Сюжет с двойным фонариком

редактировать
Диаграмма с двумя фонарями, показывающая набор данных высокопроизводительного скрининга.

В статистике диаграмма с двумя фонарями является типом рассеяния- график, на котором нанесено стандартизованное среднее значение контрастной переменной (SMCV ) ag среднее значение переменной контраста, представляющее интересующее сравнение. Обычно используемый график с двойным фонариком предназначен для разницы между двумя группами в высокопроизводительных экспериментах, таких как микроматрицы и высокопроизводительные скрининговые исследования, в которых мы строим SSMD по сравнению со средним логарифмическим кратным изменением по осям y и x, соответственно, для всех генов или соединений (таких как миРНК или малых молекул ), исследованных в эксперименте. В целом точки на графике с двумя фонариками выглядят как лучи фонарика с двумя головками, отсюда и название графика с двумя фонариками.

На графике с двумя фонариками мы можем увидеть, как гены или соединения распределены по каждой категории по величине эффекта, как показано на рисунке. Между тем, мы также можем увидеть среднюю кратность изменения для каждого гена или соединения. Сюжет с двойным фонариком аналогичен сюжету вулкана. На графике вулкана значение p (или q-значение) вместо SMCV или SSMD отображается в зависимости от среднего кратного изменения. Преимущество использования SMCV по сравнению с p-значением (или q-значением) заключается в том, что, если существуют какие-либо ненулевые истинные эффекты для гена или соединения, оцененное SMCV переходит к его значению популяции, тогда как p-значение (или q- значение) для проверки отсутствия средней разницы (или среднего значения нулевого контраста) стремится к нулю при увеличении размера выборки. Следовательно, значение SMCV сравнимо, тогда как значение p-value или q-value несопоставимо в экспериментах с различным размером выборки, особенно когда многие исследованные гены или соединения не имеют точно нулевого эффекта. График с двумя фонарями имеет то же преимущество, что и SMCV, по сравнению с графиком вулкана.

См. Также

Дополнительная литература

Ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-18 05:06:14
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте