Дезоксирибонуклеаза I

редактировать
DNASE1
Dnase1.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы DNASE1, DNL1, DRNI, дезоксирибонуклеаза I, дезоксирибонуклеаза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 125505 MGI: 103157 HomoloGene : 3826 Генные карты: DNASE1
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr. Хромосома 16 (человек)
Хромосома 16 (человек) Геномное местоположение для DNASE1 Геномное местоположение для DNASE1
Полоса 16p13.3Начало3,611,728 bp
Конец3,680,143 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE DNASE1 210165 at fs.png
Дополнительные данные эталонных выражений
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

1773

13419

Ensembl

ENSG00000213918

ENSMUSG00000005980

UniProt

P24855

P49183

RefSe (мРНК)

NM_005223. NM_001351825

NM_010061. NM_001357143

RefSeq (белок)

NP_005214. NP_001338754

NP_034191. NP_00134407 2

Местоположение (UCSC)Chr 16: 3,61 - 3,68 Мб Chr 16: 4,04 - 4,04 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дезоксирибонуклеаза I (обычно называемая ДНКаза I ), представляет собой эндонуклеазу, кодируемую человеческим геном DNASE1 . ДНКаза I представляет собой нуклеазу, которая расщепляет ДНК преимущественно по фосфодиэфирным связям, смежным с пиримидином нуклеотидом, с образованием полинуклеотидов с 5'-фосфатными концевыми группами. со свободной гидроксильной группой в положении 3 ', в среднем образуя тетрануклеотиды. Он действует на одноцепочечную ДНК, двухцепочечную ДНК и хроматин. В дополнение к своей роли эндонуклеазы, способствующей управлению отходами, было высказано предположение, что она является одной из дезоксирибонуклеаз, ответственных за фрагментацию ДНК во время апоптоза.

ДНКаза I связывается с цитоскелетный белок актин. Он связывает мономеры актина с очень высоким (суб-наномолярным) сродством и полимеры актина с более низким сродством. Функция этого взаимодействия неясна. Однако, поскольку актин-связанная ДНКаза I является ферментативно неактивной, комплекс ДНКаза- актин может быть формой хранения ДНКазы I, которая предотвращает повреждение генетической информации.

Этот ген кодирует член семейства ДНКаз. Этот белок хранится в гранулах зимогена ядерной оболочки и функционирует, расщепляя ДНК эндонуклеолитическим способом. Было охарактеризовано по крайней мере шесть аутосомных кодоминантных аллелей, от DNASE1 * 1 до DNASE1 * 6, и последовательность DNASE1 * 2, представленная в этой записи. Мутации в этом гене, а также фактор, инактивирующий его ферментный продукт, были связаны с системной красной волчанкой (СКВ), аутоиммунным заболеванием. рекомбинантная форма этого белка используется для лечения одного из симптомов кистозного фиброза путем гидролиза внеклеточной ДНК в мокроте и снижения ее вязкости. Альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга этого гена наблюдались, но не были полностью охарактеризованы.

.

В геномике

В геномике считается, что гиперчувствительные сайты к ДНКазе I характеризуются открытыми, доступными хроматин; следовательно, анализ чувствительности к ДНКазе I является широко используемой методологией в геномике для определения того, какие области генома могут содержать активные гены

Специфичность последовательности ДНКазы I

Недавно было сообщено, что ДНКаза I показаны некоторые уровни специфичности последовательности, которые могут зависеть от условий эксперимента. В отличие от других ферментов, обладающих высокой субстратной специфичностью, ДНКаза I определенно не расщепляет с абсолютной специфичностью последовательности. Однако расщепление по сайтам, содержащим C или G на своем 3'-конце, менее эффективно.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-17 13:45:07
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте