Дэвид Липман | |
---|---|
![]() | |
Родился | Дэвид Дж. Липман |
Alma mater | Университет Брауна. Университет в Буффало, Государственный университет Нью-Йорка |
Известный | Влияние на развитие BLAST ( биотехнология) |
Награды | Премия старшего ученого ISCB. Член американской Национальной академии наук. научный сотрудник ISCB |
Научная карьера | |
Области деятельности | Биоинформатика. Вычислительная биология. Методы сравнения последовательностей. Сравнительная геномика. Молекулярная эволюция |
Учреждения | Национальный центр биотехнологической информации. Университет Брауна. Университет в Буффало, Государственный университет Нью-Йорк |
Известные студенты | Стивен Альтшул. Марк Богуски |
Веб-сайт | www.ncbi.nlm.nih.gov / research / staff / lipman |
Дэвид Дж. Липман - американский биолог, который с 1989 по 2017 год был директором Национального центра биотехнологической информации (NCBI) в Национальных институтах здравоохранения. NCBI является домом для GenBank, американского узла Международного консорциума баз данных последовательностей, и PubMed, одного из наиболее часто используемых сайтов в мире для поиск и извлечение биомедицинской информации. Липман - один из первых авторов программы выравнивания последовательностей BLAST и уважаемый деятель в биоинформатике. В 2017 году он покинул NCBI и стал главным научным сотрудником компании Impossible Foods.
Липман получил степень бакалавра в Университете Брауна и MD в 1980 году в Университете Буффало, Государственный университет Нью-Йорка
Липман был директором Национального центра биотехнологической информации Национальной медицинской библиотеки Национального института здоровья. В этот центр входили группы, возглавляемые Стивеном Альтшулом (еще один соавтор BLAST), Дэвидом Ландсманом Юджином Кунином (плодовитым автором сравнительной геномики ) и Л. Аравинд.
Он наиболее известен своей работой над серией алгоритмов сходства последовательностей, начиная с алгоритма Уилбура-Липмана в 1983 году, FASTA поисковый поиск в 1985 году, BLAST в 1990 году и Gapped BLAST и PSI-BLAST в 1997 году.
Липман также работает с Деннисом А. Бенсоном и другими в NCBI, внося свой вклад в поддержание и улучшение GenBank и ежегодно публикует документ об их прогрессе. Усовершенствования включают спецификацию формата данных, обработку данных, интеграцию информации о белках с последовательностями ДНК и научной литературой.
Он был одним из создателей проекта по секвенированию генома гриппа. секвенировать и сделать доступными геномы тысяч изолятов вируса гриппа.
Он был одним из первых подписантов Заявления Bethesda о публикации в открытом доступе.
Он также является редактором- главный для открытого доступа, рецензируемого онлайн научного журнала под названием Biology Direct.
В мае 2017 г. было объявлено что Липман оставит свою должность в NCBI, чтобы присоединиться к растительной мясной компании Impossible Foods в качестве главного научного директора.
Липман получил Ассоциация биомолекулярных ресурсов Награда за выдающийся вклад в биомолекулярные технологии в 1996 году.
В 2004 году он был награжден премией ISCB Senior Scientist Award и избран стипендиатом ISCB в 2009 году Международным обществом вычислительной биологии.
. В 2005 году д-р Липман был избран членом Национальной академии наук США.
. В 2013 г. он получил награду Белого дома «Сторонник перемен в области открытой науки».