Подписаться

Diplorickettsia massiliensis

Последняя правка сделана 2021-05-17 07:18:21 Править

Diplorickettsia massiliensis
Штамм Diplorickettsia massiliensis 20B, выращенный в Клетки XTC-2, окрашивание по Гименесу, x1500..jpg
Внутриклеточные красные палочки обычно сгруппированы попарно, но не связаны друг с другом
Научная классификация
Домен:Бактерии
Тип:Pro teobacteria
Класс:Gammaproteobacteria
Отряд:Legionellales
Семейство:Coxiellaceae
Род:Diplorickettsia
Виды:D. massiliensis
Биномиальное название
Diplorickettsia massiliensis . Медианников и др. 2011

Вид Diplorickettsia massiliensis - облигатная внутриклеточная, грамотрицательная бактерия, выделенная от клещей Ixodes ricinus, собранных в Словакии. республиканский лес географически от юго-восточной части Ровинки в 2006 году. Они относятся к классу gammaproteobacteria и не образуют эндоспоры, небольшие палочки обычно группируются попарно. Бактерии неподвижны, и секвенирование генов 16S рРНК, rpoB, parC и ftsY показывает, что эта бактерия явно отличается от всех других признанных видов. Первоначальный филогенетический анализ, основанный на 16S рРНК, сгруппировал D. massiliensis с Rickettsiella grylli. Из-за низкого сходства 16S рДНК (94%) с R. grylli он был классифицирован как новый род Diplorickettsia в семействе Coxiellaceae и отряде Legionellales. Штамм D. massiliensis 20B был идентифицирован у трех пациентов с подозрением на клещевые инфекции, которые проявляли специфическую сероконверсию. Доказательства инфекции были дополнительно подтверждены с помощью ПЦР-анализа, таким образом, была установлена ​​его роль в качестве патогена человека, а затем было выполнено полногеномное секвенирование.

Содержание

  • 1 Описание
  • 2 Филогенетический анализ
  • 3 Культура и Наблюдения за окрашиванием
  • 4 Морфология с помощью электронной микроскопии
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние ссылки

Описание

Наблюдение за штаммом 20B Diplorickettsia massiliensis с помощью трансмиссионной электронной микроскопии

Diplorickettsia massiliensis (mas.si 'li.en.sis. L. gen. adj. massiliensis, из Massilia, латинского названия Марсель, Франция, где этот организм был впервые выращен, идентифицированы и охарактеризованы). Описание относится к штамму рода 20В. Известное географическое распространение этой бактерии - Словакия. Этот изолят был депонирован в коллекции двух Всемирной организации здравоохранения Центров сотрудничества по изучению риккетсиозов в Братиславе, Словацкой Республике и Faculté de Médecine, Университет Средиземноморья в Марселе, Франция, а также в Немецкой коллекции микроорганизмов и клеточных культур (Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen, DSMZ) под ссылка DSM 233381.

Номера доступа GenBank / EMBL / DDBJ для гена 16S рРНК, последовательностей rpoB, parC и ftsY штамма B20 представляют собой GQ857549, GQ983049, GQ983050 и GU289825, соответственно.

Филогенетический анализ

Сравнительный анализ последовательности гена 16S рРНК показал, что этот штамм принадлежит к семейству Coxiellaceae, порядку Legionellales из Gamma- протеобактерии, а ближайшие родственники отличаются Rickettsiella spp. Фрагмент гена rrs длиной 1476 п.н., кодирующий рибосомную РНК 16S, амплифицировали и секвенировали. Удивительно, но поиск BLAST не привел к близкому сходству с какими-либо опубликованными последовательностями гена 16S РНК других бактерий. Уровень сходства последовательностей гена 16S рРНК между штаммом 20B и другими признанными видами этого семейства был ниже 94,5%. Неполные последовательности генов rpoB, parC и ftsY подтвердили филогенетическое положение нового изолята. Содержание G + C, оцененное на основе полногеномного анализа штамма 20B, составило 37,88%. На основе его фенотипических и генотипических свойств, а также филогенетической самобытности Mediannikov et al. предложили отнести штамм 20B к новому роду Diplorickettsia как типовой штамм нового вида, названного Diplorickettsia massiliensis sp. ноя

Бактерии штамма Diplorickettsia massiliensis 20B, выращенные в клетках XTC-2

Наблюдения за культивированием и окрашиванием

Бактерии, визуализированные в богатой культуре, созданной в линии клеток XTC-2 путем окрашивания по Гименезу, проявлялись в виде внутриклеточных красных палочек, обычно сгруппированных в пары, но не связанные друг с другом. Ручной подсчет бактерий в нелизированной эукариотической клетке показал, что почти все бактерии (97%) были парными. Бактерии накапливались в цитоплазме клеток, но не в ядре. Максимальное количество бактерий, наблюдаемое в одной клетке, превышало 100. Инфицированные клетки часто разрушались во время центрифугирования с использованием центрифуги Cytospin (Thermo Shandon), что выявлялось при последующем окрашивании. Изолят был грамотрицательным при окрашивании внеклеточных бактерий.

Визуализация штамма 20B Diplorickettsia massiliensis с использованием просвечивающей электронной микроскопии с окрашиванием уранилацетатом

Кроме того, Mediannikov et al. исследовали процент инфицированных клеток и среднее количество бактерий на клетку в различных клеточных линиях. Наибольшая скорость роста и наличие цитопатогенного эффекта при культивировании бактерий в клетках XTC-2 (Xenopus laevis ). Цитопатогенный эффект, в том числе отрыв клеточного слоя и разрушение клеток, наблюдался через 3-5 дней после инокуляции. Это была единственная клеточная линия со 100% инфицированием клеток, среднее количество бактерий на клетку было более 100 во всех исследованных сериях. Скорость роста и накопление бактерий в клетках были ниже в клеточных линиях человеческого происхождения (HEL и MRC5), культивируемых при 32 ° C, но были минимальными в клетках L929 мыши.

Множественные попытки культивирования бактерий в твердых аксенических средах (как обычных, так и Legionella -специфичных) не увенчались успехом.

Внутренняя структура бактерий с помощью просвечивающей электронной микроскопии

Морфология с помощью электронной микроскопии

Отрицательное окрашивание показало, что бактерии имеют среднюю длину 1540 нм (диапазон: от 848 до 3067 нм) и средний диаметр 695 нм (диапазон: от 515 до 992 нм). Самые длинные бактерии находились в процессе деления. Бактерии штамма 20B собирали, когда они были внеклеточными, для исследования поверхностных структур. В отличие от других внутриклеточных бактерий, включая риккетсии, штамм 20B не смог выделить поверхностные гликопротеины при окраске рутениевым красным.

Все бактерии, наблюдаемые внутриклеточно, располагались в вакуолях. В отличие от Rickettsiella, они не имеют регулярной организации, свидетельствующей о кристаллической структуре. Основываясь на визуальном впечатлении от парных бактерий, они подсчитали количество бактерий в вакуолях по разрезу: 51,4% вакуолей содержали 2 бактерии, 13,2% содержали 3 или 4 бактерии, 1,7% содержали более 4 бактерий и 33,7% содержали 1 бактерию.. Ультратонкий срез может проходить через только одну бактерию в вакуоли, которая на самом деле содержит несколько бактерий, поэтому это может означать, что несколько этих псевдо-одиночных бактерий также могут быть спарены. Принимая во внимание эти данные, был сделан вывод, что большинство бактерий спариваются внутри вакуолей. Обнаружены также бактерии в процессе деления внутри вакуолей.

Внутренняя структура бактерий нетипична. Было обнаружено, что электронно-плотные кристаллические структуры расположены в центре почти всех бактерий, обычно окруженные многослойными структурами, подобными оболочке. Эти слои чередуются с электронно-плотными полосами (6 нанометров) и световыми полосами (15 нанометров). У одной бактерии может быть до семи электронно-плотных слоев.

.

Ссылки

Определение бесплатных культурных работ logo notext.svg Эта статья включает текст из бесплатного контента работы. Лицензия CC-BY. Текст взят из Новая облигатная внутриклеточная гамма-протеобактерия, ассоциированная с иксодовыми клещами, Diplorickettsia massiliensis, Gen. Nov., Sp. Ноя, Олег Медианников, Зузана Секейова, Мари-Лор Бирг и Дидье Рауль, PLoS One. Чтобы узнать, как добавить текст открытой лицензии в статьи Википедии, см. . Для получения информации о повторном использовании текста из Википедии см. условия использования.

Внешние ссылки

Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: mail@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте