Подписаться

Сигнал упаковки коронавируса

Последняя правка сделана 2021-05-15 12:57:41 Править
Регуляторный элемент в коронавирусах
Упаковка коронавируса сигнал
Вторичная структура консенсуса RF00182.png Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности Corona_package
Идентификаторы
СимволCorona_package
Rfam RF00182
Другие данные
РНК типCis-reg
Домен (ы) Вирусы
SO 0000233
PDB структурыPDBe

The Сигнал упаковки коронавируса представляет собой консервативный цис-регуляторный элемент, обнаруженный в бетакоронавирусе (входит в подсемейство Coronavirus из вирусов ). Он играет важную роль в регулировании упаковки вирусного генома в капсид. В рамках жизненного цикла вируса внутри инфицированной клетки вирусный геном связывается с вирусными белками и объединяется в новые инфекционные потомки вирусов. Этот процесс называется упаковкой и жизненно важен для репликации вируса.

Сигнал упаковки обнаруживается в геноме положительно-смысловой одноцепочечной РНК. Он взаимодействует с вирусными белками (M и N) и обеспечивает избирательную упаковку вирусной РНК в вирионы.

Этот элемент РНК консервативен в Embecovirus (ранее известный как линия A Betacoronavirus), который включает вирус гепатита мыши (MHV), коронавирус крупного рогатого скота (BCoV) и человеческие коронавирусы, такие как HCoV-HKU1 и HCoV-OC43. Примечательно, что этот элемент отсутствует в других вирусных линиях, которые развили отдельные сигналы упаковки. Например, его нет в SARS-CoV и SARS-CoV-2 (вопреки предыдущим утверждениям, которые были опровергнуты).

Сигнал упаковки имеет консервативную вторичную структуру РНК, содержащую четыре мотива внутренней петли AGC / GUAAU. Внутри вирусного генома сигнал упаковки находится в неструктурном белке 15 (nsp15) и кодирует полипептид, который находится на поверхности белка nsp15. Удаление сигнала упаковки или введение мутаций, которые нарушают его вторичную структуру, но не кодируемого пептида, приводят к потере специфичности упаковки. В то же время перемещение сигнала упаковки в другую часть генома не оказало отрицательного влияния на упаковку.

Другие семейства РНК, идентифицированные в коронавирусе, включают, элемент стимуляции сдвига рамки кадра коронавируса, коронавирусный 3 'мотив, похожий на стебель-петлю II (s2m), а также 5'- и 3' псевдоузел UTR.

См. Также

Ссылки

Внешние ссылки

Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: mail@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте