Барийский собор был созван и под председательством Папы Урбана II в Бари, Италия, в октябре 1098 года во время Первой Крестовый поход. В нем приняли участие 185 епископов, как католиков, так и православных.
Официальные записи его действий были утеряны, но были частично восстановлены из других записей. Иногда это преподносится как неудачная попытка справиться с Великим расколом, который начал возникать между Западной и Восточной Церковью, но это гораздо более вероятно что присутствовавшие «греческие епископы» были местными епископами южной Италии, некоторые из которых находились под властью Константинополя еще в 1071 году. Под давлением своих нормандских лордов эти Итальянские греки, похоже, приняли верховенство папы и теологию Ансельма относительно правильности использования Западной церковью пресного хлеба в Евхаристии и включения в него пункта filioque к рассказу Никейского символа веры о шествии Святого Духа. Совет также осудил Вильгельма II Английского, который заставил Ансельма, реформаторского архиепископа из Кентерберийского, в изгнание. Эдмер считает, что Ансельм удержал папу от отлучения от церкви, хотя другие приписывают политический характер Урбана.
Никаких высокопоставленных православных богословов того времени, таких как Феофилакт Охридский, похоже, не было..
В совете доминировали его католические члены и предали анафеме тех, кто не согласился с позицией Ансельма по filioque и использованию пресный хлеб в Евхаристии. Это не повлияло на воссоединение греческой и римской церквей, но, похоже, успешно стандартизировало церковную практику в нормандских землях южной Италии.