Пептидил-пролил-цис-транс-изомераза циклофилинового типа / CLD | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ленточная диаграмма циклофилина А в комплексе с циклоспорином (желтый). Из PDB : 1CWA . | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Символ | Pro_isomerase | ||||||||
Pfam | PF00160 | ||||||||
Pfam клан | CL0475 | ||||||||
InterPro | IPR002130 | ||||||||
PROSITE | PDOC00154 | ||||||||
SCOPe | 1cyh / SUPFAM | ||||||||
|
Циклофилины (CYP) представляют собой семейство белков, названных по их способности связываться с циклоспорином (циклоспорином). A), иммунодепрессант, который обычно используется для подавления отторжения после внутренних трансплантации органов. Они встречаются во всех сферах жизни. Эти белки обладают пептидил пролилизомеразной активностью, которая катализирует изомеризацию пептидных связей из транс-формы в цис-форму при пролине. остатков и облегчает сворачивание белка..
Циклофилин A является цитозольным и очень распространенным белком. Белок принадлежит к семейству изоферментов, включая циклофилины B и C, и белок естественных клеток-киллеров, родственный циклофилину. Основные изоформы были обнаружены в отдельных клетках, в том числе внутри эндоплазматического ретикулума, а некоторые даже секретируются.
Гены человека кодирующие белки, содержащие домен циклофилина, включают:
Циклофилин A (CYPA), также известный как пептидилпролилизомераза A (PPIA), который обнаружен в цитозоле, имеет структура бета-баррель с двумя альфа-спиралями и бета-листом. Другие циклофилины имеют структуру, сходную с циклофилином A. Комплекс циклоспорин-циклофилин A ингибирует кальций / кальмодулин -зависимую фосфатазу, кальциневрин, ингибирование которого, как полагают, подавляет отторжение органа путем остановки производства провоспалительных молекул TNF альфа и интерлейкина 2.
Циклофилин A также известен как рекрутируется полипротеином Gag во время инфицирования вирусом ВИЧ-1, и его включение в новые вирусные частицы важно для инфицирования ВИЧ-1.
Циклофилин D ( PPIF, обратите внимание, что литература сбивает с толку, митохондриальный циклофилин кодируется геном PPIF), который расположен в матрице из митохондрий, является только модулятором, но может или не может быть структурным компонентом поры с переходом проницаемости митохондрий. Открытие пор увеличивает проницаемость внутренней митохондриальной мембраны, обеспечивает приток цитозольных молекул в митохондриальный матрикс, увеличивает объем матрикса и разрушает внешние митохондрии. мембрана. В результате митохондрии попадают в функциональное нарушение, поэтому открытие поры играет важную роль в гибели клеток. Считается, что циклофилин D регулирует открытие поры, поскольку циклоспорин A, который связывается с CyP-D, ингибирует открытие поры.
Однако митохондрии, полученные из цист Artemia franciscana, не проявляют переходной поры митохондриальной проницаемости
Сверхэкспрессия циклофилина А был связан с плохой реакцией на воспалительные заболевания, прогрессированием или метастазированием рака и старением.
Ингибиторы циклофилина, такие как циклоспорин, разрабатываются для лечения нейродегенеративных заболеваний. Ингибирование циклофилина также может быть средством лечения заболеваний печени.