Содержимое | |
---|---|
Описание | Бесплатный источник эталонных изображений для проверки совместной локализации в флуоресцентной микроскопии исследования |
Контакт | |
Авторы | Вадим Зинчук, Юн Ву, Ольга Гроссенбахер-Зинчук |
Дата выпуска | 2012 |
Доступ | |
Формат данных | Формат файлов изображений с тегами без потерь (TIFF) |
Веб-сайт | www.colocalization-benchmark.com |
Разное | |
Лицензия | Бесплатная |
Версия | 1.1.1 |
Исходный код теста колокализации (CBS ) - это бесплатная коллекция загружаемых пригодные изображения для тестирования и подтверждения степени колокализации маркеров в любых исследованиях флуоресцентной микроскопии. Колокализация - это визуальное явление, когда две представляющие интерес молекулы связаны с одними и теми же структурами в клетках и потенциально имеют общие функциональные характеристики.
CBS предоставляет исследователям справочные инструменты для проверки результатов количественного измерения колокализации. Он служит специализированной информатикой биоизображений базой данных компьютерно смоделированных изображений с точно известными (заранее заданными) значениями колокализации. Они были созданы с использованием имитации изображения алгоритма. Эти эталонные изображения можно загружать как наборы, так и отдельно. Вычисляя и сравнивая значения коэффициентов на своих изображениях с эталонными изображениями, исследователи могут подтвердить результаты количественных исследований колокализации. Использование изображений CBS было описано в ряде исследований.
Исследователи может отправлять примеры пользовательских изображений, когда эталонные изображения использовались для проверки их совместной локализации. Представленные изображения затем размещаются на сайте CBS вместе с описанием их свойств и значений коэффициентов, таких как коэффициент корреляции Пирсона (Rr), коэффициент перекрытия (R) и другие. Шаблон для отправки информации о пользовательских изображениях можно скачать с сайта CBS.