Дэвид Санкофф | |
---|---|
Родился | (1942-12-31) 31 декабря 1942 г. (возраст 77). Монреаль, Квебек, Канада |
Гражданство | ![]() |
Alma mater | Университет Макгилла (бакалавр, магистр, доктор философии) |
Известен для | |
Награды |
|
Научная карьера | |
Области | |
Учреждения | |
Диссертация | Историческая лингвистика как случайный процесс (1969) |
Научный руководитель | Дональд Эндрю Доусон |
Веб-сайт | albuquerque.bioinformatics.uottawa.ca |
Дэвид Санкофф (родился 31 декабря 1942 г.) - канадский математик, биоинформатик, компьютерщик ученый и лингвист. Он возглавляет канадскую кафедру математической геномики на факультете математики и статистики в Университете Оттавы, а также работает на кафедре биологии и в Школе информационных технологий и инженерии. Он был редактором-основателем научного журнала Language Variation and Change (Кембридж) и является членом редакционных коллегий ряда журналов по биоинформатике, компьютерной биологии и лингвистике. Санкофф наиболее известен своими новаторскими вкладами в компьютерную лингвистику и компьютерную геномику. Считается одним из основоположников биоинформатики. В частности, он сыграл ключевую роль во внедрении динамического программирования для выравнивания последовательностей и других проблем в вычислительной биологии. По словам Павла Певзнера, «[Майкл Уотерман ] и Дэвид Санкофф ответственны за преобразование биоинформатики из« коллекции штампов »нечетко определенных проблем в строгую дисциплину с важными биологическими Приложения."
Санкофф опубликовал свою первую работу в 1963 году, когда был студентом студент факультета математики Университета Макгилла. Начиная со своей докторской диссертации, он разработал математические формулировки ряда ключевых концепций в социо- и исторической лингвистике, включая глоттохронологию, анализ переменных правил (совместно с Генриеттой Седергрен), лингвистический рынок и переключение кода.
После получения докторской степени. В области математики Санкофф начал свою академическую карьеру в Монреальском университете в 1969 году. В 1971 году Санкофф заинтересовался сравнением молекулярных последовательностей и разработал первый вариант квадратичного времени Алгоритм Нидлмана-Вунша для попарного выравнивания последовательностей. В 1973 году Санкофф и Роберт Седергрен разработали метод совместной оценки для филогении и множественного выравнивания последовательностей 5S рибосомной РНК, заложив алгоритмическую основы сравнительной геномики. В 1975 году Санкофф и Вацлав Хватал изучили поведение самой длинной общей задачи подпоследовательности на случайных входных данных; константы пропорциональности, возникающие в этом исследовании, стали известны как константы Хватала – Санкоффа. В 1980 году Роберт Седерген и Дэвид Санкофф создали первую исследовательскую группу по биоинформатике в Университете Монреаля. Работа Санкофф в области биоинформатики касается вторичной структуры РНК, перестройки генома, выравнивания последовательностей, эволюции генома и филогенетики.