Первая доступная информация о Церковная организация Метсово и его окрестностей указывает на то, что в XIV веке он был частью Иоаннинской митрополии. Кроме того, есть сведения о существовании монастырей в тот же период в этом районе, а также в более широком регионе центральных пиндосов. Административное включение Метсово в состав Османского Санджака Трикалы в середине 15 века потребовало бы соответствующих изменений в церковном управлении, но это не подтверждено до середины 17 века, когда Метсово находилось под властью.
Согласно Аравантиносу, в XVI веке Константинопольский Патриархат передал экзархат, надзирающий за Влахскими деревнями в этом районе, в игуменос монастыря о. Это свидетельство свидетельствует об учреждении в то время особого церковного Мецсовского экзархата, что связано с предоставлением привилегий Мецово и его окрестностям. С тех пор и до 1795 года Мецово и шесть соседних поселений составляли автономную церковную область, находившуюся под непосредственным контролем Константинопольского Патриархата.
В 1924 году патриарший экзархат Метсово был на короткое время возрожден как митрополия, чтобы найти должности для высокопоставленных священнослужителей из Малой Азии, потерявших свои престолы в результате обмена населением между Греция и Турция. В 1929 году Метрополия была упразднена без восстановления статуса экзархата, а территория бывшего Экзархата Метсова находилась под властью до 1932 года, когда Метсово, Анилио, Вотоноси и Дервентиста были отделены и снова присоединены к митрополии Иоаннина.