фактор роста и цитокиновый рецептор передача сигналов, активация тромбоцитов, функция ионного канала, клеточная адгезия, ведение аксонов, оплодотворение, вступление в митоз и дифференцировка естественных клеток-киллеров, олигодендроцитов и кератиноцитов. Fyn также играет важную роль в TLR-опосредованных иммунных ответах Т-клеток.
Взаимодействия
Было показано, что FYN взаимодействует с:
- ADD2,
- BCAR1,
- C-Raf,
- CBLC,
- CD36,
- CD44,
- CDH1,
- CHRNA7,
- CTNND1,
- CBL,
- CSF1R,
- DLG4,
- Дистрогликан,
- EPHA8,
- FYB,
- FASLG,
- GNB2L1,
- GRIN2A,
- ITK,
- киназа януса 2,
- KHDRBS1,
- Lck,
- LKB1,
- нефрин,
- PAG1,
- PIK3R2,
- PRKCQ,
- PTK2B,
- PTK2,
- PTPRT
- UNC119,
- RICS,
- SH2D1A,
- SKAP1,
- Syk,
- TNK2,
- TRPC6,
- Белок тау,
- TrkB,
- TYK2,
- TUBA3C,
- WAS и
- ZAP-70,
Роль в биологии рака
Семейство киназ Src обычно связано с его ролью в «инвазии и прогрессировании опухоли, переходе эпителия в мезенхиму, ангиогенезе и развитии метастазов» - всех признаках прогрессирования рака. Нормальная функция Fyn в клеточном росте и пролиферации может быть использована при прогрессировании и метастазировании раковых клеток. Было обнаружено, что сверхэкспрессия Fyn вызывает морфологическую трансформацию в нормальных клетках и увеличивает «независимый от закрепления рост и заметные морфологические изменения».
Сверхэкспрессия Fyn была изучена в отношении следующих видов рака: рак простаты, мультиформная глиобластома, плоскоклеточный рак головы и шеи, рак поджелудочной железы, хронический мелогенный лейкоз и меланома. Эта сверхэкспрессия запускает стимуляцию «антиапоптотической активности Akt» при раке простаты, что означает, что эти клетки приобрели способность избегать нормальных путей гибели клеток (общий признак рака). Кроме того, в мультиформной глиобластоме было обнаружено, что Src и Fyn являются «эффекторами онкогенной передачи сигналов EGFR», что приводит к инвазии опухоли и выживанию раковых клеток.
Нормальная роль Fyn в миграции и адгезии клеток позволяет ему использовать нормальная клеточная биология интегрина и FAK для роста рака. Нормальный интегрин - это рецептор клеточной поверхности, который взаимодействует с внеклеточным матриксом и посылает сигналы, влияющие на форму и подвижность клеток. Нормальный FAK - это тирозинкиназа, которая привлекается к участкам фокальной адгезии и играет ключевую роль в направленном движении клеток. Эти нормальные пути играют ключевую роль в «посредничестве клеточных событий, передаваемых Fyn, влияющих на форму и подвижность». Скомпрометированная версия этого пути позволила бы раковым клеткам изменять форму и подвижность, увеличивая возможность расширенной инвазии и метастазирования. Дополнительные пути, которые исследуются относительно роли Fyn в прогрессировании рака, включают: семейство Rac и Rho из GTPases, Ras, Erk и MAPK.
Из-за этого Fyn стал общей мишенью для терапевтических исследований против рака. Ингибирование Fyn (как и других SFK) приводит к снижению роста клеток. Кроме того, было обнаружено, что «экспрессия мертвой киназы-Fyn (KD-Fyn), специфического конкурента эндогенного Fyn», снижает размер первичных опухолей у мышей. Специальное нацеливание на уникальные идентифицирующие свойства Fyn, а также ингибирование FAK и PXN может создать очень эффективную молекулярно-направленную комбинированную терапию рака. Ингибиторы Fyn также исследуются в качестве потенциальных методов лечения болезни Альцгеймера.
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P06241 (человеческая тирозин-протеинкиназа Fyn) в PDBe-KB.
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P39688 (мышиная тирозин-протеинкиназа Fyn) в PDBe-KB.