Crystallin

редактировать

В анатомии, кристаллин представляет собой водорастворимый структурный белок, обнаруженный в линзе и роговице глазок с учетом прозрачности конструкции. Он также был обнаружен в других местах, таких как сердце, и в агрессивных опухолях рака груди. Поскольку было показано, что повреждение хрусталика может способствовать регенерации нервов, кристаллин стал областью нейронных исследований. До сих пор было продемонстрировано, что кристаллин β b2 (crybb2) может быть фактором, способствующим развитию нейритов.

Содержание

  • 1 Функция
  • 2 Активность фермента
  • 3 Классификация
    • 3.1 Альфа-кристаллин
    • 3.2 Бета и гамма кристаллин
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 Внешние ссылки

Функция

Основная функция кристаллинов по крайней мере в линза глаза, вероятно, увеличивает показатель преломления, не загораживая свет. Однако это не единственная их функция. Стало ясно, что кристаллины могут выполнять несколько метаболических и регуляторных функций как внутри хрусталика, так и в других частях тела. Больше белков, содержащих домены βγ-кристаллина, в настоящее время охарактеризовано как кальцийсвязывающие белки с мотивом греческого ключа как новым мотивом связывания кальция.

Активность фермента

Некоторые кристаллины являются активные ферменты, в то время как другие неактивны, но проявляют гомологию с другими ферментами. Кристаллины различных групп организмов связаны с большим количеством различных белков, в том числе белки птиц и рептилий связаны с лактатдегидрогеназой и аргининосукцинатлиазой, а белки млекопитающих - с алкогольдегидрогеназа и хинонредуктаза, и таковые от головоногих до глутатион-S-трансферазы и альдегиддегидрогеназы. Являются ли эти кристаллины продуктами случайной эволюции в том смысле, что эти конкретные ферменты оказались прозрачными и хорошо растворимыми, или же эти разнообразные ферментативные активности являются частью защитного механизма хрусталика, - тема активных исследований. Привлечение белка, который изначально развивался с одной функцией для выполнения второй, несвязанной функции, является примером экзаптации.

выравнивания альфа-, бета- и гамма-белков человеческого кристаллина от Uniprot.

Классификация

Кристаллины из хрусталика глаза позвоночных подразделяются на три основных типа: альфа, бета и гамма-кристаллины. Эти различия основаны на порядке, в котором они элюируются из колонки гель-фильтрационной хроматографии. Их также называют вездесущими кристаллинами. Бета- и гамма-кристаллины (такие как CRYGC ) подобны по последовательности, структуре и топологии доменов и, таким образом, были сгруппированы вместе в суперсемейство белков , называемых βγ-кристаллинами. Семейство α-кристаллинов и βγ-кристаллинов составляют основное семейство белков, присутствующих в хрусталике. Они встречаются у всех классов позвоночных (хотя гамма-кристаллины в птичьих линзах низкие или отсутствуют); и дельта-кристаллин обнаружен исключительно у рептилий и птиц.

В дополнение к этим кристаллинам существуют другие таксон -специфические кристаллины, которые обнаруживаются только в хрусталике некоторых организмов; к ним относятся дельта, эпсилон, тау и йота-кристаллины. Например, альфа-, бета- и дельта-кристаллины обнаружены в линзах птиц и рептилий, а семейства альфа, бета и гамма обнаружены в линзах всех других позвоночных.

Альфа-кристаллин

Альфа-кристаллин A-цепь, N-конец
Идентификаторы
СимволКристаллин
Pfam PF00525
InterPro IPR003090

Альфа-кристаллин встречается в виде крупных агрегатов, состоящих из двух типов связанных субъединиц (A и B), которые очень похожи на небольшие (15-30 кДа) белки теплового шока. (sHsps ), особенно в их С-концевых половинах. Отношения между этими семействами - это классическая дупликация и дивергенция генов из небольшого семейства HSP, позволяющая адаптироваться к новым функциям. Дивергенция, вероятно, произошла до развития хрусталика глаза, альфа-кристаллин был обнаружен в небольших количествах в тканях вне хрусталика.

Альфа-кристаллин имеет шаперон -подобные свойства, включая способность предотвращать осаждение денатурированных белков и повышение устойчивости клеток к стрессу. Было высказано предположение, что эти функции важны для поддержания прозрачности линз и предотвращения катаракты. Это подтверждается наблюдением, что мутации альфа-кристаллина связаны с образованием катаракты.

N-концевой домен альфа-кристаллина не является необходимым для димеризации или активности шаперона, но, по-видимому, необходим для образования агрегатов более высокого порядка.

Бета- и гамма-кристаллин

Бета / гамма кристаллин
Идентификаторы
СимволCrystall
Pfam PF00030
InterPro IPR001064
PROSITE PDOC00197
SCOPe 4gcr / SUPFAM

Бета и гамма-кристаллин образуют отдельное семейство. Структурно бета- и гамма-кристаллины состоят из двух похожих доменов, которые, в свою очередь, состоят из двух одинаковых мотивов, причем два домена соединены коротким соединяющим пептидом. Каждый мотив, состоящий примерно из сорока аминокислотных остатков, сложен по характерному рисунку греческих ключей. Однако бета-кристаллин представляет собой олигомер, состоящий из сложной группы молекул, тогда как гамма-кристаллин представляет собой более простой мономер.

Список человеческих кристаллинов
Список человеческих кристаллинов
UniProt Имя записиАльтернативные имена геновДлина
AIM1L_HUMANAIM1L CRYBG2616
AIM1_HUMANAIM1 CRYBG11723
ARLY_HUMANASL464
CRBA1_HUMANCRYBA1 CRYB1215
CRBA2_HUMANCRYBA2197
CRBB1_HUMANCRYBB1252
CRBA4_HUMANCRYBA4196
CRBB2_HUMANCRYBB2 CRYB2 CRYB2A205
CRBB3_HUMANCRYBB3 CRYB3211
CRBG3_HUMANCRYBG31022
CRBS_HUMANCRYGS CRYG8178
CRGA_HUMANCRYGA CRYG1174
CRGC_HUMANCRYGC CRYG3174
CRGB_HUMANCRYGB CRYG2175
CRGN_HUMANCRYGN182
CRGD_HUMANCRYGD CRYG4174
CRY AA_HUMANCRYAA CRYA1 HSPB4173
CRYAB_HUMANCRYAB CRYA2175
CRYL1_HUMANCRYL1 CRY319
CRYM_HUMANCRYM THBP314
HSPB2_HUMANHSPB2182
HSPB3_HUMANHSPB3 HSP27 HSPL27150
HSPB8_HUMANHSPB8 CRYAC E2IG1 HSP22 PP1629196
HSPB7_HUMANHSPB7 CVHSP170
HSPB9_HUMANHSPB9159
HSPB1_HUMANHSPB1 HSP27 HSP28205
HSPB6_HUMANHSPB6160
IFT25_HUMANHSPB11 C1orf41 IFT25 HSPC034144
MAF_HUMANMAF373
ODFP1_HUMANODF1 ODFP250
QORL1_HUMANCRYZL1 4P11349
QOR_HUMANCRYZ329
TITIN_HUMANTTN34350
ZEB1_HUMANZEB1 AREB6 TCF81124
Q9UFA7_HUMANDKFZp434A0627 CRYGS hCG_16149120
B4DU04_HUMANAIM1 hCG_33516542
A8KAH6_HUMANHSPB2 hCG_ 9461182
Q6ICS9_HUMANHSPB3 hCG_1736006150
Q68DG0_HUMANDKFZp779D0968 HSPB7174 <170_HUMNANHSPB7 hCG_23506245
B4DLE8_HUMANCRYBG31365
C3VMY8_HUMANCRYAB175
R4UMM2_HUMANCRYBB2205
B3KQL3_HUMAN119
Q24JT5_HUMANCRYGA105
V9HWB6_HUMANHEL55160
B4DNC2_HUMAN196
V9HW27_HUMANHEL-S-101175
H0YCW8_HUMANCRYAB106
E9PHE4_HUMANCRYAA136
E9PNH7_HUMANCRYAB106
E7EWH7_HUMANCRYAA153
B4DL87_HUMAN170
V9HW43_HUMANHEL-S-102205
E9PR44_HUMANCRYAB174
Q8IVN0_HUMAN86
B7ZAH2_HUMAN542
C9J5A3_HUMANHSPB7124
E9PRS4_HUMANCRYAB69
K7EP04_HUMANHSPB6137
I3L3Y1_HUMANCRYM97
H0YG30_H UMANHSPB8152
H9KVC2_HUMANCRYM272
E9PS12_HUMANCRYAB77
E9PIR9_HUMANAIM1L787
B4DUL6_HUMAN80
I3NI53_HUMANCRYM140
Q9NTH7_HUMANDKFZp434L1713264
J3KQW1_HUMANAIM1L296
Q96QW7_HUMANAIM1316
I3L2W5_HUMANCRYM165
B1AHR5_HUMANCRYBB3113
B4DLI1_HUMAN403
I3L325_HUMANCRYM241
Q7Z3C1_HUMANDKFZp686A14192191
B4DWM9_HUMAN154
Q71V83_HUMANCRYAA>69
Q6P5P8_HUMANAIM1326
C9JDH2_HUMANCRYBA2129
B4DIA6_HUMAN155
Q13684_HUMAN56
F8WE04_HUMANHSPB1186
J3QRT1_HUMANCRYBA175
E9PRA8_HUMANCRYAB155
E9PJL7_HUMANCRYAB130
C9J5N2_HUMANCRYBG3229
I3L3J9_HUMANCRYM26
C9J659_HUMANCRYBG3131
D3YTC6_HUMANHSPB7165

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-16 10:29:26
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте