Кофактор F430

редактировать
Кофактор F430
Коэнзим F430.svg
Идентификаторы
Номер CAS
3D-модель (JSmol )
ChEBI
ChemSpider
PubChem CID
InChI
УЛЫБКИ
Свойства
Химическая формула C. 42H. 51N. 6NiO. 13
Молярная масса 906,58014
Внешний видЖелтое твердое вещество
Если не указано иное, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
Ссылки ink

F430 - это кофактор (иногда называемый коферментом) фермент метилкофермент М редуктаза (MCR). MCR катализирует реакцию EC 2.8.4.1, которая высвобождает метан на последней стадии метаногенеза :

CH. 3–S – CoM + HS – CoB → CH. 4+ CoB – S – S – CoM
Структура кофермента M (HS-CoM) Структура кофермента B (HS-CoB)

Встречается только в метаногенном Археи и анаэробные метанотрофные археи. Он встречается в относительно высоких концентрациях у архей, участвующих в обратном метаногенезе: они могут содержать до 7% по массе белка никеля.

Структура

тривиальное название кофактор F 430 был назначен в 1978 году на основании свойств желтого образца, выделенного из Methanobacterium thermoautotrophicum, который имел спектроскопический максимум. при 430 нм. Он был идентифицирован как кофактор MCR в 1982 году, и полная структура была установлена ​​с помощью рентгеновской кристаллографии и ЯМР-спектроскопии. Коэнзим F 430 содержит восстановленный порфирин в макроциклической кольцевой системе, называемой корфином. Кроме того, он обладает двумя дополнительными кольцами по сравнению со стандартным тетрапирролом (кольца AD), имеющим γ-лактамное кольцо E и кетосодержащий карбоцикл кольцо F. Это единственный природный тетрапиррол, содержащий никель, элемент, редко встречающийся в биологических системах.

Биосинтез
уропорфириноген III дигидрозирогидрохлорин сирогидрохлорин

биосинтез строится из уропорфириногена III, прародителя всех природных тетрапирролов, включая хлорофилл, витамин B 12, фикобилины, сирогем, гем и гем d 1. Он превращается в сирогидрохлорин через дигидрозирогидрохлорин. Введение никеля в этот тетрапиррол катализируется в реакции EC 4.99.1.11 той же хелатазой, CbiX, которая вводит кобальт в биосинтез кобаламина, что дает никель (II) -сирогидрохлорин.

Никель (II) -сирогидрохлорин a, c-диамид превращается в seco-F430

АТФ-зависимый (CfbE) затем превращает ацетатную сторону a и c цепи до ацетамида в реакциях EC 6.3.5.12, образуя никель (II) -сирогидрохлорин а, с-диамид. Последовательность двух амидий случайна. Двухкомпонентный комплекс (CfbCD) осуществляет 6-электронное и 7-протонное восстановление кольцевой системы в реакции EC 6.3.3.7 с образованием 15,17-секо-F 430 -17-кислотное (секо-F 430) промежуточное соединение. Восстановление включает гидролиз АТФ, и электроны передаются через два центра 4Fe-4S. На последней стадии кетосодержащее карбоциклическое кольцо F образуется АТФ-зависимым ферментом (CfbB) в реакции EC 6.4.1.9, образуя кофермент F 430. Этот фермент представляет собой MurF-подобную лигазу, обнаруженную в биосинтезе пептидогликана.

Ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-15 13:52:55
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте