Войти
База данных эукариотических патогенов или EuPathDB - это база данных биоинформатических и экспериментальных данных связаны с множеством эукариотических патогенов. Он был создан в 2006 году в рамках программы Национальных институтов здравоохранения для создания центров ресурсов по биоинформатике для содействия исследованиям патогенов, которые могут представлять угрозу для биозащиты. EuPathDB хранит данные, относящиеся к интересующим организмам, и предоставляет инструменты для поиска и анализа данных. В настоящее время он состоит из 14 компонентных баз данных, каждая из которых посвящена определенной теме исследования. EuPathDB включает:
EuPathDB была создана в рамках NIH Центры ресурсов по биоинформатике выступают в качестве ApiDB, ресурса, предназначенного для охвата паразитов Apicomplexan. Первоначально ApiDB состоял из сайтов-компонентов CryptoDB (для Cryptosporidium ), PlasmoDB (для Plasmodium ) и ToxoDB (для Toxoplasma gondii ). Поскольку ApiDB вырос, чтобы сосредоточиться на эукариотических патогенах, выходящих за рамки Apicomplexans, название было изменено на EuPathDB, чтобы поддерживать его расширенные возможности. EuPathDB явилась результатом сотрудничества многих различных паразитологов, включая Дэвида Рооса, Джессику Киссинджер и Дайан Вирт.
Это интегрированная база данных, охватывающая патогены эукариот в нескольких роды. Это позволяет получить доступ к подробной информации генома, связанной с этими патогенами. EuPathDB ранее назывался ApiDB и был интегрированным ресурсом для apicomplexans, охватывающего базы данных связанных патогенов, ToxoDB, PiroplasmDB и CryptoDB.
В настоящее время EuPathDB охватывает 11 баз данных, последнее добавление - из Piroplasma, который поддерживает Babesia и Theileria. Этот BRC - один из пяти центров, финансируемых для поддержки исследовательских организаций. EuPath поддерживает исследование патогенов эукариот, а четыре других центра поддерживают исследования других патогенов болезней. Он разработал сложную поисковую систему, оказывающую неоценимую помощь исследователям.
EuPathDB состоит из 14 баз данных компонентов, каждая из которых имеет определенную направленность:
