Войти
 | |
|---|---|
| Содержимое | |
| Описание | обширная база данных по биологии Escherichia coli. |
| Организмы | Escherichia coli |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | SRI International |
| Лаборатория | SRI International |
| Авторы | Питер Карп и др. |
| Основное цитирование | Кеселер и др. (2011) |
| Доступ | |
| Веб-сайт | ecocyc.org |
In bioinformatics EcoCyc - это биологическая база данных для бактерии Escherichia coli К-12. В рамках проекта EcoCyc осуществляется лечение генома E. coli, а также регуляции транскрипции, транспортеров и метаболических путей E. coli на основе литературы. EcoCyc содержит письменные резюме генов E. coli, основанные на более чем 36 000 научных статей. EcoCyc также представляет собой описание генома и клеточных сетей E. coli, которое помогает ученым проводить вычислительный анализ.
Объекты данных в базе данных EcoCyc описывают каждый ген E. coli и ген товар. Объекты базы данных также описывают молекулярные взаимодействия, в том числе метаболические пути, транспортные события и регуляцию экспрессии генов. EcoCyc предоставляет несколько инструментов визуализации в масштабе генома, чтобы помочь в анализе данных omics, таких как нанесение данных экспрессии генов или метаболомики на полную регуляторную сеть E. coli.
Доступ к EcoCyc можно получить через веб-сайт EcoCyc в виде набора загружаемых файлов и в сочетании с программным обеспечением Pathway Tools, которое можно установить локально на компьютерах Macintosh, ПК / Windows и ПК / Linux. Загружаемое программное обеспечение предоставляет возможности, которые выходят далеко за рамки веб-версии EcoCyc.
.
