Войти
В масс-спектрометрии, сбор данных, не зависящий от данных (DIA ) - это метод определения молекулярной структуры, в котором все ионы в выбранном диапазоне m / z фрагментируются и анализируются на втором этапе тандемной масс-спектрометрии. Тандемные масс-спектры получают либо путем фрагментации всех ионов, попадающих в масс-спектрометр в заданное время (так называемый широкополосный DIA), либо путем последовательного выделения и фрагментирования диапазонов m / z. DIA является альтернативой сбора данных, зависимого от данных (DDA), где фиксированное количество ионов-предшественников выбирается и анализируется с помощью тандемной масс-спектрометрии.
Одним из первых подходов DIA был метод диссоциации сопло-скиммер, называемый диссоциацией, вызванной столкновением (CID). Фрагментация может происходить в источнике ионов масс-спектрометра за счет увеличения напряжения сопла-скиммера в ионизации электрораспылением..
МС - это широкополосный метод DIA, в котором используется чередование низкоэнергетических CID и высокоэнергетических CID. CID с низкой энергией используется для получения масс-спектров иона-предшественника, тогда как CID с высокой энергией используется для получения информации об ионе продукта с помощью тандемной масс-спектрометрии.
Анализ данных, как правило, является сложной задачей для методов DIA, поскольку полученные спектры фрагментных ионов сильно мультиплексированы. Таким образом, в спектрах DIA прямая связь между ионом-предшественником и его ионами-фрагментами теряется, поскольку ионы-фрагменты в спектрах DIA потенциально могут быть результатом нескольких ионов-предшественников (любой ион-предшественник, присутствующий в диапазоне m / z, из которого был получен спектр DIA).
Один из подходов к анализу данных DIA пытается использовать поисковые машины на основе баз данных, используемые в зависимом от данных сборе для поиска произведенных мультиплексированных спектров. Этот подход может быть улучшен путем отнесения отдельного фрагментного иона к ионам-предшественникам, наблюдаемым при сканировании ионов-предшественников, с использованием профиля элюирования фрагментных ионов и ионов-предшественников, а затем поиска в результирующих «псевдоспектрах».
A Второй подход к анализу данных DIA основан на целевом анализе, также известном как SWATH-MS (последовательное оконное получение всех теоретических масс-спектров фрагментных ионов). Этот подход использует целевое извлечение следов ионов фрагментов непосредственно для идентификации и количественной оценки без явной попытки демультиплексирования спектров ионов фрагментов DIA.
.
