Формиат-тетрагидрофолат-лигаза

Формиат - тетрагидрофолатлигаза
кристаллическая структура формилтетрагидрофолатсинтетазы из moorella thermoacetica
Идентификаторы
Символ	FTHFS
Pfam	PF01268
Pfam клан	CL0023
InterPro	IPR000559
PROSITE	PDOC00595
SCOPe	1fpm / SUPFAM
Доступные структуры белка: структуры Pfam / ECOD PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsum краткое описание структуры

В энзимологии формиат-тетрагидрофолатлигаза (EC 6.3.4.3 ) представляет собой фермент, который катализирует химическую реакцию

АТФ + формиат + тетрагидрофолат $\rightleftharpoons \; \{\backslash \; displaystyle\; \backslash \; rightleftharpoons\}$ADP + фосфат + 10-формилтетрагидрофолат

3 субстратами этого фермента являются АТФ, формиат и тетрагидрофолат, тогда как его 3 продуктами являются АДФ, фосфат и 10-формилтетрагидрофолат.

Этот фермент принадлежит к семейству лигаз, в частности тех, которые образуют общие углерод-азотные связи. Этот фермент участвует в метаболизме глиоксилата и дикарбоксилата и одного углеродного пула фолатом.

У эукариот активность FTHFS выражается многофункциональным ферментом, C-1-тетрагидрофолатсинтазой. (C1-THF синтаза), которая также катализирует активность дегидрогеназы и циклогидролазы. Известны две формы синтаз C1-THF: одна расположена в митохондриальном матриксе, а вторая - в цитоплазматической. В обеих формах домен FTHFS состоит примерно из 600 аминокислотных остатков и расположен в C-концевом участке C1-THF-синтазы. В прокариотах активность FTHFS выражается монофункциональным гомотетрамерным ферментом из примерно 560 аминокислотных остатков.

• 1 Номенклатура
• 2 Примеры
• 3 Структурные исследования
• 4 Родственные ферменты
• 5 Ссылки
• 6 Дополнительная литература

систематическое название этого класса ферментов - формиат: тетрагидрофолатлигаза (ADP -формирование) . Другие широко используемые названия включают:

• формилтетрагидрофолатсинтетаза,
• 10-формилтетрагидрофолатсинтетаза,
• тетрагидрофолиевая формилаза и
• тетрагидрофолатформилаза.

Человеческие гены, кодирующие формиат-тетрагидрофолат-лигазы, включают:

• MTHFD1 - цитоплазматический
• MTHFD1L - митохондриальный

По состоянию на конец 2007 г. 3 структуры были решены для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1EG7, 1FP7 и 1FPM.

The кристаллическая структура N (10) -формилтетрагидрофолатсинтетазы из Moorella thermoacetica показывает, что субъединица состоит из трех доменов, организованных вокруг трех смешанных бета-листов. Между соседними доменами есть две полости. Один из них был идентифицирован как сайт связывания нуклеотида путем моделирования гомологии. Большой домен содержит семицепочечный бета-лист, окруженный спиралями с обеих сторон. Второй домен содержит пятицепочечный бета-лист с двумя альфа-спиралями, упакованными с одной стороны, в то время как две другие представляют собой стенку полости активного сайта. Третий домен содержит четырехнитевой бета-лист, образующий полубочку. Вогнутая сторона покрыта двумя спиралями, а выпуклая сторона - еще одна стенка большой полости. Arg 97, вероятно, участвует в связывании формилфосфата. тетрамерная молекула является относительно плоской с формой буквы X, и активные сайты расположены на конце субъединиц вдали от границы раздела субъединиц.

Обратная реакция, превращающая 10-формилтетрагидрофолат в тетрагидрофолат, осуществляется формилтетрагидрофолатдегидрогеназой.

• JAENICKE L, BRODE E (1961). «[Исследование моноуглеродных соединений. I. Тетрагидрофолатформилаза из печени голубя. Очистка и механизм.]». Biochem. З. 334 : 108–32. PMID 13789141.
• Длинный CW; Левицки А; Хьюстон, LL; Кошланд Д.Е., младший (1969). «Субъединичные структуры и взаимодействия CTP синтетазы». Кормили. Proc. 28 : 342.
• RABINOWITZ JC, PRICER WE (1962). «Формилтетрагидрофолатсинтетаза. I. Выделение и кристаллизация фермента». J. Biol. Chem. 237 : 2898–902. PMID 14489619.
• Whiteley HR, Osborn MJ, Huennekens FM (1959). «Очистка и свойства формиат-активирующего фермента из Micrococcus aerogenes». J. Biol. Chem. 234 (6): 1538–1543. PMID 13654413.

.