Войти
| Элемент стимуляции сдвига кадра коронавируса | |
|---|---|
 Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности Corona_FSE | |
| Идентификаторы | |
| Символ | Corona_FSE |
| Rfam | RF00507 |
| Другие данные | |
| Тип РНК | Cis-reg ; элемент сдвига рамки |
| Домен (ы) | Вирусы |
| SO | 0000233 |
| PDB структуры | PDBe |
В молекулярной биологии коронавирус сдвиг рамки элемент стимуляции - это консервативная петля-петля из РНК, обнаруженная в коронавирусах которые могут продвигать ри грудное смещение рамки. Такие молекулы РНК взаимодействуют с нижележащей областью с образованием структуры псевдоузла ; область варьируется в зависимости от вируса, но известно, что образование псевдоузла стимулирует сдвиг рамки. В классической ситуации последовательность из 32 нуклеотидов ниже стебля комплементарна части петли. В других коронавирусах, однако, другая структура петля-стебель примерно на 150 нуклеотидов ниже по течению может взаимодействовать с членами этого семейства, образуя целующиеся стержневые петли и стимулируя сдвиг рамки.
Другие семейства РНК, идентифицированные в коронавирус включает в себя мотив, подобный 3 'стебле-петле II коронавируса (s2m), сигнал упаковки коронавируса и псевдоузел 3' UTR коронавируса.
Во время белка синтеза, быстро меняющиеся условия в клетке могут вызвать рибосомную паузу. У коронавирусов это может повлиять на скорость роста и вызвать отказ от трансляции. Это освобождает рибосому от мРНК, и неполный полипептид становится мишенью для разрушения.
