Crenarchaeota (также известные как Crenarchaea или эоциты ) - это археи, которые были классифицированы как тип домена Archaea. Первоначально считалось, что Crenarchaeota являются серозависимыми экстремофилами, но недавние исследования выявили характерную экологическую рРНК Crenarchaeota, что указывает на то, что эти организмы могут быть наиболее многочисленными археями в морской среде. Первоначально они были отделены от других архей на основе последовательностей рРНК; другие физиологические особенности, такие как отсутствие гистонов, подтверждают это деление, хотя было обнаружено, что некоторые кренархеи имеют гистоны. До недавнего времени все культивируемые Crenarchaea были термофильными или гипертермофильными организмами, некоторые из которых имели способность расти при температуре до 113 ° C. Эти организмы окрашивают грамотрицательные и морфологически разнообразны, имеют палочки, кокки, нитчатые и клетки странной формы.
Содержание
- 1 Sulfolobus
- 2 Морские виды
- 3 Гипотеза эоцитов
- 4 См. Также
- 5 Ссылки
- 6 Дополнительная литература
- 6.1 Научные журналы
- 6.2 Научные книги
- 6.3 Научные базы данных
- 7 Внешние ссылки
Sulfolobus
Одним из наиболее охарактеризованных представителей Crenarcheota является Sulfolobus solfataricus. Этот организм был первоначально выделен из геотермально нагретых серных источников в Италии, и растет при 80 ° C и pH 2–4. С момента его первоначальной характеристики, пионера в исследованиях термофилов и архей, похожие виды одного и того же рода были обнаружены по всему миру. В отличие от подавляющего большинства культивируемых термофилов, Sulfolobus растет аэробно и хемоорганотрофно (получая энергию из органических источников, таких как сахар). Эти факторы позволяют намного легче расти в лабораторных условиях, чем анаэробные организмы, и привели к тому, что Sulfolobus стал модельным организмом для изучения гипертермофилов и большой группы разнообразных вирусов, которые размножаются внутри них.
Морские виды
Начиная с 1992 года, были опубликованы данные о последовательностях генов, принадлежащих кренархеям, в морской среде. С тех пор анализ обильных липидов из мембран Crenarchaea, взятых из открытого океана, использовался для определения концентрации этих «низкотемпературных Crenarchaea» (см. TEX-86 ). Основываясь на этих измерениях их липидов, считается, что Crenarchaea очень многочисленны и являются одним из основных участников фиксации углерода. Последовательности ДНК Crenarchaea также были обнаружены в почве и пресноводных средах, что позволяет предположить, что этот тип распространен повсеместно в большинстве сред.
В 2005 году были опубликованы свидетельства о первых культивируемых «низкотемпературных Crenarchaea». Названный Nitrosopumilus maritimus, это окисляющий аммиак организм, выделенный из морского аквариума и выращенный при 28 ° C.
Гипотеза эоцитов
Гипотеза эоцитов
Гипотеза эоцитов, предложенная в 1980-х годах Джеймсом Лейком, предполагает, что эукариоты произошли от прокариотических эоцитов.
Одним из возможных свидетельств, подтверждающих тесную связь между Crenarchaea и эукариотами, является наличие гомолога субъединицы РНК-полимеразы Rbp-8 у Crenarchea, но не у Euryarchaea
См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Научные журналы
- Cavalier-Smith, T (2002). «Неомуранское происхождение архебактерий, негибактериальный корень универсального дерева и бактериальная мегаклассификация». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Часть 1): 7–76. DOI : 10.1099 / 00207713-52-1-7. PMID 11837318.
- Stackebrandt, E; Фредериксен В; Гаррити ГМ; Гримонт PA; Кампфер П; Maiden MC; Nesme X; Росселло-Мора Р; Качели J; Truper HG; Vauterin L; Палата переменного тока; Whitman WB (2002). «Отчет специального комитета по переоценке определения видов в бактериологии». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 52 (Pt 3): 1043–1047. doi : 10.1099 / ijs.0.02360-0. PMID 12054223.
- Gurtler, V; Mayall BC (2001). «Геномные подходы к типированию, систематике и эволюции бактериальных изолятов». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Часть 1): 3–16. DOI : 10.1099 / 00207713-51-1-3. PMID 11211268.
- Далеви, Д; Hugenholtz P; Блэколл LL (2001). «Многогрупповой подход к разрешению филогенетических отношений на уровне деления с использованием данных 16S рДНК». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Часть 2): 385–391. DOI : 10.1099 / 00207713-51-2-385. PMID 11321083.
- Кесвани, Дж; Уитмен ВБ (2001). «Связь сходства последовательности 16S рРНК с гибридизацией ДНК у прокариот». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Часть 2): 667–678. DOI : 10.1099 / 00207713-51-2-667. PMID 11321113.
- Янг, Дж. М. (2001). «Последствия альтернативных классификаций и горизонтального переноса генов для бактериальной таксономии». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 3): 945–953. DOI : 10.1099 / 00207713-51-3-945. PMID 11411719.
- Christensen, H; Bisgaard M; Фредериксен В; Mutters R; Kuhnert P; Олсен JE (2001). «Достаточно ли характеристики одного изолята для достоверной публикации нового рода или вида? Предложение изменить рекомендацию 30b Бактериологического кодекса (редакция 1990 г.)». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 6): 2221–2225. DOI : 10.1099 / 00207713-51-6-2221. PMID 11760965.
- Christensen, H; Angen O; Mutters R; Olsen JE; Бисгаард М (2000). «Гибридизация ДНК-ДНК, определенная в микролунках с использованием ковалентного присоединения ДНК». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (3): 1095–1102. DOI : 10.1099 / 00207713-50-3-1095. PMID 10843050.
- Сюй, HX; Кавамура Y; Ли Н; Zhao L; Ли ТМ; Ли Цзы; Шу С; Эзаки Т. (2000). «Экспресс-метод определения содержания G + C в бактериальных хромосомах путем мониторинга интенсивности флуоресценции во время денатурации ДНК в капиллярной трубке». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1463–1469. DOI : 10.1099 / 00207713-50-4-1463. PMID 10939651.
- Янг, JM (2000). «Рекомендации по избежанию путаницы с Бактериологическим Кодексом». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1687–1689. doi : 10.1099 / 00207713-50-4-1687. PMID 10939677.
- Hansmann, S; Мартин В. (2000). «Филогения 33 рибосомных и шести других белков, кодируемых в древнем кластере генов, который сохраняется в геномах прокариот: влияние исключения плохо выравниваемых сайтов из анализа». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (4): 1655–1663. DOI : 10.1099 / 00207713-50-4-1655. PMID 10939673.
- Тиндалл, Б.Дж. (1999). «Предложение об изменении Правила, регулирующего обозначение типовых штаммов, депонированных под номерами коллекции культур, выделенными для патентных целей». Int. J. Syst. Бактериол. 49 (3): 1317–1319. DOI : 10.1099 / 00207713-49-3-1317. PMID 10490293.
- Тиндалл, Б.Дж. (1999). «Предложение изменить Правило 18a, Правило 18f и Правило 30, чтобы ограничить обратные последствия изменений, принятых ICSB». Int. J. Syst. Бактериол. 49 (3): 1321–1322. DOI : 10.1099 / 00207713-49-3-1321. PMID 10425797.
- Тиндалл, Б.Дж. (1999). «Непонимание бактериологического кода». Int. J. Syst. Бактериол. 49 (3): 1313–1316. DOI : 10.1099 / 00207713-49-3-1313. PMID 10425796.
- Тиндалл, Б.Дж. (1999). «Предложения по обновлению и внесению изменений в Бактериологический кодекс». Int. J. Syst. Бактериол. 49 (3): 1309–1312. DOI : 10.1099 / 00207713-49-3-1309. PMID 10425795.
- Burggraf, S; Huber H; Стеттер К.О. (1997). «Реклассификация порядков и семейств кренархов в соответствии с данными о последовательности 16S рРНК». Int. J. Syst. Бактериол. 47 (3): 657–660. DOI : 10.1099 / 00207713-47-3-657. PMID 9226896.
- Palys, T; Накамура Л.К.; Cohan FM (1997). «Открытие и классификация экологического разнообразия в бактериальном мире: роль данных последовательности ДНК». Int. J. Syst. Бактериол. 47 (4): 1145–1156. DOI : 10.1099 / 00207713-47-4-1145. PMID 9336922.
- Euzeby, JP (1997). «Список бактериальных названий, стоящих в номенклатуре: папка, доступная в Интернете». Int. J. Syst. Бактериол. 47 (2): 590–592. DOI : 10.1099 / 00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- Клейтон, РА; Sutton G; Hinkle PS Jr; Bult C; Поля C (1995). «Внутривидовые вариации последовательностей малых субъединиц рРНК в GenBank: почему отдельные последовательности могут неадекватно представлять прокариотические таксоны». Int. J. Syst. Бактериол. 45 (3): 595–599. DOI : 10.1099 / 00207713-45-3-595. PMID 8590690.
- Мюррей, Р.Г.; Шлейфер KH (1994). «Таксономические заметки: предложение по регистрации свойств предполагаемых таксонов прокариот». Int. J. Syst. Бактериол. 44 (1): 174–176. DOI : 10.1099 / 00207713-44-1-174. PMID 8123559.
- Винкер, S; Woese CR (1991). «Определение доменов Archaea, Bacteria и Eucarya с точки зрения характеристик малых субъединиц рибосомной РНК». Syst. Appl. Microbiol. 14 (4): 305–310. DOI : 10.1016 / s0723-2020 (11) 80303-6. PMID 11540071.
- Woese, CR; Кандлер О; Уилис М.Л. (1990). «На пути к естественной системе организмов: предложение для областей архей, бактерий и эукариев». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 87 (12): 4576–4579. Bibcode : 1990PNAS... 87.4576W. doi : 10.1073 / pnas.87.12.4576. PMC 54159. PMID 2112744.
- Ахенбах-Рихтер, Л; Woese CR (1988). «Спейсерная область рибосомного гена в архебактериях». Syst. Appl. Microbiol. 10 (3): 211–214. doi : 10.1016 / s0723-2020 (88) 80002-x. PMID 11542149.
- McGill, TJ; Юрка Дж; Собески JM; Пикетт MH; Woese CR; Фокс Г.Е. (1986). «Характерные олигонуклеотиды 16S рРНК архебактерий». Syst. Appl. Microbiol. 7 (2–3): 194–197. DOI : 10.1016 / S0723-2020 (86) 80005-4. PMID 11542064.
- Woese, CR; Gupta R; Hahn CM; Zillig W; Вт Дж (1984). «Филогенетические отношения трех серозависимых архебактерий». Syst. Appl. Microbiol. 5 : 97–105. DOI : 10.1016 / S0723-2020 (84) 80054-5. PMID 11541975.
- Woese, CR; Олсен GJ (1984). «Филогенетические отношения трех серозависимых архебактерий». Syst. Appl. Microbiol. 5 : 97–105. DOI : 10.1016 / S0723-2020 (84) 80054-5. PMID 11541975.
- Woese, CR; Fox GE (1977). «Филогенетическая структура прокариотической области: первичные царства». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 74 (11): 5088–5090. Bibcode : 1977PNAS... 74.5088W. doi : 10.1073 / pnas.74.11.5088. PMC 432104. PMID 270744.
Научные книги
Научные базы данных
Внешние ссылки
| Викискладе есть медиафайлы, связанные со страницей таксономии Crenarchaeota. |
xclvkjesodkd0riyjtokgpfdoi-s-bj9tjhitebjtr3iog-kwg-it9jhti39fjo3ir = hj3kflrpj0yu3] i09ogkij
<978-4 === !!! jpg <2>html